98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7623 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7623  hypothetical protein  100 
 
 		 619 aa  1254    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0861286  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5336  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  54.84 
 
 		 495 aa  335  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053898  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5030  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  55.97 
 
 		 479 aa  330  4e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0899  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  53.55 
 
 		 713 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1011  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  54.39 
 
 		 718 aa  317  5e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.114785 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2846  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  53.75 
 
 		 708 aa  316  8e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  56.9 
 
 		 818 aa  261  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  57.33 
 
 		 784 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  57.33 
 
 		 988 aa  258  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  55.9 
 
 		 778 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  56.52 
 
 		 1056 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  53.88 
 
 		 1056 aa  251  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  54.51 
 
 		 1022 aa  250  5e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  50.65 
 
 		 839 aa  238  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  45.09 
 
 		 629 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4352  hypothetical protein  38.42 
 
 		 486 aa  193  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1326  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.53 
 
 		 728 aa  187  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.164047  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4354  hypothetical protein  36.66 
 
 		 477 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1274  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.99 
 
 		 485 aa  180  8e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843083  normal  0.111493 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3754  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  41 
 
 		 478 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.629066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5464  caspase domain-containing protein  41.45 
 
 		 499 aa  163  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.689353 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3501  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  40.6 
 
 		 445 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1719  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.75 
 
 		 515 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1080  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  40.52 
 
 		 502 aa  160  8e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3482  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.91 
 
 		 490 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.268767 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2884  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.48 
 
 		 1155 aa  159  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158927 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4387  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  42.26 
 
 		 485 aa  158  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0766304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5561  caspase-like domain-containing protein  39.83 
 
 		 576 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7203  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.96 
 
 		 859 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0476078 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2162  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.14 
 
 		 472 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0611523 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1810  hypothetical protein  40.68 
 
 		 449 aa  154  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.3 
 
 		 554 aa  154  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2549  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.86 
 
 		 489 aa  154  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98894  normal  0.217885 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6045  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.16 
 
 		 860 aa  153  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0572  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  40.36 
 
 		 421 aa  153  8e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229301 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2462  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.41 
 
 		 649 aa  152  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10862  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0773  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.77 
 
 		 481 aa  145  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0960  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  41.1 
 
 		 862 aa  141  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.355322  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3269  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  41.26 
 
 		 828 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.336347  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1556  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.51 
 
 		 486 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388564  hitchhiker  0.00312965 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0137  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  40.89 
 
 		 915 aa  134  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.193132  normal  0.854443 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3731  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.78 
 
 		 652 aa  134  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.016109  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3182  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.19 
 
 		 1026 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4521  caspase-like domain-containing protein  38.57 
 
 		 798 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0307  hypothetical protein  36.02 
 
 		 472 aa  126  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.41 
 
 		 971 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  34.41 
 
 		 971 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2399  ICE-like protease  31.87 
 
 		 276 aa  125  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00930458  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0290  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.14 
 
 		 776 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106858  hitchhiker  0.00955586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3976  hypothetical protein  32.79 
 
 		 500 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1656  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.47 
 
 		 499 aa  115  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5502  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.61 
 
 		 813 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1335  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.91 
 
 		 522 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1009  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.14 
 
 		 528 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781757  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4069  caspase-1, p20  32.42 
 
 		 482 aa  111  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3029  peptidase C14  33.05 
 
 		 527 aa  110  8.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5158  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.62 
 
 		 474 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.927175  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3036  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.49 
 
 		 295 aa  108  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3606  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.77 
 
 		 292 aa  107  7e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0554  caspase-like domain- and TPR repeat-containing peptidase  31.02 
 
 		 518 aa  107  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0897  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.76 
 
 		 541 aa  107  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4852  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.03 
 
 		 766 aa  106  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.771827 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1734  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.65 
 
 		 570 aa  105  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.055042 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0861  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.04 
 
 		 288 aa  105  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2758  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.97 
 
 		 501 aa  105  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.224771  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0752  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.61 
 
 		 479 aa  104  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.121113 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0887  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.05 
 
 		 504 aa  104  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.389457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0910  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.94 
 
 		 553 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0031  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.22 
 
 		 442 aa  101  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0940426  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0029  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.87 
 
 		 397 aa  101  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4626  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.49 
 
 		 291 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1332  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.23 
 
 		 824 aa  99.8  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2982  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.08 
 
 		 502 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0310724 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6467  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.67 
 
 		 511 aa  99  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  31.51 
 
 		 523 aa  98.2  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  28.94 
 
 		 616 aa  97.1  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0548  putative peptidase  31.47 
 
 		 287 aa  95.5  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  27.86 
 
 		 657 aa  94  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0784  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.91 
 
 		 291 aa  93.2  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2466  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.67 
 
 		 497 aa  89.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.246743  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4686  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.68 
 
 		 289 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  27.95 
 
 		 654 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  29.78 
 
 		 535 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.51 
 
 		 798 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  30.22 
 
 		 570 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5450  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.06 
 
 		 652 aa  58.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530037  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  26.44 
 
 		 781 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0920  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.93 
 
 		 680 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.800014 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0028  hypothetical protein  30.94 
 
 		 331 aa  50.4  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.194493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5335  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.65 
 
 		 2050 aa  50.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103248 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0382  putative Chase2 sensor protein  22.07 
 
 		 783 aa  48.9  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.88 
 
 		 324 aa  47.8  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0772  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.11 
 
 		 902 aa  48.1  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.5 
 
 		 1203 aa  47.8  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2005  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.05 
 
 		 477 aa  47  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000318218  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4662  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.85 
 
 		 322 aa  44.7  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1658  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.16 
 
 		 615 aa  44.3  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0826255  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3616  hypothetical protein  28.36 
 
 		 328 aa  43.9  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.666747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>