60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1511 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1511  surface protein  100 
 
 		 1065 aa  2148    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.36671  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01100  hypothetical protein  39.03 
 
 		 992 aa  506  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1856  hypothetical protein  30.09 
 
 		 739 aa  237  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0763554  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01090  Ig-like domain-containing protein  38.29 
 
 		 583 aa  148  6e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36540  hypothetical protein  29.86 
 
 		 324 aa  139  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2702  hypothetical protein  33.93 
 
 		 348 aa  121  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000025037  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07781  arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00650)  32.84 
 
 		 340 aa  110  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.621545 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02590  hypothetical protein  33.48 
 
 		 345 aa  108  7e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0816  endo-1,4-beta-xylanase  31.98 
 
 		 318 aa  103  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.854869  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08472  conserved hypothetical protein  30.31 
 
 		 346 aa  93.2  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.327023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14440  hypothetical protein  27.82 
 
 		 323 aa  92.8  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3438  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  25.41 
 
 		 316 aa  77.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0527524  normal  0.0695696 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  25.82 
 
 		 982 aa  74.3  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3471  hypothetical protein  26.48 
 
 		 274 aa  72.8  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  38.81 
 
 		 1821 aa  70.1  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1487  putative hyaluronoglucosaminidase  29.78 
 
 		 1172 aa  68.6  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  46.08 
 
 		 1732 aa  68.2  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  48.57 
 
 		 1048 aa  63.9  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2076  hypothetical protein  24.77 
 
 		 314 aa  62.4  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  45.88 
 
 		 1418 aa  62  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  29.17 
 
 		 644 aa  59.7  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  33.33 
 
 		 1226 aa  58.2  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  31.39 
 
 		 981 aa  57  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  42.68 
 
 		 526 aa  56.6  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2500  Ig domain-containing protein  39.39 
 
 		 1300 aa  56.6  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1971  alpha-L-arabinofuranosidase B  29.48 
 
 		 478 aa  56.2  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000055654  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3488  Ig domain protein group 2 domain protein  43.75 
 
 		 428 aa  53.9  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  45.31 
 
 		 1009 aa  53.9  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  44.62 
 
 		 4630 aa  54.3  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  40.96 
 
 		 556 aa  53.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  34.09 
 
 		 2638 aa  52.8  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1258  Subtilisin-like serine protease  49.3 
 
 		 1937 aa  51.6  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.596545  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2596  Ig domain-containing protein  33.33 
 
 		 390 aa  50.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000321445  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0685  Ig domain protein group 2 domain protein  44 
 
 		 437 aa  50.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1202  hypothetical protein  42.42 
 
 		 622 aa  50.1  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  44.09 
 
 		 1121 aa  50.1  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1660  carbohydrate binding domain/beta-xylosidase family protein  27.45 
 
 		 667 aa  49.3  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2119  hypothetical protein  28.3 
 
 		 304 aa  49.7  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  46.88 
 
 		 1831 aa  49.3  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4087  hypothetical protein  25.93 
 
 		 305 aa  49.3  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  43.01 
 
 		 1121 aa  49.3  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  44.44 
 
 		 1937 aa  48.9  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3370  Ig domain-containing protein  38.27 
 
 		 389 aa  48.9  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  25 
 
 		 1139 aa  48.5  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  44.44 
 
 		 1467 aa  48.5  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1988  hypothetical protein  45.21 
 
 		 554 aa  47.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00985126  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1301  glycosyl hydrolase family 31 protein  45.61 
 
 		 1965 aa  47.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.449133  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  42.86 
 
 		 1121 aa  46.6  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2755  hypothetical protein  33.65 
 
 		 564 aa  46.6  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0948  Ig domain-containing protein  30 
 
 		 129 aa  47  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000631459  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  32.2 
 
 		 1279 aa  45.4  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0839  Ig-like, group 2  34.94 
 
 		 983 aa  45.4  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2428  Ig domain-containing protein  34.65 
 
 		 466 aa  45.4  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.177832  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  38.1 
 
 		 1112 aa  45.1  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  40 
 
 		 600 aa  44.7  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2341  agarase  30.61 
 
 		 1171 aa  45.1  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.384937  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0881  von Willebrand factor type A  28.8 
 
 		 1077 aa  44.7  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3317  Beta-xylosidase-like  33.33 
 
 		 1174 aa  44.7  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00018095  hitchhiker  0.000000702951 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  27.27 
 
 		 436 aa  44.7  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2618  Ig domain-containing protein  32.65 
 
 		 399 aa  44.7  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000153391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>