More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4597 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4597  sulfatase  100 
 
 
614 aa  1288    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1780  sulfatase  32.53 
 
 
481 aa  233  6e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4179  sulfatase  30.51 
 
 
514 aa  202  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.10978 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2826  sulfatase  29.96 
 
 
500 aa  196  9e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.250394 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2695  sulfatase  28.81 
 
 
486 aa  190  8e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000809096  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1841  sulfatase  28.57 
 
 
554 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0440  sulfatase  29.14 
 
 
431 aa  171  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3336  sulfatase  30.87 
 
 
482 aa  169  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.990519  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5209  sulfatase  27.88 
 
 
603 aa  163  9e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.283658  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0390  sulfatase  30.22 
 
 
465 aa  163  9e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5650  sulfatase  27.88 
 
 
603 aa  163  9e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.372268  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0399  sulfatase  30.22 
 
 
465 aa  163  9e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.603146 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0378  sulfatase  30.22 
 
 
465 aa  163  9e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0510065  normal  0.447114 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2520  sulfatase  27.69 
 
 
607 aa  162  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.541987  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2349  sulfatase  30.67 
 
 
437 aa  161  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00689032  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2367  sulfatase family protein  25.43 
 
 
558 aa  158  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158836  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10303  sulfatase  31 
 
 
465 aa  157  6e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000455468  normal  0.448256 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2626  sulfatase  28.99 
 
 
624 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.342273  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1562  sulfatase  30.18 
 
 
477 aa  152  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3825  sulfatase  26.82 
 
 
451 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1566  sulfatase  26.28 
 
 
630 aa  147  4.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.145604  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0762  sulfatase  26.91 
 
 
576 aa  146  9e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.378263  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3166  sulfatase  29.89 
 
 
482 aa  146  9e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  26.58 
 
 
535 aa  146  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0491  sulfatase  28.78 
 
 
500 aa  142  9.999999999999999e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.244971 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0798  sulfatase  26.65 
 
 
518 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0822937  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  26.78 
 
 
497 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0122  sulfatase  28.07 
 
 
458 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0587  sulfatase  29.48 
 
 
511 aa  134  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  25.05 
 
 
537 aa  134  6.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0911  choline-sulfatase  29.23 
 
 
509 aa  133  9e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000929958  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01140  arylsulfatase A family protein  25.05 
 
 
483 aa  133  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  27.11 
 
 
474 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3146  sulfatase  25.6 
 
 
489 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4484  sulfatase  28.85 
 
 
511 aa  131  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1005  sulfatase  27.95 
 
 
518 aa  131  5.0000000000000004e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549789  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  24.37 
 
 
480 aa  130  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5213  choline-sulfatase  28.84 
 
 
516 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  26.32 
 
 
465 aa  130  9.000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  26.56 
 
 
490 aa  130  9.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2156  sulfatase  27.27 
 
 
487 aa  130  9.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  27.01 
 
 
453 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3296  sulfatase  29.05 
 
 
516 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.787928  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5072  sulfatase  29.05 
 
 
516 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263154  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  28.37 
 
 
491 aa  128  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5009  choline-sulfatase  28.37 
 
 
516 aa  128  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3375  sulfatase  26.08 
 
 
474 aa  128  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  28.01 
 
 
471 aa  127  7e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  26.57 
 
 
468 aa  126  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  29.51 
 
 
495 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3296  sulfatase  26.97 
 
 
460 aa  126  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0308085  hitchhiker  0.000582836 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  24.49 
 
 
462 aa  126  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4466  sulfatase  26.85 
 
 
453 aa  125  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0640965 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  28.68 
 
 
489 aa  125  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  27 
 
 
511 aa  125  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1855  choline sulfatase  27.95 
 
 
517 aa  125  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250441  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3570  choline-sulfatase  28.16 
 
 
511 aa  125  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  25.9 
 
 
500 aa  125  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  27.88 
 
 
500 aa  125  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  26.85 
 
 
481 aa  125  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1573  putative choline-sulfatase  28.23 
 
 
515 aa  124  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5075  choline-sulfatase  28.02 
 
 
512 aa  124  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  hitchhiker  0.0038506 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  27.34 
 
 
452 aa  124  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  25.98 
 
 
453 aa  124  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0484  choline sulfatase  27.4 
 
 
517 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2121  choline sulfatase  27.4 
 
 
522 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0697  choline sulfatase  27.4 
 
 
522 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0993  choline sulfatase  27.4 
 
 
522 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0841  sulfatase family protein  27.4 
 
 
522 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1966  choline sulfatase  27.4 
 
 
522 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  26.01 
 
 
486 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3913  sulfatase  25.47 
 
 
522 aa  122  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.656698  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3577  sulfatase  28.16 
 
 
438 aa  122  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176651  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  26.17 
 
 
492 aa  121  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  27.15 
 
 
491 aa  121  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1565  sulfatase  25.45 
 
 
453 aa  121  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717098  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0753  sulfatase family protein  27.4 
 
 
517 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1985  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  27.67 
 
 
482 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3657  sulfatase  24.32 
 
 
494 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000376885  normal  0.0602445 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1580  sulfatase  24.84 
 
 
459 aa  120  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37197  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3398  sulfatase  25.86 
 
 
524 aa  119  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.145395  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0165  sulfatase family protein  27.06 
 
 
501 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  26.05 
 
 
486 aa  119  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0997  sulfatase  26.75 
 
 
517 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224171  normal  0.0910854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3064  arylsulfatase A  25.05 
 
 
494 aa  118  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.886966  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0096  choline-sulfatase  27.37 
 
 
505 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.574472  hitchhiker  0.0000926567 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0029  sulfatase  26.59 
 
 
501 aa  118  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0026  sulfatase  27.37 
 
 
510 aa  118  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.407954  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  25.95 
 
 
457 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  27.22 
 
 
462 aa  118  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  27.37 
 
 
487 aa  117  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0077  choline sulfatase  26 
 
 
505 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.604146  hitchhiker  0.000459968 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  25.25 
 
 
457 aa  117  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  25.55 
 
 
440 aa  117  7.999999999999999e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1250  sulfatase  28.98 
 
 
489 aa  117  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.820666  normal  0.257041 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3268  sulfatase  28.07 
 
 
495 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0376086  normal  0.666848 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3290  choline-sulfatase  25.77 
 
 
513 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  25.48 
 
 
471 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  26.93 
 
 
466 aa  116  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0032  choline sulfatase  27.63 
 
 
503 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>