23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2235 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2235  calcium-binding domain-containing protein  100 
 
 		 118 aa  228  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.538566  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4425  hypothetical protein  56.1 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4301  calcium-binding EF-hand-containing protein  66.33 
 
 		 151 aa  125  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.699333  normal  0.0950575 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1805  putative signal transduction protein with EFhand domain  68.09 
 
 		 133 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.537311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4161  Calcium-binding EF-hand-containing protein  60 
 
 		 139 aa  124  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1854  hypothetical protein  67.02 
 
 		 133 aa  122  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3604  signal transduction protein  58.82 
 
 		 137 aa  122  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0412957  hitchhiker  0.00158231 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2189  putative signal transduction protein with EFhand domain  67.02 
 
 		 133 aa  122  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.350959  normal  0.155575 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8024  Calcium-binding EF-hand-containing protein  55.91 
 
 		 134 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0823  hypothetical protein  56.7 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112496 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0271  Calcium-binding EF-hand-containing protein  52.53 
 
 		 130 aa  84  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0508826 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2815  hypothetical protein  42.22 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11305  normal  0.1713 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1986  putative signal peptide protein  34.12 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0223  hypothetical protein  41.24 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.893261  normal  0.0721241 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  36.94 
 
 		 190 aa  50.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  35.04 
 
 		 209 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  31.71 
 
 		 205 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  31.71 
 
 		 205 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5990  putative signal peptide protein  28.05 
 
 		 119 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0043  hypothetical protein  31.31 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0382289 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3284  signal transduction protein  34.58 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0725465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2148  calcium-binding EF-hand-containing protein  29.82 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03592  EF hand domain protein  31.91 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.306427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>