24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2384 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2384  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  333  3.9999999999999995e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190826 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2178  hypothetical protein  26.43 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0312897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2496  hypothetical protein  36.84 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3148  hypothetical protein  26 
 
 		 143 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6104  calcium-binding protein  27.74 
 
 		 188 aa  48.5  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3135  calcium-binding EF-hand  26 
 
 		 164 aa  48.5  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.850385  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2073  signal transduction protein  32.65 
 
 		 212 aa  48.5  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0851765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1867  calcium-binding protein  27.74 
 
 		 148 aa  48.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2148  calcium-binding EF-hand-containing protein  27.88 
 
 		 143 aa  47.8  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3545  signal transduction protein  33.8 
 
 		 209 aa  47.8  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000138612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0416  calcium-binding EF-hand domain-containing protein  31.63 
 
 		 218 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  28.35 
 
 		 209 aa  45.1  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0950  signal transduction protein  24.11 
 
 		 242 aa  44.7  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0223  hypothetical protein  31.73 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.893261  normal  0.0721241 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14031  hypothetical protein  26.62 
 
 		 171 aa  44.3  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.10797 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0835  EF hand domain protein  26.55 
 
 		 144 aa  44.3  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3064  hypothetical protein  27.12 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1114  hypothetical protein  28.57 
 
 		 153 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0883796 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  31.78 
 
 		 194 aa  42  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3284  signal transduction protein  27.27 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0725465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3600  calcium-binding EF-hand-containing protein  23.53 
 
 		 202 aa  40.8  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.799604  normal  0.113193 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3938  calcium-binding EF-hand-containing protein  23.53 
 
 		 202 aa  40.8  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1228  signal transduction protein  28.75 
 
 		 145 aa  40.8  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522863  normal  0.321089 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0177  hypothetical protein  26.52 
 
 		 146 aa  40.4  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.10535  normal  0.971448 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>