More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2233 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3181  sulfatase  70.22 
 
 
523 aa  766    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5375  sulfatase  59.96 
 
 
560 aa  657    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1432  sulfatase  63.92 
 
 
522 aa  690    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.209793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2233  sulfatase  100 
 
 
511 aa  1050    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3320  sulfatase  60.59 
 
 
520 aa  649    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000925232 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2827  sulfatase  47.76 
 
 
545 aa  506  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1808  sulfatase  49.71 
 
 
511 aa  498  1e-140  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1013  sulfatase  47.65 
 
 
515 aa  472  1e-132  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3419  sulfatase  46.97 
 
 
526 aa  437  1e-121  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1074  sulfatase  42.77 
 
 
552 aa  409  1e-113  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0111181 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1033  sulfatase  38.09 
 
 
581 aa  364  2e-99  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1130  sulfatase  41.75 
 
 
537 aa  359  7e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.216257  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05040  arylsulfatase A family protein  40.52 
 
 
474 aa  352  5.9999999999999994e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01140  arylsulfatase A family protein  39.84 
 
 
483 aa  345  1e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2763  sulfatase  39.55 
 
 
478 aa  330  3e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.449052  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0795  sulfatase  36.4 
 
 
549 aa  306  8.000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0245615  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2234  sulfatase  38.4 
 
 
506 aa  299  7e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  31.84 
 
 
537 aa  260  4e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2434  sulfatase  32.52 
 
 
564 aa  246  6e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0764  sulfatase  32.99 
 
 
559 aa  233  7.000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.726055  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1251  sulfatase  31.62 
 
 
485 aa  210  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.601083  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28180  arylsulfatase A family protein  29.13 
 
 
480 aa  172  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1565  sulfatase  28.28 
 
 
453 aa  166  6.9999999999999995e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717098  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  26.85 
 
 
535 aa  165  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1841  sulfatase  27.64 
 
 
554 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4179  sulfatase  26.3 
 
 
514 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.10978 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  26.39 
 
 
526 aa  150  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3379  sulfatase  27.73 
 
 
517 aa  150  6e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.760538  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0996  sulfatase  27.73 
 
 
517 aa  150  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.884308  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0945  sulfatase  27.73 
 
 
517 aa  150  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3489  sulfatase  24.5 
 
 
535 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1250  sulfatase  25.34 
 
 
489 aa  146  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.820666  normal  0.257041 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47845  predicted protein  27.31 
 
 
620 aa  146  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0593792  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  25.95 
 
 
470 aa  145  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2680  arylsulfatase  27.16 
 
 
584 aa  144  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246177  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3110  sulfatase  24.85 
 
 
492 aa  144  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  26.91 
 
 
497 aa  143  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  26.91 
 
 
497 aa  143  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  26.87 
 
 
474 aa  143  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  26.49 
 
 
497 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  26.49 
 
 
497 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2610  sulfatase  25.95 
 
 
477 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000218719  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0911  choline-sulfatase  24.47 
 
 
509 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000929958  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2695  sulfatase  25.93 
 
 
486 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000809096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2250  sulfatase  26.09 
 
 
478 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1780  sulfatase  27.23 
 
 
481 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1775  sulfatase  26.5 
 
 
587 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.819016  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3064  arylsulfatase A  25.34 
 
 
494 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.886966  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2247  sulfatase  26.6 
 
 
493 aa  137  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2114  sulfatase  24.9 
 
 
484 aa  137  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.711307  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04770  arylsulfatase A family protein  25.69 
 
 
478 aa  137  6.0000000000000005e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.799262  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  26.41 
 
 
497 aa  137  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1005  sulfatase  24.04 
 
 
518 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549789  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22600  choline-sulfatase  24.81 
 
 
520 aa  136  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124418  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1306  sulfatase  23.67 
 
 
498 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1890  sulfatase  27.43 
 
 
493 aa  134  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.461915 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  26.72 
 
 
474 aa  134  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0177  sulfatase  25.14 
 
 
505 aa  133  6.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  25.32 
 
 
501 aa  132  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4652  sulfatase  27.9 
 
 
551 aa  132  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  26.72 
 
 
497 aa  131  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7372  N-acetylglucosamine-6-sulfatase  25.57 
 
 
513 aa  131  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.834841 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6149  choline-sulfatase  25.78 
 
 
503 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.989807 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0304  sulfatase  23.74 
 
 
497 aa  131  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567268  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5764  sulfatase  26.21 
 
 
482 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11149  conserved hypothetical protein  26.69 
 
 
565 aa  130  7.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.122121  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1516  sulfatase  27.51 
 
 
553 aa  130  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0569  sulfatase  24.81 
 
 
497 aa  129  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1836  sulfatase  25.05 
 
 
514 aa  128  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1300  arylsulfatase  25.62 
 
 
486 aa  127  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3902  sulfatase  25.73 
 
 
522 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2825  sulfatase  25.73 
 
 
464 aa  127  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.424556  normal  0.232256 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6647  sulfatase  26.47 
 
 
476 aa  127  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.707956 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3206  sulfatase  25.05 
 
 
586 aa  127  5e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3290  choline-sulfatase  24.59 
 
 
513 aa  127  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02310  arylsulfatase  24.64 
 
 
536 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0263  arylsulfatase  24.64 
 
 
536 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0208  sulfatase  25.26 
 
 
536 aa  126  9e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0357  sulfatase  26.97 
 
 
491 aa  125  2e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2156  sulfatase  25.15 
 
 
487 aa  125  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0587  sulfatase  25.3 
 
 
511 aa  124  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3870  sulfatase  25 
 
 
578 aa  124  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1986  sulfatase  24.06 
 
 
555 aa  124  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.737695 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0627  sulfatase  25.39 
 
 
474 aa  124  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1573  putative choline-sulfatase  23.81 
 
 
515 aa  123  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1567  sulfatase  25.67 
 
 
523 aa  123  7e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0183451  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06030  arylsulfatase A family protein  24.28 
 
 
496 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478391  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0565  sulfatase  27.87 
 
 
542 aa  122  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.776698 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5075  choline-sulfatase  24.3 
 
 
512 aa  121  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  hitchhiker  0.0038506 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0126  sulfatase  23.36 
 
 
467 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1248  sulfatase  24.53 
 
 
501 aa  120  7e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.305152 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5003  sulfatase  25.23 
 
 
533 aa  120  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0151  sulfatase  26.28 
 
 
473 aa  119  9e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.110259  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1173  sulfatase  24.46 
 
 
458 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2052  sulfatase  24.36 
 
 
543 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430392  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3990  sulfatase  24.32 
 
 
582 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3903  sulfatase  25.28 
 
 
486 aa  118  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4484  sulfatase  24.49 
 
 
511 aa  118  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5213  choline-sulfatase  24.16 
 
 
516 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0753  sulfatase family protein  23.23 
 
 
517 aa  118  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>