27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2261 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2261  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  100 
 
 		 647 aa  1339    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00906111  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07087  conserved hypothetical protein  24 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4107  Peptidase M23  25 
 
 		 588 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553591 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  32.81 
 
 		 4357 aa  51.2  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2272  peptidase M23B  36.26 
 
 		 284 aa  51.2  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2233  peptidase M23B  36.26 
 
 		 284 aa  51.2  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.467623  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  34.62 
 
 		 4433 aa  50.8  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11888  hypothetical protein  31.97 
 
 		 277 aa  49.7  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.298179  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6354  hypothetical protein  22.78 
 
 		 670 aa  48.9  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0877  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  33.01 
 
 		 3822 aa  48.5  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0168834 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2234  peptidase M23B  34.58 
 
 		 307 aa  47.8  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  hitchhiker  0.000684677 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.18 
 
 		 11716 aa  47.4  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1017  hypothetical protein  28.74 
 
 		 252 aa  47  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4572  peptidase M23B  33.05 
 
 		 995 aa  47  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1047  hypothetical protein  30.95 
 
 		 316 aa  46.2  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6142  hypothetical protein  34.41 
 
 		 299 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5480  peptidase, M23/M37 family  35.51 
 
 		 268 aa  46.2  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70780  hypothetical protein  34.41 
 
 		 299 aa  45.8  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.848669 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.68 
 
 		 603 aa  45.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5035  peptidase M23B  34.58 
 
 		 300 aa  45.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4814  putative transmembrane protein  35.16 
 
 		 757 aa  44.7  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1958  M24/M37 family peptidase  32.11 
 
 		 286 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.186178  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1742  M24/M37 family peptidase  31.82 
 
 		 286 aa  44.3  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.124078  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2558  peptidase M23B  33.33 
 
 		 351 aa  43.9  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1879  M23/37 family peptidase  31.82 
 
 		 262 aa  43.9  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5609  peptidase M23B  43.64 
 
 		 298 aa  43.9  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  31.71 
 
 		 3507 aa  43.9  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>