More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1195 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_3111  arylsulfatase precursor  61.86 
 
 
533 aa  674    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.513855  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3051  sulfatase  69.4 
 
 
522 aa  726    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1202  sulfatase  61.17 
 
 
547 aa  700    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191965 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2893  sulfatase  67.41 
 
 
567 aa  698    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269953  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3081  arylsulfatase  67.98 
 
 
496 aa  703    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2095  sulfatase  63.64 
 
 
512 aa  665    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0111977  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1195  sulfatase  100 
 
 
552 aa  1151    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.031071  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2132  putative arylsulfatase  63.29 
 
 
560 aa  657    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.242707  normal  0.0122075 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5416  arylsulfatase-like enzyme  66.67 
 
 
579 aa  699    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.443584 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000313  arylsulfatase  72.2 
 
 
515 aa  773    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4113  sulfatase  62.15 
 
 
514 aa  653    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.446861  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5142  sulfatase  67.48 
 
 
544 aa  705    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3411  sulfatase  74.64 
 
 
526 aa  779    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.420036 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4188  sulfatase  62.15 
 
 
514 aa  653    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4629  sulfatase  64.9 
 
 
496 aa  668    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.284621  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8070  sulfatase  88.81 
 
 
557 aa  996    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.883043  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4344  sulfatase  62.12 
 
 
505 aa  648    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712757  normal  0.252658 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1142  sulfatase  61.34 
 
 
555 aa  657    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3123  sulfatase  58.47 
 
 
549 aa  639    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5118  sulfatase  59.08 
 
 
554 aa  641    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3791  sulfatase  57.95 
 
 
548 aa  639    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.425915  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2984  sulfatase family protein  55.66 
 
 
512 aa  626  1e-178  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00336122  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6900  sulfatase  57.54 
 
 
545 aa  625  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0879565  normal  0.386644 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2985  sulfatase family protein  60.81 
 
 
502 aa  613  9.999999999999999e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0283878  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000311  arylsulfatase  60.81 
 
 
508 aa  605  9.999999999999999e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.63107  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0562  sulfatase  60.59 
 
 
505 aa  600  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3391  sulfatase  60.17 
 
 
505 aa  595  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0789  sulfatase  58.35 
 
 
525 aa  591  1e-167  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0797845  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0660  sulfatase family protein  58.56 
 
 
525 aa  587  1e-166  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.61402  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0419  sulfatase  56.67 
 
 
513 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3805  sulfatase  53.65 
 
 
552 aa  553  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003601  arylsulfatase  51.94 
 
 
521 aa  531  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2983  putative arylsulfatase  52.57 
 
 
522 aa  518  1.0000000000000001e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0960108  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3032  sulfatase family protein  51.67 
 
 
522 aa  502  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2371  sulfatase  48.96 
 
 
510 aa  476  1e-133  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.852311  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1735  sulfatase  47.28 
 
 
508 aa  475  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0526  sulfatase  44.82 
 
 
564 aa  443  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0357  arylsulfatase  42.67 
 
 
512 aa  418  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.340259  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1946  sulfatase  43.01 
 
 
546 aa  406  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3990  sulfatase family protein  43.18 
 
 
517 aa  396  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4569  arylsulfatase  40.88 
 
 
542 aa  385  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.149859  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2939  sulfatase  34.95 
 
 
556 aa  250  5e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6751  sulfatase  33.82 
 
 
569 aa  242  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0793  sulfatase  33.21 
 
 
569 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0527752  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1239  sulfatase  32.98 
 
 
554 aa  232  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342863  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5768  sulfatase  33.58 
 
 
555 aa  231  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  34.91 
 
 
462 aa  228  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6904  sulfatase  32.7 
 
 
556 aa  226  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  32.7 
 
 
486 aa  223  6e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1647  sulfatase  32.06 
 
 
590 aa  223  9e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.425588  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1030  sulfatase  32.14 
 
 
470 aa  218  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6681  sulfatase  31.54 
 
 
561 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5555  sulfatase  30.61 
 
 
561 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708907  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3115  cerebroside-sulfatase  30.84 
 
 
440 aa  203  8e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100154  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3142  sulfatase  29.02 
 
 
524 aa  202  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.854728  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  30.57 
 
 
480 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2976  sulfatase  30.75 
 
 
496 aa  197  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03676  acrylsulfatase-like enzyme  30.26 
 
 
551 aa  187  5e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.176732  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03625  hypothetical protein  30.26 
 
 
551 aa  187  5e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.173568  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5237  arylsulfatase  30 
 
 
551 aa  187  5e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0995003  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4166  arylsulfatase  30.26 
 
 
551 aa  187  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00523411  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4178  sulfatase  30 
 
 
551 aa  186  8e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0425413  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5097  sulfatase  27.69 
 
 
550 aa  169  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.551425  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  29.48 
 
 
458 aa  167  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  31.14 
 
 
506 aa  158  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  28.85 
 
 
471 aa  157  6e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  29.87 
 
 
482 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  28.81 
 
 
466 aa  153  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  28.74 
 
 
440 aa  151  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  29.57 
 
 
487 aa  150  5e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  29.04 
 
 
457 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  30.49 
 
 
452 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3640  sulfatase  29.76 
 
 
520 aa  147  6e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1568  sulfatase  30.79 
 
 
638 aa  146  8.000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0365787  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  28.6 
 
 
491 aa  146  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  27.89 
 
 
497 aa  144  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  28.6 
 
 
497 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  27.17 
 
 
472 aa  143  7e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  27.16 
 
 
486 aa  143  8e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2890  sulfatase  29.05 
 
 
523 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  28.69 
 
 
553 aa  142  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  26.48 
 
 
501 aa  141  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  28.14 
 
 
471 aa  140  7.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  26.93 
 
 
497 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  26.93 
 
 
497 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  26.93 
 
 
497 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  26.93 
 
 
497 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  26.42 
 
 
453 aa  138  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  28.42 
 
 
500 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  27.75 
 
 
497 aa  136  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  26.69 
 
 
440 aa  135  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  28.06 
 
 
481 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  28.4 
 
 
479 aa  135  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  31.25 
 
 
462 aa  134  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1327  sulfatase  26.56 
 
 
480 aa  133  7.999999999999999e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.499609  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  27.59 
 
 
488 aa  133  7.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  27.05 
 
 
470 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3296  sulfatase  26.68 
 
 
460 aa  131  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0308085  hitchhiker  0.000582836 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0354  sulfatase  26.48 
 
 
493 aa  131  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  29.31 
 
 
457 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.132093 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>