More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2367 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2367  sulfatase family protein  100 
 
 
558 aa  1162    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158836  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0762  sulfatase  38.97 
 
 
576 aa  385  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.378263  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5209  sulfatase  39.38 
 
 
603 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.283658  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5650  sulfatase  39.38 
 
 
603 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.372268  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2520  sulfatase  36.72 
 
 
607 aa  311  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.541987  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2626  sulfatase  34.69 
 
 
624 aa  286  8e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.342273  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1566  sulfatase  34.5 
 
 
630 aa  283  5.000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.145604  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3657  sulfatase  34.85 
 
 
494 aa  243  6e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000376885  normal  0.0602445 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1780  sulfatase  28.89 
 
 
481 aa  189  9e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2695  sulfatase  30.67 
 
 
486 aa  189  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000809096  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2826  sulfatase  31.21 
 
 
500 aa  187  4e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.250394 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1841  sulfatase  28.03 
 
 
554 aa  171  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4179  sulfatase  26.6 
 
 
514 aa  169  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.10978 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0440  sulfatase  28.38 
 
 
431 aa  160  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4597  sulfatase  25.43 
 
 
614 aa  158  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3336  sulfatase  26.23 
 
 
482 aa  154  5.9999999999999996e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.990519  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10303  sulfatase  27.93 
 
 
465 aa  144  5e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000455468  normal  0.448256 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0390  sulfatase  26.83 
 
 
465 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0399  sulfatase  26.83 
 
 
465 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.603146 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0378  sulfatase  26.83 
 
 
465 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0510065  normal  0.447114 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3825  sulfatase  26.08 
 
 
451 aa  139  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0798  sulfatase  25.36 
 
 
518 aa  136  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0822937  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2349  sulfatase  27.21 
 
 
437 aa  136  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00689032  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1562  sulfatase  26.35 
 
 
477 aa  135  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0706  sulfatase  26.33 
 
 
576 aa  134  6e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1723  sulfatase  27.02 
 
 
454 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3375  sulfatase  25.47 
 
 
474 aa  125  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3398  sulfatase  23.32 
 
 
524 aa  120  4.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.145395  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1354  sulfatase  27.49 
 
 
621 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3181  sulfatase  24.28 
 
 
523 aa  115  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0122  sulfatase  25.6 
 
 
458 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  24.13 
 
 
526 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3320  sulfatase  22.26 
 
 
520 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000925232 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  24.02 
 
 
537 aa  107  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  24.85 
 
 
440 aa  106  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5404  sulfatase  25.55 
 
 
457 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268396  normal  0.742595 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2233  sulfatase  23.43 
 
 
511 aa  105  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  26.11 
 
 
453 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1432  sulfatase  23.91 
 
 
522 aa  104  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.209793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  22.35 
 
 
474 aa  103  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1708  sulfatase  24.31 
 
 
449 aa  103  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3577  sulfatase  25.24 
 
 
438 aa  103  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176651  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1700  sulfatase  24.07 
 
 
479 aa  103  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  24.58 
 
 
491 aa  101  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2294  sulfatase  25.51 
 
 
442 aa  101  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434198  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2434  sulfatase  24.14 
 
 
564 aa  100  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  26.87 
 
 
482 aa  100  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4466  sulfatase  25.06 
 
 
453 aa  98.6  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0640965 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  23.69 
 
 
501 aa  98.6  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  27.05 
 
 
465 aa  98.2  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  24.9 
 
 
457 aa  97.8  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  25 
 
 
466 aa  97.4  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  27.73 
 
 
490 aa  97.1  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  25 
 
 
497 aa  97.1  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  24.31 
 
 
500 aa  96.3  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  22.07 
 
 
489 aa  96.3  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  23.38 
 
 
511 aa  95.9  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  24.32 
 
 
497 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  24.19 
 
 
467 aa  95.5  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  24.32 
 
 
497 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  29.05 
 
 
457 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2100  sulfatase  22.18 
 
 
480 aa  95.9  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  31.38 
 
 
535 aa  94.7  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  24.32 
 
 
497 aa  94.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0795  sulfatase  22.94 
 
 
549 aa  94.4  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0245615  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  24.32 
 
 
497 aa  94.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  24.33 
 
 
497 aa  94.4  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2292  sulfatase  23.39 
 
 
489 aa  94  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2657  sulfatase  24.15 
 
 
519 aa  93.2  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2250  sulfatase  23.79 
 
 
478 aa  92.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  21.84 
 
 
468 aa  92.4  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1250  sulfatase  24.93 
 
 
489 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.820666  normal  0.257041 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47845  predicted protein  24.04 
 
 
620 aa  92.4  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0593792  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  24.66 
 
 
479 aa  92  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2825  sulfatase  23.62 
 
 
464 aa  92  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.424556  normal  0.232256 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  22.77 
 
 
492 aa  90.9  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0390  sulfatase  24.23 
 
 
464 aa  90.5  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334066  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  23.12 
 
 
480 aa  90.1  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  24.02 
 
 
484 aa  90.5  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  25.94 
 
 
487 aa  89.7  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  24.84 
 
 
453 aa  89.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  23.99 
 
 
486 aa  89.7  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  24.36 
 
 
472 aa  89  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  23.34 
 
 
471 aa  89.4  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2680  arylsulfatase  24.22 
 
 
584 aa  88.2  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246177  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3662  sulfatase  21.58 
 
 
637 aa  88.2  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.33998  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01140  arylsulfatase A family protein  23.22 
 
 
483 aa  87.8  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1327  sulfatase  21.91 
 
 
480 aa  87.8  5e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.499609  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  21.65 
 
 
442 aa  87.4  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3166  sulfatase  21.92 
 
 
482 aa  87.4  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0637  sulfatase  23.23 
 
 
457 aa  86.7  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  25 
 
 
470 aa  85.9  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  24.85 
 
 
462 aa  86.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  25.67 
 
 
506 aa  85.9  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  22.93 
 
 
510 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  21.63 
 
 
631 aa  85.1  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0764  sulfatase  22.77 
 
 
559 aa  84.7  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.726055  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1565  sulfatase  23.74 
 
 
453 aa  84.7  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717098  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  20.9 
 
 
539 aa  84.3  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  25.63 
 
 
452 aa  84  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>