43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2341 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2341  signal transduction protein  100 
 
 		 124 aa  244  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0416  calcium-binding EF-hand domain-containing protein  83.33 
 
 		 218 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2073  signal transduction protein  82.41 
 
 		 212 aa  176  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0851765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2178  hypothetical protein  43.9 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0312897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3135  calcium-binding EF-hand  44.03 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.850385  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3284  signal transduction protein  41.18 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0725465  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  36.67 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  37.07 
 
 		 205 aa  62  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  37.07 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0950  signal transduction protein  35.46 
 
 		 242 aa  60.5  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3545  signal transduction protein  42.11 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000138612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  36.04 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2496  hypothetical protein  33.88 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3224  hypothetical protein  33.87 
 
 		 209 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.916377  normal  0.185991 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1482  acid-shock protein  34.21 
 
 		 188 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1336  acid-shock protein, putative  39.18 
 
 		 184 aa  52  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2968  calcium-binding EF-hand-containing protein  32.14 
 
 		 209 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0334384 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1296  putative acid-shock protein  39.18 
 
 		 179 aa  52  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3938  calcium-binding EF-hand-containing protein  37.8 
 
 		 202 aa  51.6  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3600  calcium-binding EF-hand-containing protein  37.8 
 
 		 202 aa  51.6  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.799604  normal  0.113193 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5252  putative signal transduction protein with EFhand domain  29.45 
 
 		 292 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.849425 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  35.85 
 
 		 209 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0043  hypothetical protein  36.9 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0382289 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2148  calcium-binding EF-hand-containing protein  27.52 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1843  acid-shock protein  36.46 
 
 		 177 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.147127  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0835  EF hand domain protein  32.73 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03592  EF hand domain protein  41.18 
 
 		 112 aa  47  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.306427  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5532  putative signal transduction protein with EFhand domain  29.29 
 
 		 291 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.351777  normal  0.0443001 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3184  calcium-binding EF-hand-containing protein  34.82 
 
 		 225 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53519  normal  0.491229 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1110  hypothetical protein  33.03 
 
 		 187 aa  44.7  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3064  hypothetical protein  30.91 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1266  calcium-binding EF-hand-containing protein  34.23 
 
 		 167 aa  43.9  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.567  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0757  hypothetical protein  43.84 
 
 		 203 aa  43.9  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1600  hypothetical protein  37.04 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0488  calcium-binding EF-hand  32 
 
 		 155 aa  42.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0133587  normal  0.146102 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2216  hypothetical protein  28.92 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6104  calcium-binding protein  33.62 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1867  calcium-binding protein  33.62 
 
 		 148 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_24253  predicted protein  26.32 
 
 		 479 aa  41.6  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.334979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0991  calcium-binding EF-hand-containing protein  28.68 
 
 		 194 aa  40.8  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0245104  normal  0.296766 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2633  EF hand domain-containing protein  30.63 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202488  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1489  putative signal transduction protein with EFhand domain  37.04 
 
 		 77 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4199  signal transduction protein  28.8 
 
 		 282 aa  40  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>