28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4087 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4087  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  622  1e-177  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2119  hypothetical protein  61.36 
 
 
304 aa  399  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1805  hypothetical protein  60.13 
 
 
300 aa  388  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00065967  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2785  hypothetical protein  60.4 
 
 
311 aa  387  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0402448  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  41.61 
 
 
1139 aa  249  3e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4606  glycoside hydrolase family 43  31 
 
 
675 aa  135  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.337279  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3471  hypothetical protein  29.52 
 
 
274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  31.08 
 
 
982 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1856  hypothetical protein  30.88 
 
 
739 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0763554  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2023  hypothetical protein  27.19 
 
 
342 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131758  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2702  hypothetical protein  28.39 
 
 
348 aa  99.4  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000025037  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3438  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  28.19 
 
 
316 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0527524  normal  0.0695696 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2076  hypothetical protein  28.06 
 
 
314 aa  91.3  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36540  hypothetical protein  27.1 
 
 
324 aa  82.4  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0816  endo-1,4-beta-xylanase  27.53 
 
 
318 aa  72.4  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.854869  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01090  Ig-like domain-containing protein  25.68 
 
 
583 aa  72.4  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5739  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  31.28 
 
 
855 aa  70.5  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.393547  normal  0.654215 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1971  alpha-L-arabinofuranosidase B  27.15 
 
 
478 aa  70.1  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000055654  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01100  hypothetical protein  23.49 
 
 
992 aa  69.3  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14440  hypothetical protein  28.11 
 
 
323 aa  66.6  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  26.63 
 
 
644 aa  65.1  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7019  alpha-L-arabinofuranosidase B  28.33 
 
 
455 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08472  conserved hypothetical protein  24.68 
 
 
346 aa  64.7  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.327023  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02590  hypothetical protein  22.04 
 
 
345 aa  58.9  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3223  putative beta-xylosidase  24.42 
 
 
377 aa  56.6  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.222849  normal  0.126141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7065  alpha-L-arabinofuranosidase B  24.44 
 
 
445 aa  56.2  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0253597  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07781  arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00650)  24.8 
 
 
340 aa  53.1  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.621545 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1511  surface protein  25.93 
 
 
1065 aa  49.3  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.36671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>