More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0829 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0829  sulfatase  100 
 
 		 510 aa  1051    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0850119  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2890  sulfatase  31.91 
 
 		 523 aa  224  4e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4996  sulfatase  31.44 
 
 		 506 aa  218  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.317023 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3374  sulfatase  32.21 
 
 		 507 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0354  sulfatase  31.25 
 
 		 493 aa  213  5.999999999999999e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3913  sulfatase  33.47 
 
 		 522 aa  212  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.656698  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2849  sulfatase  31.05 
 
 		 503 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000585259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3047  sulfatase  30.66 
 
 		 503 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0209579 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3660  sulfatase  31.4 
 
 		 523 aa  196  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000523129  normal  0.837026 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3640  sulfatase  31.26 
 
 		 520 aa  194  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4261  sulfatase  30.56 
 
 		 506 aa  189  9e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.362858 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1776  sulfatase  30.49 
 
 		 520 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.791288 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0440  sulfatase  30.04 
 
 		 505 aa  182  2e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0138449  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1842  sulfatase  30.82 
 
 		 526 aa  181  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0121  sulfatase  30.02 
 
 		 526 aa  180  4.999999999999999e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0819  sulfatase  31.43 
 
 		 523 aa  179  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  29.64 
 
 		 453 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  29.55 
 
 		 457 aa  161  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  27.99 
 
 		 440 aa  150  8e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  29.24 
 
 		 462 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  27.15 
 
 		 501 aa  149  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  28.79 
 
 		 481 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  27.39 
 
 		 482 aa  148  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  27.06 
 
 		 474 aa  147  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  29.51 
 
 		 471 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2674  sulfatase  29.03 
 
 		 559 aa  147  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  28.04 
 
 		 440 aa  145  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  30.25 
 
 		 486 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  26.61 
 
 		 453 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  26.67 
 
 		 497 aa  144  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  26.67 
 
 		 497 aa  143  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  26.67 
 
 		 497 aa  143  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  26.67 
 
 		 497 aa  143  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  26.75 
 
 		 442 aa  143  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1131  sulfatase  30.34 
 
 		 551 aa  142  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  25.98 
 
 		 497 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  27.05 
 
 		 506 aa  140  6e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  27.72 
 
 		 466 aa  139  7.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  28.72 
 
 		 497 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  27.31 
 
 		 479 aa  139  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  26.48 
 
 		 497 aa  139  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0491  sulfatase  27.39 
 
 		 500 aa  138  2e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.244971 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  27.16 
 
 		 462 aa  138  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  28.43 
 
 		 631 aa  138  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  27 
 
 		 486 aa  137  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  26.33 
 
 		 553 aa  137  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  29.53 
 
 		 491 aa  136  8e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  27.29 
 
 		 488 aa  136  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  28.83 
 
 		 523 aa  136  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5404  sulfatase  26.36 
 
 		 457 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268396  normal  0.742595 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3577  sulfatase  26.12 
 
 		 438 aa  135  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176651  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  26.97 
 
 		 487 aa  134  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  28.47 
 
 		 536 aa  134  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  27.71 
 
 		 500 aa  133  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2294  sulfatase  25.93 
 
 		 442 aa  133  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434198  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  26.85 
 
 		 472 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  27.56 
 
 		 495 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3373  sulfatase  29.8 
 
 		 481 aa  131  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  27.59 
 
 		 480 aa  128  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  26.36 
 
 		 470 aa  127  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  26.69 
 
 		 468 aa  127  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3115  cerebroside-sulfatase  28.2 
 
 		 440 aa  126  8.000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  27.18 
 
 		 548 aa  125  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  26.85 
 
 		 539 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  26.58 
 
 		 491 aa  124  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  25.93 
 
 		 467 aa  124  6e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  25.83 
 
 		 489 aa  123  9e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  26.82 
 
 		 500 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  25.98 
 
 		 492 aa  121  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3651  sulfatase  26.05 
 
 		 483 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000643806  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  27.63 
 
 		 510 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1030  sulfatase  27.86 
 
 		 470 aa  118  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3366  sulfatase  25.57 
 
 		 535 aa  117  5e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.897843 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2657  sulfatase  28.15 
 
 		 519 aa  117  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0931  sulfatase  25.57 
 
 		 535 aa  117  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3805  sulfatase  26.4 
 
 		 552 aa  117  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0984  sulfatase  25.57 
 
 		 535 aa  117  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2015  sulfatase  25.29 
 
 		 497 aa  117  6.9999999999999995e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.295257  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  26.58 
 
 		 458 aa  116  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1327  sulfatase  25.44 
 
 		 480 aa  116  8.999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.499609  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  27.64 
 
 		 457 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3296  sulfatase  27.15 
 
 		 460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0308085  hitchhiker  0.000582836 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  26.36 
 
 		 484 aa  114  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6904  sulfatase  27.31 
 
 		 556 aa  114  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1202  sulfatase  26.69 
 
 		 547 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191965 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2292  sulfatase  24.95 
 
 		 489 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3081  arylsulfatase  25.67 
 
 		 496 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  27.29 
 
 		 543 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5768  sulfatase  29.17 
 
 		 555 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1239  sulfatase  27.12 
 
 		 554 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342863  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3990  sulfatase family protein  27.4 
 
 		 517 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0820  sulfatase  26.34 
 
 		 627 aa  111  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2371  sulfatase  27.21 
 
 		 510 aa  111  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.852311  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  25.59 
 
 		 465 aa  110  5e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  23.52 
 
 		 452 aa  110  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3985  sulfatase  28.78 
 
 		 478 aa  110  7.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4629  sulfatase  25.68 
 
 		 496 aa  110  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.284621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0793  sulfatase  27.91 
 
 		 569 aa  108  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0527752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000311  arylsulfatase  25.28 
 
 		 508 aa  108  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.63107  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1735  sulfatase  29.87 
 
 		 508 aa  108  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>