More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3146 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3146  sulfatase  100 
 
 		 489 aa  1013    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0077  choline sulfatase  35.66 
 
 		 505 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.604146  hitchhiker  0.000459968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0093  choline-sulfatase  34.63 
 
 		 505 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000895462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0093  sulfatase  35.45 
 
 		 505 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0096  choline-sulfatase  35 
 
 		 505 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.574472  hitchhiker  0.0000926567 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0064  sulfatase  35.14 
 
 		 502 aa  236  7e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0032  choline sulfatase  36.73 
 
 		 503 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5009  choline-sulfatase  35.44 
 
 		 516 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0026  sulfatase  32.99 
 
 		 510 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.407954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0587  sulfatase  34.97 
 
 		 511 aa  233  9e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5213  choline-sulfatase  35.65 
 
 		 516 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00380  choline sulfatase  35.91 
 
 		 503 aa  231  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.103488 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6149  choline-sulfatase  33.74 
 
 		 503 aa  230  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.989807 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3296  sulfatase  35.44 
 
 		 516 aa  229  7e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.787928  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5072  sulfatase  35.44 
 
 		 516 aa  229  7e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4484  sulfatase  35.6 
 
 		 511 aa  229  8e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22600  choline-sulfatase  33.46 
 
 		 520 aa  226  5.0000000000000005e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124418  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0911  choline-sulfatase  32.54 
 
 		 509 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000929958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6647  sulfatase  34.29 
 
 		 476 aa  223  8e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.707956 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0165  sulfatase family protein  31.84 
 
 		 501 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3570  choline-sulfatase  35.67 
 
 		 511 aa  219  6e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05449  conserved hypothetical protein similar to choline sulphatase (Eurofung)  34.47 
 
 		 594 aa  219  1e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0257615  normal  0.340962 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0029  sulfatase  31.82 
 
 		 501 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5764  sulfatase  34.95 
 
 		 482 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3323  sulfatase  32.16 
 
 		 502 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0484  choline sulfatase  34.75 
 
 		 517 aa  216  9e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2121  choline sulfatase  34.75 
 
 		 522 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6693  choline-sulfatase  32.45 
 
 		 502 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17144  normal  0.223575 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0697  choline sulfatase  34.75 
 
 		 522 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0993  choline sulfatase  34.75 
 
 		 522 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0841  sulfatase family protein  34.75 
 
 		 522 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1966  choline sulfatase  34.75 
 
 		 522 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1855  choline sulfatase  33.82 
 
 		 517 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250441  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0753  sulfatase family protein  33.78 
 
 		 517 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1985  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0496  sulfatase  34.25 
 
 		 501 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.261478  normal  0.387641 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3290  choline-sulfatase  33.05 
 
 		 513 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0564  sulfatase  31.38 
 
 		 512 aa  212  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2286  sulfatase  31.4 
 
 		 498 aa  209  7e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1494  sulfatase  31.92 
 
 		 502 aa  209  9e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000530638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2247  sulfatase  32.14 
 
 		 501 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.466267 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0594  putative choline sulfatase  31.95 
 
 		 501 aa  206  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5790  choline-sulfatase  31.34 
 
 		 504 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1005  sulfatase  32.67 
 
 		 518 aa  204  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549789  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3133  sulfatase  31.93 
 
 		 504 aa  201  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5075  choline-sulfatase  31.96 
 
 		 512 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  hitchhiker  0.0038506 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1573  putative choline-sulfatase  30.85 
 
 		 515 aa  195  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0177  sulfatase  30.06 
 
 		 505 aa  187  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1150  choline sulfatase  31.78 
 
 		 496 aa  186  7e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  29.51 
 
 		 535 aa  184  4.0000000000000006e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3064  arylsulfatase A  32.64 
 
 		 494 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.886966  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2763  sulfatase  29.34 
 
 		 478 aa  176  6e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.449052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  30.89 
 
 		 474 aa  173  6.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1574  sulfatase  30.02 
 
 		 554 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01140  arylsulfatase A family protein  29.01 
 
 		 483 aa  158  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1529  sulfatase  28.37 
 
 		 499 aa  157  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.856317  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2113  sulfatase  29.38 
 
 		 572 aa  155  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.367046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3181  sulfatase  28.48 
 
 		 523 aa  156  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1700  sulfatase  30.31 
 
 		 479 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3206  sulfatase  27.37 
 
 		 586 aa  153  5e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2234  sulfatase  26.53 
 
 		 506 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3419  sulfatase  28.84 
 
 		 526 aa  151  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2519  sulfatase  28.19 
 
 		 507 aa  149  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.602817  normal  0.0521471 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3492  sulfatase  28.32 
 
 		 498 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1568  sulfatase  27.47 
 
 		 549 aa  146  7.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4179  sulfatase  26.13 
 
 		 514 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.10978 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  27.62 
 
 		 511 aa  144  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2156  sulfatase  29.95 
 
 		 487 aa  144  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1580  sulfatase  26.99 
 
 		 459 aa  143  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0569  sulfatase  26.54 
 
 		 497 aa  142  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05040  arylsulfatase A family protein  26.68 
 
 		 474 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  26.65 
 
 		 526 aa  141  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2827  sulfatase  25.73 
 
 		 545 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1716  sulfatase  26.75 
 
 		 508 aa  139  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2250  sulfatase  29.23 
 
 		 478 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1300  arylsulfatase  26.11 
 
 		 486 aa  137  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2375  sulfatase family protein  27.23 
 
 		 502 aa  136  7.000000000000001e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0813491  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1802  sulfatase  28.72 
 
 		 518 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.389525 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1808  sulfatase  27.24 
 
 		 511 aa  135  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0304  sulfatase  27.8 
 
 		 497 aa  134  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0891  sulfatase  25.6 
 
 		 565 aa  134  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2284  sulfatase  27.97 
 
 		 784 aa  133  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3166  sulfatase  27.67 
 
 		 482 aa  133  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4036  sulfatase  28.9 
 
 		 459 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188862  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4597  sulfatase  25.6 
 
 		 614 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  25.11 
 
 		 457 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3268  sulfatase  27.24 
 
 		 495 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0376086  normal  0.666848 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1836  sulfatase  28.09 
 
 		 514 aa  130  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  27.14 
 
 		 501 aa  129  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  25.77 
 
 		 537 aa  129  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1708  sulfatase  27.95 
 
 		 449 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1890  sulfatase  28.51 
 
 		 493 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.461915 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1432  sulfatase  23.39 
 
 		 522 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.209793 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1173  sulfatase  24.78 
 
 		 458 aa  125  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2242  sulfatase  26.83 
 
 		 512 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3903  sulfatase  26.09 
 
 		 486 aa  125  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2434  sulfatase  23.84 
 
 		 564 aa  124  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4186  sulfatase  27.97 
 
 		 519 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2247  sulfatase  25.3 
 
 		 493 aa  123  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  26.57 
 
 		 497 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5110  sulfatase  25.44 
 
 		 497 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.36096 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>