More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1879 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1879  sulfatase  100 
 
 
462 aa  955    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  36.07 
 
 
490 aa  230  5e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  31.26 
 
 
510 aa  207  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  32.67 
 
 
517 aa  207  4e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3650  sulfatase  33.05 
 
 
482 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127194  decreased coverage  0.00847064 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3662  sulfatase  31.28 
 
 
637 aa  196  9e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.33998  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  33.41 
 
 
471 aa  190  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  33.89 
 
 
631 aa  190  4e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0997  sulfatase  32.12 
 
 
517 aa  188  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224171  normal  0.0910854 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2015  sulfatase  30.92 
 
 
497 aa  185  1.0000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.295257  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0583  sulfatase  31.71 
 
 
522 aa  185  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  30.28 
 
 
452 aa  183  7e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3390  sulfatase  30.26 
 
 
513 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0663726  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  30.09 
 
 
470 aa  181  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3985  sulfatase  30.85 
 
 
478 aa  179  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135566  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  32.8 
 
 
457 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1755  sulfatase  29.96 
 
 
562 aa  173  6.999999999999999e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  30.02 
 
 
489 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  30.36 
 
 
487 aa  172  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  31.69 
 
 
484 aa  172  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  30.41 
 
 
465 aa  171  3e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1655  sulfatase  29.82 
 
 
554 aa  166  5.9999999999999996e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.789399  normal  0.0842498 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  28.92 
 
 
500 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  28.95 
 
 
467 aa  163  6e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  29.02 
 
 
453 aa  162  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  28.48 
 
 
492 aa  159  7e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  28.77 
 
 
479 aa  159  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  30.02 
 
 
481 aa  158  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2725  sulfatase  27.9 
 
 
724 aa  158  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0744828  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  27.65 
 
 
453 aa  156  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  29 
 
 
470 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2674  sulfatase  28.04 
 
 
559 aa  154  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  29.94 
 
 
471 aa  152  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3296  sulfatase  28.11 
 
 
460 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0308085  hitchhiker  0.000582836 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  29.68 
 
 
468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  29.65 
 
 
491 aa  148  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  29.04 
 
 
474 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  28.92 
 
 
497 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  29.04 
 
 
466 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  29 
 
 
482 aa  146  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  28.4 
 
 
536 aa  146  7.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  27.35 
 
 
442 aa  142  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  28 
 
 
501 aa  141  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  30.41 
 
 
472 aa  139  7e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  29.91 
 
 
486 aa  139  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  27.57 
 
 
497 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  27.65 
 
 
523 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  26.59 
 
 
495 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  28.07 
 
 
553 aa  136  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  28.19 
 
 
506 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0491  sulfatase  26.45 
 
 
500 aa  134  3e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.244971 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1131  sulfatase  27.48 
 
 
551 aa  134  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  26.51 
 
 
497 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2292  sulfatase  27.78 
 
 
489 aa  133  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3651  sulfatase  25.05 
 
 
483 aa  133  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000643806  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  30.14 
 
 
458 aa  133  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  26.51 
 
 
497 aa  133  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  27.39 
 
 
500 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  26.45 
 
 
497 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  26.45 
 
 
497 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  27.41 
 
 
457 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  25.43 
 
 
440 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1516  sulfatase  27.52 
 
 
553 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  28.02 
 
 
543 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  28.36 
 
 
462 aa  131  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2294  sulfatase  28.83 
 
 
442 aa  131  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434198  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  28.26 
 
 
462 aa  130  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2695  sulfatase  29.72 
 
 
486 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000809096  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  27.63 
 
 
539 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003601  arylsulfatase  27.96 
 
 
521 aa  128  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  26.42 
 
 
526 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2371  sulfatase  27.73 
 
 
510 aa  127  5e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.852311  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1327  sulfatase  26.79 
 
 
480 aa  126  6e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.499609  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  26.8 
 
 
480 aa  127  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1568  sulfatase  28.31 
 
 
638 aa  126  7e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0365787  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2657  sulfatase  27.75 
 
 
519 aa  124  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1306  sulfatase  25.43 
 
 
498 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  25.88 
 
 
497 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1700  sulfatase  28.1 
 
 
479 aa  124  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5404  sulfatase  26.76 
 
 
457 aa  123  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268396  normal  0.742595 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  24.89 
 
 
537 aa  123  8e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  26.44 
 
 
440 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1780  sulfatase  29.2 
 
 
481 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3110  sulfatase  25.88 
 
 
492 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2250  sulfatase  28.82 
 
 
478 aa  121  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5003  sulfatase  25.69 
 
 
533 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0354  sulfatase  27.31 
 
 
493 aa  120  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  26.71 
 
 
486 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  25.89 
 
 
548 aa  120  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3411  sulfatase  26.12 
 
 
526 aa  120  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.420036 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3577  sulfatase  27.17 
 
 
438 aa  120  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176651  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2014  sulfatase  25.14 
 
 
596 aa  119  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124362  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3913  sulfatase  26.12 
 
 
522 aa  119  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.656698  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1030  sulfatase  27.5 
 
 
470 aa  119  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3805  sulfatase  28.22 
 
 
552 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01110  arylsulfatase A family protein  28.75 
 
 
480 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0820  sulfatase  25.32 
 
 
627 aa  117  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3373  sulfatase  28.26 
 
 
481 aa  118  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4652  sulfatase  27.5 
 
 
551 aa  117  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1647  sulfatase  28.35 
 
 
590 aa  118  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.425588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>