29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1209 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1209  licheninase  100 
 
 
260 aa  542  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0812437 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2550  endo-beta-1,3-1,4-glycanase protein  98.46 
 
 
260 aa  537  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1972  glycoside hydrolase family protein  75.77 
 
 
260 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4955  glycoside hydrolase family protein  48.06 
 
 
269 aa  255  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.126867 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0648  glycoside hydrolase family protein  54.42 
 
 
253 aa  246  3e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5929  endo-1,3-1,4-beta-glycanase  46.36 
 
 
268 aa  246  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4600  glycoside hydrolase family protein  37.64 
 
 
277 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52494  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0211  glycoside hydrolase family protein  30.57 
 
 
334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00263756  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2751  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 
272 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0061  exported glycosyl hydrolase, family 16  24.2 
 
 
264 aa  67.4  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.558429  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2802  b-glucosidase  28.21 
 
 
345 aa  65.9  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.790099  normal  0.396341 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04515  putative transglycosidase, GH16 family (Eurofung)  30 
 
 
435 aa  61.6  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000384453  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  27.31 
 
 
291 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3662  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 
593 aa  56.6  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1939  glycoside hydrolase family 16  30.33 
 
 
566 aa  54.7  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000600804  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2825  glycoside hydrolase family protein  21.98 
 
 
492 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06948  putative transglycosidase, GH16 family (Eurofung)  24.6 
 
 
367 aa  50.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40512  predicted protein  29.73 
 
 
346 aa  50.4  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  29.76 
 
 
1332 aa  50.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4988  glycoside hydrolase family protein  24.27 
 
 
372 aa  49.3  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03053  putative transglycosidase, GH16 family (Eurofung)  36.76 
 
 
364 aa  47.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.736555  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  22.42 
 
 
556 aa  47  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  23.35 
 
 
883 aa  45.8  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05790  cell wall organization and biogenesis-related protein, putative  25 
 
 
376 aa  45.8  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1017  glycoside hydrolase family 16  28.96 
 
 
261 aa  45.8  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  24.89 
 
 
279 aa  45.4  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  28.79 
 
 
1321 aa  44.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4636  hypothetical protein  27.81 
 
 
287 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00933  extracellular cell wall glucanase Crf1/allergen Asp F9 (AFU_orthologue; AFUA_1G16190)  33.33 
 
 
405 aa  42.7  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0489883  normal  0.840082 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>