More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0562 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000313  arylsulfatase  63.47 
 
 
515 aa  636    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000311  arylsulfatase  82.97 
 
 
508 aa  881    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.63107  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3391  sulfatase  98.42 
 
 
505 aa  1038    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0562  sulfatase  100 
 
 
505 aa  1046    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0419  sulfatase  62.92 
 
 
513 aa  675    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2985  sulfatase family protein  60 
 
 
502 aa  604  1.0000000000000001e-171  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0283878  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8070  sulfatase  60.17 
 
 
557 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.883043  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1195  sulfatase  60.59 
 
 
552 aa  598  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.031071  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3411  sulfatase  61.81 
 
 
526 aa  598  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.420036 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5118  sulfatase  57.8 
 
 
554 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3081  arylsulfatase  59.24 
 
 
496 aa  579  1e-164  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6900  sulfatase  57.42 
 
 
545 aa  578  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0879565  normal  0.386644 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2893  sulfatase  59.58 
 
 
567 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269953  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3051  sulfatase  59.29 
 
 
522 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4629  sulfatase  58.79 
 
 
496 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.284621  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5416  arylsulfatase-like enzyme  58.33 
 
 
579 aa  569  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.443584 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3791  sulfatase  57.14 
 
 
548 aa  570  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.425915  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1202  sulfatase  57.02 
 
 
547 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191965 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003601  arylsulfatase  55.47 
 
 
521 aa  555  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5142  sulfatase  57.98 
 
 
544 aa  553  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3111  arylsulfatase precursor  54 
 
 
533 aa  551  1e-156  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.513855  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3123  sulfatase  53.01 
 
 
549 aa  550  1e-155  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0660  sulfatase family protein  53.66 
 
 
525 aa  548  1e-154  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.61402  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2132  putative arylsulfatase  56.68 
 
 
560 aa  542  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.242707  normal  0.0122075 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2984  sulfatase family protein  54.19 
 
 
512 aa  539  9.999999999999999e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00336122  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2095  sulfatase  55.08 
 
 
512 aa  538  1e-151  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0111977  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0789  sulfatase  53.71 
 
 
525 aa  522  1e-147  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0797845  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1142  sulfatase  53.36 
 
 
555 aa  519  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3805  sulfatase  54.04 
 
 
552 aa  509  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2983  putative arylsulfatase  52.46 
 
 
522 aa  505  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0960108  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4113  sulfatase  51.02 
 
 
514 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.446861  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4188  sulfatase  51.02 
 
 
514 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3032  sulfatase family protein  52.67 
 
 
522 aa  500  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4344  sulfatase  50.41 
 
 
505 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712757  normal  0.252658 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1735  sulfatase  46.53 
 
 
508 aa  456  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2371  sulfatase  46.25 
 
 
510 aa  453  1.0000000000000001e-126  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.852311  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3990  sulfatase family protein  44.01 
 
 
517 aa  430  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0526  sulfatase  47.99 
 
 
564 aa  430  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0357  arylsulfatase  44.88 
 
 
512 aa  424  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.340259  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4569  arylsulfatase  43.19 
 
 
542 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.149859  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1946  sulfatase  43.56 
 
 
546 aa  395  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3142  sulfatase  32.14 
 
 
524 aa  243  6e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.854728  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6904  sulfatase  34.39 
 
 
556 aa  234  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1030  sulfatase  30.02 
 
 
470 aa  232  9e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1647  sulfatase  33.46 
 
 
590 aa  231  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.425588  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6751  sulfatase  34.28 
 
 
569 aa  230  5e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2939  sulfatase  33.54 
 
 
556 aa  229  7e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1239  sulfatase  33.97 
 
 
554 aa  228  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342863  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5768  sulfatase  34.55 
 
 
555 aa  224  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0793  sulfatase  33.21 
 
 
569 aa  223  9e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0527752  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4178  sulfatase  32.99 
 
 
551 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0425413  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5237  arylsulfatase  32.79 
 
 
551 aa  218  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0995003  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03676  acrylsulfatase-like enzyme  32.79 
 
 
551 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.176732  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4166  arylsulfatase  32.79 
 
 
551 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00523411  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03625  hypothetical protein  32.79 
 
 
551 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.173568  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  33.49 
 
 
486 aa  216  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2976  sulfatase  32.8 
 
 
496 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6681  sulfatase  32.95 
 
 
561 aa  206  9e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  35.47 
 
 
462 aa  205  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3115  cerebroside-sulfatase  29.31 
 
 
440 aa  204  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100154  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5555  sulfatase  31.59 
 
 
561 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708907  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  32.7 
 
 
466 aa  189  1e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3913  sulfatase  31.42 
 
 
522 aa  185  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.656698  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  28.9 
 
 
480 aa  182  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5097  sulfatase  28.37 
 
 
550 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.551425  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  31.14 
 
 
506 aa  171  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  31.1 
 
 
458 aa  163  6e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  31.28 
 
 
472 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  29.1 
 
 
440 aa  158  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  32.63 
 
 
497 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  32.16 
 
 
497 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  33.76 
 
 
497 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1568  sulfatase  32.14 
 
 
638 aa  157  6e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0365787  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  31.55 
 
 
497 aa  156  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  31.55 
 
 
497 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  30.55 
 
 
487 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  29.75 
 
 
471 aa  155  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2890  sulfatase  29.41 
 
 
523 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  32.72 
 
 
497 aa  150  7e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  28.95 
 
 
440 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  28.91 
 
 
470 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  30.91 
 
 
501 aa  147  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4996  sulfatase  29.79 
 
 
506 aa  143  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.317023 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  29.89 
 
 
491 aa  143  9e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3640  sulfatase  29.48 
 
 
520 aa  141  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  31.37 
 
 
500 aa  140  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  29.16 
 
 
486 aa  140  7e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  28.87 
 
 
553 aa  139  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0121  sulfatase  28.67 
 
 
526 aa  138  2e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  28.68 
 
 
491 aa  138  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  33.05 
 
 
457 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  30.21 
 
 
462 aa  137  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0354  sulfatase  28.64 
 
 
493 aa  137  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  27.74 
 
 
452 aa  137  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  28.17 
 
 
497 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  28.71 
 
 
474 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  29.23 
 
 
453 aa  134  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  30.14 
 
 
488 aa  133  6.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3374  sulfatase  29.25 
 
 
507 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  26.94 
 
 
482 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>