More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3398 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3398  sulfatase  100 
 
 
524 aa  1092    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.145395  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0798  sulfatase  42.62 
 
 
518 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0822937  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2826  sulfatase  34.34 
 
 
500 aa  281  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.250394 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0706  sulfatase  34.72 
 
 
576 aa  261  2e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2695  sulfatase  28.38 
 
 
486 aa  152  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000809096  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1780  sulfatase  28.76 
 
 
481 aa  150  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1841  sulfatase  26.05 
 
 
554 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4179  sulfatase  26.61 
 
 
514 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.10978 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2349  sulfatase  28.93 
 
 
437 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00689032  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2626  sulfatase  27.24 
 
 
624 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.342273  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5209  sulfatase  27.02 
 
 
603 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.283658  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5650  sulfatase  27.02 
 
 
603 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.372268  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3825  sulfatase  28.29 
 
 
451 aa  130  7.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1566  sulfatase  28.43 
 
 
630 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.145604  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4597  sulfatase  25.83 
 
 
614 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2367  sulfatase family protein  23.33 
 
 
558 aa  124  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158836  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3375  sulfatase  27.39 
 
 
474 aa  123  9e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10303  sulfatase  27.17 
 
 
465 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000455468  normal  0.448256 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3336  sulfatase  27.17 
 
 
482 aa  118  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.990519  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  29.38 
 
 
490 aa  115  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1354  sulfatase  29.32 
 
 
621 aa  115  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0440  sulfatase  26.26 
 
 
431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3419  sulfatase  28.95 
 
 
526 aa  109  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0390  sulfatase  27.88 
 
 
465 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0399  sulfatase  27.88 
 
 
465 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.603146 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0378  sulfatase  27.88 
 
 
465 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0510065  normal  0.447114 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  28.42 
 
 
481 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2520  sulfatase  25.36 
 
 
607 aa  106  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.541987  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3662  sulfatase  26.41 
 
 
637 aa  105  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.33998  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  29.82 
 
 
465 aa  105  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1251  sulfatase  23.93 
 
 
485 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.601083  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1327  sulfatase  25.6 
 
 
480 aa  104  4e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.499609  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1562  sulfatase  26.65 
 
 
477 aa  103  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  26.7 
 
 
488 aa  102  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0762  sulfatase  24.57 
 
 
576 aa  101  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.378263  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  26.75 
 
 
497 aa  101  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  26.65 
 
 
492 aa  100  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  25.2 
 
 
510 aa  98.6  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  27.63 
 
 
462 aa  98.6  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0122  sulfatase  23.61 
 
 
458 aa  97.4  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  25.99 
 
 
453 aa  97.1  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01140  arylsulfatase A family protein  25.79 
 
 
483 aa  95.9  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  27.47 
 
 
474 aa  95.9  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5003  sulfatase  22.62 
 
 
533 aa  95.5  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2434  sulfatase  24.62 
 
 
564 aa  93.6  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0911  choline-sulfatase  25.95 
 
 
509 aa  93.6  9e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000929958  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3657  sulfatase  23.45 
 
 
494 aa  92.8  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000376885  normal  0.0602445 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  25.6 
 
 
440 aa  92.4  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05040  arylsulfatase A family protein  26.98 
 
 
474 aa  92  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  28.23 
 
 
553 aa  92  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003601  arylsulfatase  26.04 
 
 
521 aa  91.7  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3651  sulfatase  25.13 
 
 
483 aa  92  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000643806  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0764  sulfatase  26.3 
 
 
559 aa  91.7  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.726055  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0354  sulfatase  26.98 
 
 
493 aa  91.7  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  26.33 
 
 
489 aa  90.9  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4996  sulfatase  24.93 
 
 
506 aa  90.5  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.317023 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3650  sulfatase  25.85 
 
 
482 aa  90.1  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127194  decreased coverage  0.00847064 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2292  sulfatase  26.5 
 
 
489 aa  90.1  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  27.54 
 
 
457 aa  89.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  26.15 
 
 
631 aa  89  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  26.17 
 
 
517 aa  89  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  26.22 
 
 
526 aa  89  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1173  sulfatase  23.81 
 
 
458 aa  88.2  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1580  sulfatase  26 
 
 
459 aa  87.8  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37197  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  26.7 
 
 
470 aa  87  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2657  sulfatase  23.13 
 
 
519 aa  87  8e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1131  sulfatase  26.49 
 
 
551 aa  87  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  24.46 
 
 
537 aa  86.3  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  24.42 
 
 
523 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  27.89 
 
 
506 aa  85.5  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2827  sulfatase  32.35 
 
 
545 aa  85.5  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5404  sulfatase  26.92 
 
 
457 aa  85.9  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268396  normal  0.742595 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2763  sulfatase  24.8 
 
 
478 aa  85.5  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.449052  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  24.86 
 
 
453 aa  85.1  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2725  sulfatase  25.37 
 
 
724 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0744828  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3903  sulfatase  25.68 
 
 
486 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1565  sulfatase  24.47 
 
 
453 aa  85.1  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717098  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  26.76 
 
 
466 aa  84.7  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  26.24 
 
 
491 aa  84.7  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06030  arylsulfatase A family protein  25.07 
 
 
496 aa  84.7  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478391  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3320  sulfatase  29.13 
 
 
520 aa  84.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000925232 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1478  sulfatase  24.39 
 
 
558 aa  84.3  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  24.62 
 
 
501 aa  84.3  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  27.66 
 
 
482 aa  84  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  27.48 
 
 
486 aa  83.2  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2890  sulfatase  24.43 
 
 
523 aa  82.8  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  25.7 
 
 
497 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1573  putative choline-sulfatase  24.79 
 
 
515 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2686  twin-arginine translocation pathway signal  24.68 
 
 
490 aa  82.8  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1306  sulfatase  25.17 
 
 
498 aa  82.8  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3805  sulfatase  25.74 
 
 
552 aa  82.8  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3146  sulfatase  25.58 
 
 
489 aa  83.2  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  26.22 
 
 
452 aa  82.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  24.51 
 
 
467 aa  82  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  27.13 
 
 
486 aa  82.8  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4646  sulfatase  23.11 
 
 
461 aa  82  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3064  arylsulfatase A  24.68 
 
 
494 aa  82.4  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.886966  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  25 
 
 
442 aa  82.4  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  25.97 
 
 
484 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3047  sulfatase  36.64 
 
 
503 aa  81.3  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0209579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>