14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1843 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1843  acid-shock protein  100 
 
 
177 aa  358  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.147127  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1336  acid-shock protein, putative  79.33 
 
 
184 aa  283  1.0000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1296  putative acid-shock protein  79.33 
 
 
179 aa  282  2.0000000000000002e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1482  acid-shock protein  33.16 
 
 
188 aa  90.9  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2341  signal transduction protein  37.63 
 
 
124 aa  48.5  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00164807  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  33.11 
 
 
209 aa  48.1  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3135  calcium-binding EF-hand  29.45 
 
 
164 aa  45.4  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.850385  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0950  signal transduction protein  34.52 
 
 
242 aa  45.4  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2496  hypothetical protein  41.43 
 
 
186 aa  45.4  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1110  hypothetical protein  35.92 
 
 
187 aa  44.3  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124565  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3224  hypothetical protein  30.91 
 
 
209 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.916377  normal  0.185991 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02173  calcium-dependent mitochondrial carrier protein, putative (Eurofung)  36.54 
 
 
580 aa  41.6  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00497794  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2148  calcium-binding EF-hand-containing protein  27.43 
 
 
143 aa  41.2  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4199  signal transduction protein  31.46 
 
 
282 aa  40.8  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>