More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3051 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1195  sulfatase  69.4 
 
 		 552 aa  726    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.031071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000313  arylsulfatase  65.73 
 
 		 515 aa  689    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2893  sulfatase  79.14 
 
 		 567 aa  829    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269953  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3081  arylsulfatase  64.17 
 
 		 496 aa  642    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3051  sulfatase  100 
 
 		 522 aa  1088    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2132  putative arylsulfatase  72.5 
 
 		 560 aa  759    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.242707  normal  0.0122075 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5416  arylsulfatase-like enzyme  77.17 
 
 		 579 aa  822    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.443584 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8070  sulfatase  68.79 
 
 		 557 aa  720    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.883043  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3411  sulfatase  69.53 
 
 		 526 aa  723    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.420036 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4629  sulfatase  62.63 
 
 		 496 aa  637    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.284621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5142  sulfatase  75.76 
 
 		 544 aa  795    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2095  sulfatase  62.1 
 
 		 512 aa  629  1e-179  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0111977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1202  sulfatase  60.5 
 
 		 547 aa  622  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191965 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2984  sulfatase family protein  59.38 
 
 		 512 aa  608  9.999999999999999e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00336122  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3111  arylsulfatase precursor  57.42 
 
 		 533 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.513855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4113  sulfatase  56.8 
 
 		 514 aa  599  1e-170  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.446861  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4188  sulfatase  56.8 
 
 		 514 aa  599  1e-170  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0660  sulfatase family protein  59.8 
 
 		 525 aa  594  1e-168  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.61402  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3791  sulfatase  58.47 
 
 		 548 aa  592  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.425915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4344  sulfatase  56.06 
 
 		 505 aa  589  1e-167  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712757  normal  0.252658 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000311  arylsulfatase  59.8 
 
 		 508 aa  587  1e-166  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.63107  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2985  sulfatase family protein  59.28 
 
 		 502 aa  583  1.0000000000000001e-165  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0283878  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3391  sulfatase  57.88 
 
 		 505 aa  580  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0562  sulfatase  57.88 
 
 		 505 aa  580  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5118  sulfatase  56.13 
 
 		 554 aa  580  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1142  sulfatase  53.46 
 
 		 555 aa  579  1e-164  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6900  sulfatase  55.43 
 
 		 545 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0879565  normal  0.386644 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3123  sulfatase  56.3 
 
 		 549 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0789  sulfatase  55.26 
 
 		 525 aa  562  1.0000000000000001e-159  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0797845  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0419  sulfatase  52.75 
 
 		 513 aa  543  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003601  arylsulfatase  50.97 
 
 		 521 aa  518  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3805  sulfatase  53.5 
 
 		 552 aa  505  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2983  putative arylsulfatase  52.61 
 
 		 522 aa  497  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0960108  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3032  sulfatase family protein  52.58 
 
 		 522 aa  490  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2371  sulfatase  47.49 
 
 		 510 aa  473  1e-132  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.852311  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0526  sulfatase  48.14 
 
 		 564 aa  449  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1735  sulfatase  44.95 
 
 		 508 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0357  arylsulfatase  43.52 
 
 		 512 aa  412  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.340259  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1946  sulfatase  43.53 
 
 		 546 aa  410  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3990  sulfatase family protein  40.53 
 
 		 517 aa  389  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4569  arylsulfatase  42.5 
 
 		 542 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.149859  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2939  sulfatase  33.6 
 
 		 556 aa  236  8e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5768  sulfatase  33.15 
 
 		 555 aa  229  8e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1239  sulfatase  33.08 
 
 		 554 aa  226  7e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342863  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6751  sulfatase  33.77 
 
 		 569 aa  226  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6904  sulfatase  32.08 
 
 		 556 aa  226  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1030  sulfatase  29.55 
 
 		 470 aa  223  4.9999999999999996e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1647  sulfatase  32.49 
 
 		 590 aa  223  6e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.425588  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6681  sulfatase  33.72 
 
 		 561 aa  220  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0793  sulfatase  32.26 
 
 		 569 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0527752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  32.29 
 
 		 486 aa  214  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5555  sulfatase  32.18 
 
 		 561 aa  213  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  34.51 
 
 		 462 aa  212  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2976  sulfatase  32.56 
 
 		 496 aa  206  9e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3142  sulfatase  31.57 
 
 		 524 aa  202  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.854728  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3115  cerebroside-sulfatase  30.05 
 
 		 440 aa  201  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  32.31 
 
 		 480 aa  197  5.000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  31.81 
 
 		 466 aa  189  1e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4178  sulfatase  32.21 
 
 		 551 aa  187  5e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0425413  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03676  acrylsulfatase-like enzyme  31.93 
 
 		 551 aa  186  9e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.176732  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5237  arylsulfatase  31.99 
 
 		 551 aa  186  9e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0995003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03625  hypothetical protein  31.93 
 
 		 551 aa  186  9e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.173568  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4166  arylsulfatase  31.93 
 
 		 551 aa  186  9e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00523411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  30.32 
 
 		 458 aa  176  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5097  sulfatase  28.93 
 
 		 550 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.551425  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  30.65 
 
 		 506 aa  172  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  30.79 
 
 		 500 aa  164  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  28.44 
 
 		 472 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  28.54 
 
 		 497 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  27.29 
 
 		 553 aa  161  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  29.44 
 
 		 452 aa  162  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  27.81 
 
 		 497 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  27.96 
 
 		 440 aa  157  4e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  27.61 
 
 		 497 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  27.61 
 
 		 497 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  27.61 
 
 		 497 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  27.29 
 
 		 440 aa  157  6e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3913  sulfatase  28.74 
 
 		 522 aa  155  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.656698  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  28.35 
 
 		 482 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  30.74 
 
 		 457 aa  153  7e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  32.03 
 
 		 462 aa  151  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  28.3 
 
 		 497 aa  151  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  27.85 
 
 		 471 aa  150  7e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0354  sulfatase  28.03 
 
 		 493 aa  150  7e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  28.7 
 
 		 487 aa  150  8e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  27.48 
 
 		 501 aa  149  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  27.37 
 
 		 543 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  28.82 
 
 		 497 aa  148  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1568  sulfatase  29.79 
 
 		 638 aa  142  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0365787  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  27.06 
 
 		 453 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  27.4 
 
 		 486 aa  140  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  25.91 
 
 		 488 aa  140  4.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3640  sulfatase  27.81 
 
 		 520 aa  139  8.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  28.57 
 
 		 470 aa  137  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  27.39 
 
 		 471 aa  137  5e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  28.25 
 
 		 517 aa  137  7.000000000000001e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3296  sulfatase  28.87 
 
 		 460 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0308085  hitchhiker  0.000582836 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  28.78 
 
 		 457 aa  136  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  25.47 
 
 		 548 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  28.83 
 
 		 491 aa  135  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>