More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0096 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0077  choline sulfatase  94.26 
 
 		 505 aa  996    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.604146  hitchhiker  0.000459968 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0032  choline sulfatase  79.64 
 
 		 503 aa  831    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0165  sulfatase family protein  78.04 
 
 		 501 aa  837    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0029  sulfatase  77.25 
 
 		 501 aa  829    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0026  sulfatase  80.28 
 
 		 510 aa  857    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.407954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0093  choline-sulfatase  94.65 
 
 		 505 aa  1000    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000895462 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00380  choline sulfatase  79.44 
 
 		 503 aa  822    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.103488 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0096  choline-sulfatase  100 
 
 		 505 aa  1046    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.574472  hitchhiker  0.0000926567 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0064  sulfatase  82.24 
 
 		 502 aa  864    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0093  sulfatase  94.46 
 
 		 505 aa  997    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1005  sulfatase  56.6 
 
 		 518 aa  616  1e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549789  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3290  choline-sulfatase  59.21 
 
 		 513 aa  610  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2121  choline sulfatase  58.42 
 
 		 522 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1855  choline sulfatase  58.22 
 
 		 517 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250441  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0697  choline sulfatase  58.42 
 
 		 522 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0993  choline sulfatase  58.42 
 
 		 522 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0841  sulfatase family protein  58.42 
 
 		 522 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0753  sulfatase family protein  58.42 
 
 		 517 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1985  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1966  choline sulfatase  58.42 
 
 		 522 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0484  choline sulfatase  58.42 
 
 		 517 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5075  choline-sulfatase  57.48 
 
 		 512 aa  595  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  hitchhiker  0.0038506 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0587  sulfatase  58.65 
 
 		 511 aa  597  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1573  putative choline-sulfatase  57.68 
 
 		 515 aa  595  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3296  sulfatase  58.86 
 
 		 516 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.787928  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5072  sulfatase  58.86 
 
 		 516 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5213  choline-sulfatase  58.66 
 
 		 516 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5009  choline-sulfatase  59.06 
 
 		 516 aa  596  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3570  choline-sulfatase  59.05 
 
 		 511 aa  593  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05449  conserved hypothetical protein similar to choline sulphatase (Eurofung)  66.43 
 
 		 594 aa  586  1e-166  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0257615  normal  0.340962 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4484  sulfatase  59.09 
 
 		 511 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0911  choline-sulfatase  54.76 
 
 		 509 aa  551  1e-155  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000929958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5790  choline-sulfatase  48.12 
 
 		 504 aa  478  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6693  choline-sulfatase  48.02 
 
 		 502 aa  472  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17144  normal  0.223575 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6149  choline-sulfatase  50.32 
 
 		 503 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.989807 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3133  sulfatase  48.31 
 
 		 504 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3323  sulfatase  47.91 
 
 		 502 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1494  sulfatase  48.71 
 
 		 502 aa  466  9.999999999999999e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000530638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2286  sulfatase  48.21 
 
 		 498 aa  464  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1150  choline sulfatase  48.79 
 
 		 496 aa  461  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0564  sulfatase  47.93 
 
 		 512 aa  458  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0496  sulfatase  48.41 
 
 		 501 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.261478  normal  0.387641 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0594  putative choline sulfatase  47.21 
 
 		 501 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2247  sulfatase  47.01 
 
 		 501 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.466267 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22600  choline-sulfatase  45.74 
 
 		 520 aa  427  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124418  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3146  sulfatase  35 
 
 		 489 aa  241  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3206  sulfatase  29.19 
 
 		 586 aa  173  5.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5764  sulfatase  28.34 
 
 		 482 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06030  arylsulfatase A family protein  31.52 
 
 		 496 aa  172  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478391  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  27.39 
 
 		 526 aa  168  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  32.05 
 
 		 535 aa  167  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2358  sulfatase family protein  28.57 
 
 		 499 aa  163  7e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  29.79 
 
 		 474 aa  162  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  28.38 
 
 		 537 aa  160  5e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1574  sulfatase  29.14 
 
 		 554 aa  160  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2113  sulfatase  30.1 
 
 		 572 aa  158  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.367046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1568  sulfatase  27.8 
 
 		 549 aa  154  5e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3489  sulfatase  30.6 
 
 		 535 aa  152  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0304  sulfatase  29.81 
 
 		 497 aa  152  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01140  arylsulfatase A family protein  28.27 
 
 		 483 aa  150  6e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6647  sulfatase  27.43 
 
 		 476 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.707956 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1716  sulfatase  27.65 
 
 		 508 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2156  sulfatase  30.2 
 
 		 487 aa  148  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  26.68 
 
 		 511 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28180  arylsulfatase A family protein  29.98 
 
 		 480 aa  144  5e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0151  sulfatase  26.25 
 
 		 473 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.110259  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1700  sulfatase  27.57 
 
 		 479 aa  142  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3468  sulfatase  29.3 
 
 		 466 aa  139  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1300  arylsulfatase  29 
 
 		 486 aa  139  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5110  sulfatase  28.18 
 
 		 497 aa  137  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.36096 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03562  predicted sulfatase/phosphatase  27.94 
 
 		 497 aa  137  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.678565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0025  sulfatase  27.94 
 
 		 497 aa  137  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4186  sulfatase  27.67 
 
 		 497 aa  137  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03505  hypothetical protein  27.94 
 
 		 497 aa  137  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.973058  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2250  sulfatase  29.17 
 
 		 478 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3064  arylsulfatase A  29.85 
 
 		 494 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.886966  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28950  arylsulfatase A family protein  27.85 
 
 		 489 aa  134  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2247  sulfatase  27.47 
 
 		 493 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4043  sulfatase  27.94 
 
 		 497 aa  134  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0357  sulfatase  24.38 
 
 		 491 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1173  sulfatase  24.01 
 
 		 458 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1836  sulfatase  25.81 
 
 		 514 aa  131  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3492  sulfatase  26.9 
 
 		 498 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2053  sulfatase  28.1 
 
 		 523 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240603 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0945  sulfatase  26.26 
 
 		 517 aa  130  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0996  sulfatase  26.26 
 
 		 517 aa  130  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.884308  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3379  sulfatase  26.26 
 
 		 517 aa  130  7.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.760538  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0126  sulfatase  25.77 
 
 		 467 aa  130  8.000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1580  sulfatase  26.91 
 
 		 459 aa  129  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  27.25 
 
 		 471 aa  128  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  25.71 
 
 		 501 aa  128  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2375  sulfatase family protein  28.57 
 
 		 502 aa  127  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0813491  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  27.67 
 
 		 497 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0214  sulfatase  26.65 
 
 		 536 aa  127  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0221  arylsulfatase  24.94 
 
 		 481 aa  127  6e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0569  sulfatase  28.38 
 
 		 497 aa  126  9e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1567  sulfatase  27.86 
 
 		 523 aa  126  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0183451  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1251  sulfatase  26.3 
 
 		 485 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.601083  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0891  sulfatase  26.21 
 
 		 565 aa  125  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1529  sulfatase  26.07 
 
 		 499 aa  125  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.856317  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0177  sulfatase  26 
 
 		 505 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>