More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2113 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2113  sulfatase  100 
 
 		 572 aa  1193    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.367046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1574  sulfatase  55.13 
 
 		 554 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1568  sulfatase  54.78 
 
 		 549 aa  580  1e-164  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0214  sulfatase  51.08 
 
 		 536 aa  504  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2053  sulfatase  45.04 
 
 		 523 aa  451  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240603 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1802  sulfatase  44.47 
 
 		 518 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.389525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2242  sulfatase  33.33 
 
 		 512 aa  245  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2519  sulfatase  29.92 
 
 		 507 aa  235  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.602817  normal  0.0521471 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3858  sulfatase  30.53 
 
 		 519 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0969664  normal  0.154261 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0122  sulfatase protein  31.14 
 
 		 508 aa  213  9e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1836  sulfatase  30.44 
 
 		 514 aa  211  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4186  sulfatase  30.02 
 
 		 519 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  28 
 
 		 526 aa  178  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6647  sulfatase  29.67 
 
 		 476 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.707956 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00380  choline sulfatase  30.94 
 
 		 503 aa  170  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.103488 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0026  sulfatase  29.62 
 
 		 510 aa  170  8e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.407954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1573  putative choline-sulfatase  31.38 
 
 		 515 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0911  choline-sulfatase  31.69 
 
 		 509 aa  169  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000929958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1173  sulfatase  26.79 
 
 		 458 aa  169  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6693  choline-sulfatase  30.18 
 
 		 502 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17144  normal  0.223575 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0587  sulfatase  31.17 
 
 		 511 aa  167  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0032  choline sulfatase  31.15 
 
 		 503 aa  167  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5764  sulfatase  31.47 
 
 		 482 aa  167  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5075  choline-sulfatase  31.03 
 
 		 512 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  hitchhiker  0.0038506 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0221  arylsulfatase  28.71 
 
 		 481 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3570  choline-sulfatase  31.13 
 
 		 511 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0484  choline sulfatase  31.52 
 
 		 517 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2121  choline sulfatase  31.52 
 
 		 522 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0697  choline sulfatase  31.52 
 
 		 522 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0993  choline sulfatase  31.52 
 
 		 522 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0841  sulfatase family protein  31.52 
 
 		 522 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0753  sulfatase family protein  31.52 
 
 		 517 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1985  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1966  choline sulfatase  31.52 
 
 		 522 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2100  sulfatase  26.21 
 
 		 480 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5213  choline-sulfatase  31.06 
 
 		 516 aa  164  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4484  sulfatase  31.13 
 
 		 511 aa  163  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1855  choline sulfatase  31.8 
 
 		 517 aa  162  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250441  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3296  sulfatase  30.86 
 
 		 516 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.787928  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5072  sulfatase  30.86 
 
 		 516 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5009  choline-sulfatase  29.77 
 
 		 516 aa  160  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06030  arylsulfatase A family protein  29.21 
 
 		 496 aa  159  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478391  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0077  choline sulfatase  30.75 
 
 		 505 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.604146  hitchhiker  0.000459968 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0096  choline-sulfatase  30.1 
 
 		 505 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.574472  hitchhiker  0.0000926567 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5790  choline-sulfatase  29.98 
 
 		 504 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0093  sulfatase  30.55 
 
 		 505 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0093  choline-sulfatase  29.33 
 
 		 505 aa  156  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000895462 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3323  sulfatase  28.54 
 
 		 502 aa  155  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0064  sulfatase  29.4 
 
 		 502 aa  155  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3146  sulfatase  29.38 
 
 		 489 aa  155  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1005  sulfatase  29.12 
 
 		 518 aa  154  5e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549789  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3290  choline-sulfatase  29.9 
 
 		 513 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1775  sulfatase  29.15 
 
 		 587 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.819016  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3133  sulfatase  28.26 
 
 		 504 aa  152  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0029  sulfatase  27.24 
 
 		 501 aa  150  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0165  sulfatase family protein  27.05 
 
 		 501 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0151  sulfatase  27.58 
 
 		 473 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.110259  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0304  sulfatase  28.82 
 
 		 497 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567268  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05449  conserved hypothetical protein similar to choline sulphatase (Eurofung)  29.44 
 
 		 594 aa  148  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0257615  normal  0.340962 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3492  sulfatase  27.2 
 
 		 498 aa  145  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1529  sulfatase  26.8 
 
 		 499 aa  143  7e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.856317  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6149  choline-sulfatase  27.13 
 
 		 503 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.989807 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  26.45 
 
 		 535 aa  138  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0564  sulfatase  27.71 
 
 		 512 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1150  choline sulfatase  27.93 
 
 		 496 aa  137  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1300  arylsulfatase  27.57 
 
 		 486 aa  136  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  26.13 
 
 		 537 aa  135  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3064  arylsulfatase A  28.01 
 
 		 494 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.886966  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3441  sulfatase  28.38 
 
 		 511 aa  132  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0813077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2247  sulfatase  26.17 
 
 		 501 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.466267 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1716  sulfatase  25.05 
 
 		 508 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0594  putative choline sulfatase  27.27 
 
 		 501 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  27.24 
 
 		 474 aa  127  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3903  sulfatase  26.28 
 
 		 486 aa  126  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0496  sulfatase  26.77 
 
 		 501 aa  126  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.261478  normal  0.387641 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1494  sulfatase  26.24 
 
 		 502 aa  125  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000530638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2286  sulfatase  25.2 
 
 		 498 aa  122  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22600  choline-sulfatase  27.56 
 
 		 520 aa  121  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124418  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3900  sulfatase  25.24 
 
 		 489 aa  120  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0891  sulfatase  27.48 
 
 		 565 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0569  sulfatase  26.88 
 
 		 497 aa  118  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2434  sulfatase  23.14 
 
 		 564 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3181  sulfatase  26.07 
 
 		 523 aa  115  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  24.7 
 
 		 501 aa  115  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2095  sulfatase  25.87 
 
 		 594 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5110  sulfatase  26.91 
 
 		 497 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.36096 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4186  sulfatase  26.32 
 
 		 497 aa  110  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03562  predicted sulfatase/phosphatase  26.1 
 
 		 497 aa  109  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.678565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0025  sulfatase  26.1 
 
 		 497 aa  109  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03505  hypothetical protein  26.1 
 
 		 497 aa  109  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.973058  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2247  sulfatase  25.65 
 
 		 493 aa  110  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2621  sulfatase  26.41 
 
 		 512 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0161574  normal  0.118013 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01140  arylsulfatase A family protein  24.67 
 
 		 483 aa  108  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3268  sulfatase  25.75 
 
 		 495 aa  108  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0376086  normal  0.666848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  24.95 
 
 		 497 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2250  sulfatase  24.14 
 
 		 478 aa  107  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1808  sulfatase  24.79 
 
 		 511 aa  107  8e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05040  arylsulfatase A family protein  23.31 
 
 		 474 aa  107  8e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7372  N-acetylglucosamine-6-sulfatase  25.85 
 
 		 513 aa  107  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.834841 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0888  sulfatase  26.13 
 
 		 517 aa  106  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000191984  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4043  sulfatase  26.8 
 
 		 497 aa  106  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>