20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4339 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4339  putative signal transduction protein with EFhand domain  100 
 
 		 256 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.1378  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1772  calcium-binding EF-hand  65 
 
 		 254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.389103  normal  0.418687 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3688  signal transduction protein  58.25 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5331  calcium-binding domain-containing protein  55.68 
 
 		 256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0194602  normal  0.50977 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1615  calcium-binding EF-hand  63.58 
 
 		 262 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.959507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0950  signal transduction protein  42.86 
 
 		 242 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3842  putative signal transduction protein with EFhand domain  23.49 
 
 		 178 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00258503  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2163  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  38.6 
 
 		 387 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273645  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2116  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  38.6 
 
 		 387 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  42.86 
 
 		 205 aa  45.4  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3135  calcium-binding EF-hand  34.29 
 
 		 164 aa  45.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.850385  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  42.86 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02173  calcium-dependent mitochondrial carrier protein, putative (Eurofung)  35.94 
 
 		 580 aa  45.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00497794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4199  signal transduction protein  37.31 
 
 		 282 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0283  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  40 
 
 		 389 aa  43.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0438498 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1424  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  32.84 
 
 		 392 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  39.06 
 
 		 194 aa  42.7  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31546  predicted protein  33.78 
 
 		 546 aa  42.7  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.133549 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2375  calcium-binding EF-hand protein  36.23 
 
 		 169 aa  42  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.572136 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47426  predicted protein  39.34 
 
 		 490 aa  42  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.308736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>