More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3468 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3468  sulfatase  100 
 
 
466 aa  964    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2247  sulfatase  41.77 
 
 
493 aa  340  4e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3206  sulfatase  37.66 
 
 
586 aa  264  2e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  34.41 
 
 
474 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2375  sulfatase family protein  35.14 
 
 
502 aa  237  3e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0813491  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  34.38 
 
 
535 aa  236  5.0000000000000005e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0891  sulfatase  30.96 
 
 
565 aa  224  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3489  sulfatase  34.1 
 
 
535 aa  223  4e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  30.85 
 
 
511 aa  212  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2358  sulfatase family protein  32.99 
 
 
499 aa  207  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1567  sulfatase  34.35 
 
 
523 aa  185  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0183451  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2156  sulfatase  31.79 
 
 
487 aa  167  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0911  choline-sulfatase  29.06 
 
 
509 aa  147  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000929958  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22600  choline-sulfatase  28.68 
 
 
520 aa  139  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124418  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0096  choline-sulfatase  29.3 
 
 
505 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.574472  hitchhiker  0.0000926567 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0093  choline-sulfatase  29.45 
 
 
505 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000895462 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0151  sulfatase  25.47 
 
 
473 aa  136  7.000000000000001e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.110259  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0077  choline sulfatase  29.3 
 
 
505 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.604146  hitchhiker  0.000459968 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0093  sulfatase  29.3 
 
 
505 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0026  sulfatase  32.01 
 
 
510 aa  134  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.407954  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1565  sulfatase  27.52 
 
 
453 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717098  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  27.35 
 
 
497 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  26.01 
 
 
537 aa  130  6e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  28.73 
 
 
526 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00380  choline sulfatase  29.46 
 
 
503 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.103488 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06030  arylsulfatase A family protein  27.07 
 
 
496 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478391  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  27.27 
 
 
501 aa  126  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3419  sulfatase  26.43 
 
 
526 aa  125  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1573  putative choline-sulfatase  27.14 
 
 
515 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04770  arylsulfatase A family protein  29.22 
 
 
478 aa  125  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.799262  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3858  sulfatase  28.43 
 
 
519 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0969664  normal  0.154261 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3290  choline-sulfatase  28.04 
 
 
513 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0064  sulfatase  30.13 
 
 
502 aa  124  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  26.54 
 
 
490 aa  123  5e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1005  sulfatase  27.41 
 
 
518 aa  123  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549789  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0165  sulfatase family protein  28.57 
 
 
501 aa  123  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0029  sulfatase  28.21 
 
 
501 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28180  arylsulfatase A family protein  27.74 
 
 
480 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0032  choline sulfatase  29.41 
 
 
503 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  26.39 
 
 
536 aa  121  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0753  sulfatase family protein  28.19 
 
 
517 aa  120  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1985  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1808  sulfatase  25.44 
 
 
511 aa  120  7e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05449  conserved hypothetical protein similar to choline sulphatase (Eurofung)  29.49 
 
 
594 aa  119  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0257615  normal  0.340962 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0484  choline sulfatase  28.19 
 
 
517 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2121  choline sulfatase  28.19 
 
 
522 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1300  arylsulfatase  28.7 
 
 
486 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0697  choline sulfatase  28.19 
 
 
522 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0993  choline sulfatase  28.19 
 
 
522 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0841  sulfatase family protein  28.19 
 
 
522 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1966  choline sulfatase  28.19 
 
 
522 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  27.77 
 
 
452 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0221  arylsulfatase  24.59 
 
 
481 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  26.14 
 
 
523 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4186  sulfatase  27.05 
 
 
519 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360689  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4484  sulfatase  28.9 
 
 
511 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2434  sulfatase  26.28 
 
 
564 aa  116  8.999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0594  putative choline sulfatase  25.27 
 
 
501 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  27.97 
 
 
497 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0237  sulfatase  25.47 
 
 
447 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.813396  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  27.97 
 
 
497 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  27.97 
 
 
497 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5075  choline-sulfatase  26.15 
 
 
512 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  hitchhiker  0.0038506 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2247  sulfatase  25.71 
 
 
501 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.466267 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  27.97 
 
 
497 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5110  sulfatase  24.48 
 
 
497 aa  114  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.36096 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0587  sulfatase  27.89 
 
 
511 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  27.14 
 
 
497 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2242  sulfatase  29.64 
 
 
512 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0496  sulfatase  25.71 
 
 
501 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.261478  normal  0.387641 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1855  choline sulfatase  27.94 
 
 
517 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250441  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3570  choline-sulfatase  27.98 
 
 
511 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3133  sulfatase  26.17 
 
 
504 aa  114  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5009  choline-sulfatase  28.61 
 
 
516 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03562  predicted sulfatase/phosphatase  24.27 
 
 
497 aa  113  9e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.678565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0025  sulfatase  24.27 
 
 
497 aa  113  9e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4043  sulfatase  24.48 
 
 
497 aa  113  9e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03505  hypothetical protein  24.27 
 
 
497 aa  113  9e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.973058  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0304  sulfatase  27.1 
 
 
497 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567268  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  25.45 
 
 
517 aa  112  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1494  sulfatase  25.55 
 
 
502 aa  112  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000530638  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1568  sulfatase  24.22 
 
 
549 aa  112  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423465  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4186  sulfatase  24.27 
 
 
497 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0564  sulfatase  25 
 
 
512 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2250  sulfatase  26.97 
 
 
478 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0764  sulfatase  27.18 
 
 
559 aa  110  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.726055  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6647  sulfatase  28.2 
 
 
476 aa  110  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.707956 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3166  sulfatase  27.27 
 
 
482 aa  110  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  26.1 
 
 
474 aa  110  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1700  sulfatase  24.89 
 
 
479 aa  110  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6149  choline-sulfatase  26.67 
 
 
503 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.989807 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1708  sulfatase  25.42 
 
 
449 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1775  sulfatase  23.26 
 
 
587 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.819016  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3323  sulfatase  25.65 
 
 
502 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1516  sulfatase  24.42 
 
 
553 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3296  sulfatase  27.1 
 
 
516 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.787928  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5790  choline-sulfatase  25.8 
 
 
504 aa  106  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5072  sulfatase  27.1 
 
 
516 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263154  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4036  sulfatase  25.89 
 
 
459 aa  106  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188862  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  26.6 
 
 
491 aa  106  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  26.11 
 
 
510 aa  106  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>