More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2695 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_2695  sulfatase  100 
 
 
486 aa  1011    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000809096  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1780  sulfatase  46.44 
 
 
481 aa  396  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1841  sulfatase  35.1 
 
 
554 aa  240  5e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4179  sulfatase  33.19 
 
 
514 aa  226  6e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.10978 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2520  sulfatase  34.19 
 
 
607 aa  209  9e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.541987  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3336  sulfatase  33.72 
 
 
482 aa  202  8e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.990519  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2626  sulfatase  32.67 
 
 
624 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.342273  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4597  sulfatase  28.81 
 
 
614 aa  199  7.999999999999999e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2367  sulfatase family protein  30.67 
 
 
558 aa  198  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158836  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0798  sulfatase  30.18 
 
 
518 aa  197  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0822937  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2349  sulfatase  33.33 
 
 
437 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00689032  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2826  sulfatase  30 
 
 
500 aa  196  9e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.250394 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1566  sulfatase  32.63 
 
 
630 aa  194  4e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.145604  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5209  sulfatase  30.41 
 
 
603 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.283658  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5650  sulfatase  30.41 
 
 
603 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.372268  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3825  sulfatase  29.39 
 
 
451 aa  188  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3657  sulfatase  32.29 
 
 
494 aa  186  7e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000376885  normal  0.0602445 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1562  sulfatase  33.26 
 
 
477 aa  184  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0390  sulfatase  33.11 
 
 
465 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0399  sulfatase  33.11 
 
 
465 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.603146 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0378  sulfatase  33.11 
 
 
465 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0510065  normal  0.447114 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0440  sulfatase  28.94 
 
 
431 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0762  sulfatase  30.8 
 
 
576 aa  176  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.378263  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10303  sulfatase  31.7 
 
 
465 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000455468  normal  0.448256 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  28.23 
 
 
497 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  29.63 
 
 
500 aa  164  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  28.7 
 
 
497 aa  163  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3375  sulfatase  28.87 
 
 
474 aa  163  8.000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  28.7 
 
 
497 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  28.48 
 
 
497 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  28.48 
 
 
497 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  30.39 
 
 
481 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  30.35 
 
 
452 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3398  sulfatase  29.03 
 
 
524 aa  157  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.145395  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  29.79 
 
 
468 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  30 
 
 
479 aa  156  7e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  27.35 
 
 
537 aa  156  8e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  28.71 
 
 
501 aa  155  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  27.13 
 
 
535 aa  155  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  28.45 
 
 
487 aa  154  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  28.04 
 
 
490 aa  154  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  29.82 
 
 
466 aa  153  5.9999999999999996e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2763  sulfatase  28.03 
 
 
478 aa  152  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.449052  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  28.18 
 
 
474 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2434  sulfatase  25.96 
 
 
564 aa  152  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  29.03 
 
 
497 aa  151  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  28.63 
 
 
474 aa  150  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  28.44 
 
 
453 aa  150  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  30.53 
 
 
495 aa  150  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  32.49 
 
 
458 aa  149  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3166  sulfatase  26.02 
 
 
482 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2233  sulfatase  25.93 
 
 
511 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01140  arylsulfatase A family protein  27.16 
 
 
483 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  28.4 
 
 
631 aa  148  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  28.5 
 
 
462 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2052  sulfatase  26.12 
 
 
543 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430392  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  27.83 
 
 
489 aa  147  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2657  sulfatase  27.16 
 
 
519 aa  148  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  27.99 
 
 
457 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1327  sulfatase  27.43 
 
 
480 aa  147  5e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.499609  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1516  sulfatase  29.95 
 
 
553 aa  146  9e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  30.29 
 
 
440 aa  145  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0122  sulfatase  28.02 
 
 
458 aa  145  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  27.42 
 
 
488 aa  142  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  32.26 
 
 
442 aa  141  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  26.55 
 
 
517 aa  141  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0764  sulfatase  27.31 
 
 
559 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.726055  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  26.85 
 
 
553 aa  140  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3181  sulfatase  27.84 
 
 
523 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0151  sulfatase  26.33 
 
 
473 aa  139  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.110259  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  30.28 
 
 
471 aa  138  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  28.72 
 
 
453 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  28.74 
 
 
511 aa  138  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  25.68 
 
 
465 aa  137  3.0000000000000003e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  27.93 
 
 
480 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  27.68 
 
 
471 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3985  sulfatase  27.72 
 
 
478 aa  138  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135566  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5404  sulfatase  29.57 
 
 
457 aa  137  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268396  normal  0.742595 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1354  sulfatase  29.55 
 
 
621 aa  137  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3662  sulfatase  28.04 
 
 
637 aa  137  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.33998  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2234  sulfatase  25.79 
 
 
506 aa  137  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2371  sulfatase  29.86 
 
 
510 aa  137  6.0000000000000005e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.852311  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  28.2 
 
 
470 aa  136  9e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3577  sulfatase  27.96 
 
 
438 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176651  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1723  sulfatase  28.91 
 
 
454 aa  136  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2294  sulfatase  29.29 
 
 
442 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434198  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  27.39 
 
 
440 aa  135  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3650  sulfatase  25.89 
 
 
482 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127194  decreased coverage  0.00847064 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  30.15 
 
 
486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  26.78 
 
 
497 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2939  sulfatase  28.05 
 
 
556 aa  134  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1700  sulfatase  27.45 
 
 
479 aa  134  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1580  sulfatase  26.24 
 
 
459 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37197  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  30.77 
 
 
484 aa  134  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  25.66 
 
 
548 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1735  sulfatase  28.3 
 
 
508 aa  134  5e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  31.5 
 
 
482 aa  133  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1250  sulfatase  25.16 
 
 
489 aa  133  9e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.820666  normal  0.257041 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5003  sulfatase  26.55 
 
 
533 aa  132  9e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1708  sulfatase  28.48 
 
 
449 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>