More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1566 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1566  sulfatase  100 
 
 
630 aa  1302    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.145604  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2520  sulfatase  43.22 
 
 
607 aa  458  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.541987  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2626  sulfatase  39.3 
 
 
624 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.342273  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5209  sulfatase  38.4 
 
 
603 aa  299  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.283658  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5650  sulfatase  38.4 
 
 
603 aa  299  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.372268  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2367  sulfatase family protein  34.5 
 
 
558 aa  283  5.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158836  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0762  sulfatase  34.96 
 
 
576 aa  259  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.378263  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3657  sulfatase  31.99 
 
 
494 aa  219  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000376885  normal  0.0602445 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2695  sulfatase  32.63 
 
 
486 aa  182  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000809096  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1780  sulfatase  29.21 
 
 
481 aa  173  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2826  sulfatase  26.37 
 
 
500 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.250394 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4597  sulfatase  26.28 
 
 
614 aa  147  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4179  sulfatase  26.42 
 
 
514 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.10978 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3336  sulfatase  29.52 
 
 
482 aa  139  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.990519  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10303  sulfatase  29.26 
 
 
465 aa  134  6e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000455468  normal  0.448256 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0440  sulfatase  28.1 
 
 
431 aa  133  7.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1562  sulfatase  31.44 
 
 
477 aa  131  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2349  sulfatase  28.33 
 
 
437 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00689032  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1841  sulfatase  25.71 
 
 
554 aa  124  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3825  sulfatase  26.68 
 
 
451 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0390  sulfatase  27.94 
 
 
465 aa  121  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0399  sulfatase  27.94 
 
 
465 aa  121  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.603146 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0378  sulfatase  27.94 
 
 
465 aa  121  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0510065  normal  0.447114 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0122  sulfatase  22.99 
 
 
458 aa  120  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3398  sulfatase  28.25 
 
 
524 aa  118  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.145395  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1700  sulfatase  26.21 
 
 
479 aa  110  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3290  choline-sulfatase  26.37 
 
 
513 aa  109  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1354  sulfatase  27.22 
 
 
621 aa  107  8e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0753  sulfatase family protein  25.87 
 
 
517 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1985  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0484  choline sulfatase  25.87 
 
 
517 aa  104  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3375  sulfatase  25.5 
 
 
474 aa  104  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2121  choline sulfatase  25.87 
 
 
522 aa  104  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1723  sulfatase  23.84 
 
 
454 aa  104  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0697  choline sulfatase  25.87 
 
 
522 aa  104  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0993  choline sulfatase  25.87 
 
 
522 aa  104  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0841  sulfatase family protein  25.87 
 
 
522 aa  104  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1966  choline sulfatase  25.87 
 
 
522 aa  104  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1855  choline sulfatase  25.46 
 
 
517 aa  102  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250441  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3570  choline-sulfatase  24.64 
 
 
511 aa  100  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0587  sulfatase  24.59 
 
 
511 aa  100  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1708  sulfatase  25.85 
 
 
449 aa  100  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5213  choline-sulfatase  24.24 
 
 
516 aa  98.6  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0706  sulfatase  24.43 
 
 
576 aa  98.2  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  24.08 
 
 
537 aa  96.3  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  21.32 
 
 
474 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  35.25 
 
 
535 aa  95.9  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1251  sulfatase  25.26 
 
 
485 aa  95.9  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.601083  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5009  choline-sulfatase  25.25 
 
 
516 aa  95.9  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3296  sulfatase  23.88 
 
 
516 aa  95.1  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.787928  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5072  sulfatase  23.88 
 
 
516 aa  95.1  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263154  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  25.93 
 
 
466 aa  94.7  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0798  sulfatase  24.44 
 
 
518 aa  94.4  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0822937  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22600  choline-sulfatase  25.8 
 
 
520 aa  90.5  9e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124418  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4484  sulfatase  25 
 
 
511 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  25.62 
 
 
465 aa  85.5  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  24.81 
 
 
497 aa  84.7  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  25.14 
 
 
453 aa  84  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1565  sulfatase  24.63 
 
 
453 aa  82.8  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717098  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  32.81 
 
 
511 aa  81.3  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3468  sulfatase  23.08 
 
 
466 aa  80.5  0.00000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  24.53 
 
 
492 aa  79.7  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2825  sulfatase  21.56 
 
 
464 aa  79.7  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.424556  normal  0.232256 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  23.92 
 
 
631 aa  79.3  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  26.06 
 
 
452 aa  78.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  25.29 
 
 
467 aa  78.2  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5110  sulfatase  23.54 
 
 
497 aa  78.2  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.36096 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  24.18 
 
 
470 aa  77.8  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  31.82 
 
 
488 aa  77.4  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2657  sulfatase  24.25 
 
 
519 aa  77  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3489  sulfatase  30.46 
 
 
535 aa  76.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3206  sulfatase  36.08 
 
 
586 aa  76.3  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  22.72 
 
 
468 aa  75.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2827  sulfatase  36.07 
 
 
545 aa  75.5  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2247  sulfatase  30.47 
 
 
493 aa  75.1  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6647  sulfatase  23.2 
 
 
476 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.707956 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1250  sulfatase  22 
 
 
489 aa  74.7  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.820666  normal  0.257041 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0637  sulfatase  24.44 
 
 
457 aa  74.3  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  25.29 
 
 
482 aa  74.3  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4186  sulfatase  23.59 
 
 
497 aa  73.9  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  24.01 
 
 
474 aa  73.9  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03562  predicted sulfatase/phosphatase  23.59 
 
 
497 aa  73.6  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.678565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0025  sulfatase  23.59 
 
 
497 aa  73.6  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2600  sulfatase  25.65 
 
 
447 aa  73.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03505  hypothetical protein  23.59 
 
 
497 aa  73.6  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.973058  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  26.25 
 
 
471 aa  73.2  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  27.1 
 
 
458 aa  72.8  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0984  sulfatase  27.04 
 
 
535 aa  72.4  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3366  sulfatase  27.04 
 
 
535 aa  72.4  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.897843 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  21.85 
 
 
501 aa  72.4  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  25.89 
 
 
517 aa  72  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0931  sulfatase  27.04 
 
 
535 aa  72.4  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1775  sulfatase  34.91 
 
 
587 aa  71.6  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.819016  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1516  sulfatase  29.75 
 
 
553 aa  71.2  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  27.32 
 
 
500 aa  71.2  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  24.72 
 
 
471 aa  70.9  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  27.64 
 
 
491 aa  70.9  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2763  sulfatase  27.78 
 
 
478 aa  70.9  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.449052  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  21.26 
 
 
497 aa  70.5  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2100  sulfatase  22.88 
 
 
480 aa  70.5  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6149  choline-sulfatase  22.06 
 
 
503 aa  70.1  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.989807 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>