19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2486 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2486  S-antigen family protein  100 
 
 		 467 aa  873    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.13457  normal  0.608286 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1608  hypothetical protein  33.65 
 
 		 1348 aa  127  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0984785 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0364  hypothetical protein  49.65 
 
 		 188 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02973  ice nucleation protein  37.04 
 
 		 276 aa  97.1  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2485  hypothetical protein  45.54 
 
 		 186 aa  79  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.105961  normal  0.89265 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  46.82 
 
 		 1394 aa  69.7  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0734  hypothetical protein  29.17 
 
 		 1821 aa  60.1  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1488  autotransporter (AT) family porin  33.03 
 
 		 1951 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  23.66 
 
 		 741 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2244  conserved hypothetical protein  32 
 
 		 852 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.518929  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00841  hypothetical protein  30.21 
 
 		 1584 aa  50.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  25 
 
 		 830 aa  50.1  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  22.18 
 
 		 741 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4100  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.81 
 
 		 2225 aa  49.3  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2324  hypothetical protein  41.61 
 
 		 368 aa  48.9  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0736  hypothetical protein  30.1 
 
 		 1543 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.487887  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0536  type VI secretion system Vgr family protein  23.9 
 
 		 792 aa  47  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3410  hypothetical protein  38.71 
 
 		 316 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000374357  hitchhiker  0.0017723 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  20.97 
 
 		 741 aa  44.3  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>