More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0891 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_0891  sulfatase  100 
 
 
565 aa  1170    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3206  sulfatase  37.79 
 
 
586 aa  326  8.000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3489  sulfatase  37.13 
 
 
535 aa  315  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2375  sulfatase family protein  34.85 
 
 
502 aa  283  4.0000000000000003e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0813491  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  33.39 
 
 
474 aa  282  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2247  sulfatase  35.96 
 
 
493 aa  278  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2358  sulfatase family protein  32.68 
 
 
499 aa  254  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  32.01 
 
 
511 aa  251  3e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  31.49 
 
 
535 aa  232  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2156  sulfatase  32.82 
 
 
487 aa  225  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3468  sulfatase  30.96 
 
 
466 aa  224  3e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1567  sulfatase  33.64 
 
 
523 aa  189  9e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0183451  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0911  choline-sulfatase  29.93 
 
 
509 aa  172  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000929958  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3290  choline-sulfatase  30.27 
 
 
513 aa  159  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2121  choline sulfatase  31.27 
 
 
522 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0697  choline sulfatase  31.27 
 
 
522 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0993  choline sulfatase  31.27 
 
 
522 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0841  sulfatase family protein  31.27 
 
 
522 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1966  choline sulfatase  31.27 
 
 
522 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0484  choline sulfatase  31.27 
 
 
517 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0753  sulfatase family protein  31.27 
 
 
517 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1985  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1855  choline sulfatase  31.23 
 
 
517 aa  152  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250441  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3570  choline-sulfatase  29.63 
 
 
511 aa  151  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5075  choline-sulfatase  29.9 
 
 
512 aa  150  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  hitchhiker  0.0038506 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0564  sulfatase  27.25 
 
 
512 aa  150  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1573  putative choline-sulfatase  29.53 
 
 
515 aa  149  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3296  sulfatase  30.58 
 
 
516 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.787928  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5072  sulfatase  30.58 
 
 
516 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263154  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5213  choline-sulfatase  30.58 
 
 
516 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6693  choline-sulfatase  26.26 
 
 
502 aa  148  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17144  normal  0.223575 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0587  sulfatase  30.71 
 
 
511 aa  148  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1005  sulfatase  29.4 
 
 
518 aa  147  5e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549789  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4484  sulfatase  30.47 
 
 
511 aa  147  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0026  sulfatase  29.07 
 
 
510 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.407954  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1574  sulfatase  30.47 
 
 
554 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5790  choline-sulfatase  28.54 
 
 
504 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5009  choline-sulfatase  30.1 
 
 
516 aa  145  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0496  sulfatase  27.55 
 
 
501 aa  144  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.261478  normal  0.387641 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3323  sulfatase  28.92 
 
 
502 aa  142  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28180  arylsulfatase A family protein  31.38 
 
 
480 aa  141  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2247  sulfatase  29.57 
 
 
501 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.466267 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0594  putative choline sulfatase  29.5 
 
 
501 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1568  sulfatase  29.79 
 
 
549 aa  140  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423465  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22600  choline-sulfatase  27.06 
 
 
520 aa  140  7e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124418  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0151  sulfatase  28.86 
 
 
473 aa  136  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.110259  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3146  sulfatase  25.6 
 
 
489 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6149  choline-sulfatase  24.25 
 
 
503 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.989807 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00380  choline sulfatase  28.57 
 
 
503 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.103488 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0165  sulfatase family protein  27.46 
 
 
501 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0032  choline sulfatase  28 
 
 
503 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6647  sulfatase  29.62 
 
 
476 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.707956 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1494  sulfatase  28.44 
 
 
502 aa  130  6e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000530638  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04770  arylsulfatase A family protein  28.22 
 
 
478 aa  130  6e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.799262  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3376  sulfatase  25.81 
 
 
509 aa  130  6e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3064  arylsulfatase A  27.38 
 
 
494 aa  130  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.886966  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2286  sulfatase  27.15 
 
 
498 aa  129  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0029  sulfatase  26.95 
 
 
501 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0093  sulfatase  27.23 
 
 
505 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0569  sulfatase  27.65 
 
 
497 aa  128  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3166  sulfatase  27.3 
 
 
482 aa  127  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0077  choline sulfatase  26.97 
 
 
505 aa  126  9e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.604146  hitchhiker  0.000459968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0093  choline-sulfatase  26.72 
 
 
505 aa  126  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000895462 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0177  sulfatase  28.27 
 
 
505 aa  126  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3133  sulfatase  27.62 
 
 
504 aa  126  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0096  choline-sulfatase  26.21 
 
 
505 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.574472  hitchhiker  0.0000926567 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0064  sulfatase  26.75 
 
 
502 aa  125  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0221  arylsulfatase  29.2 
 
 
481 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  26.87 
 
 
497 aa  124  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0214  sulfatase  28.6 
 
 
536 aa  123  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3903  sulfatase  29.45 
 
 
486 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0122  sulfatase protein  26.53 
 
 
508 aa  122  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05449  conserved hypothetical protein similar to choline sulphatase (Eurofung)  27.59 
 
 
594 aa  121  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0257615  normal  0.340962 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  26.33 
 
 
526 aa  120  7e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1300  arylsulfatase  28.75 
 
 
486 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1150  choline sulfatase  26.09 
 
 
496 aa  117  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2113  sulfatase  27.48 
 
 
572 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.367046  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3181  sulfatase  27.69 
 
 
523 aa  117  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3858  sulfatase  24.51 
 
 
519 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0969664  normal  0.154261 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5764  sulfatase  26.29 
 
 
482 aa  117  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0888  sulfatase  24.65 
 
 
517 aa  117  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000191984  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  25.55 
 
 
497 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2053  sulfatase  24.45 
 
 
523 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240603 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  26.24 
 
 
497 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1565  sulfatase  26.48 
 
 
453 aa  116  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717098  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1432  sulfatase  25.89 
 
 
522 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.209793 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3492  sulfatase  26.19 
 
 
498 aa  115  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  25.38 
 
 
497 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06030  arylsulfatase A family protein  25.36 
 
 
496 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478391  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  25.34 
 
 
501 aa  114  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  26.32 
 
 
470 aa  114  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3441  sulfatase  24.34 
 
 
511 aa  114  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0813077  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1802  sulfatase  26.54 
 
 
518 aa  113  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.389525 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4186  sulfatase  24.71 
 
 
519 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360689  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2100  sulfatase  25.5 
 
 
480 aa  113  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1580  sulfatase  24.8 
 
 
459 aa  113  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37197  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1775  sulfatase  25.17 
 
 
587 aa  113  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.819016  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  25.17 
 
 
497 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3419  sulfatase  25.05 
 
 
526 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2233  sulfatase  25.74 
 
 
511 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  25.17 
 
 
497 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>