26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1470 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1470  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 		 753 aa  1553    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5335  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.67 
 
 		 2050 aa  66.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103248 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0029  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.45 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0031  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.85 
 
 		 442 aa  55.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0940426  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1011  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.76 
 
 		 718 aa  53.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.114785 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  28.49 
 
 		 781 aa  52.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2884  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.62 
 
 		 1155 aa  52.4  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158927 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.81 
 
 		 778 aa  50.8  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2846  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.52 
 
 		 708 aa  50.1  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  28.89 
 
 		 925 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.62 
 
 		 629 aa  49.3  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0137  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25 
 
 		 915 aa  49.3  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.193132  normal  0.854443 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.25 
 
 		 798 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7203  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.62 
 
 		 859 aa  48.1  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0476078 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.38 
 
 		 839 aa  48.1  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4352  hypothetical protein  26.32 
 
 		 486 aa  48.1  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6045  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.85 
 
 		 860 aa  47.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0899  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.63 
 
 		 713 aa  47.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.87 
 
 		 1203 aa  46.6  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0773  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.62 
 
 		 481 aa  46.2  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4354  hypothetical protein  26.32 
 
 		 477 aa  46.2  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2549  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.44 
 
 		 489 aa  45.8  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98894  normal  0.217885 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1556  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.26 
 
 		 486 aa  45.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388564  hitchhiker  0.00312965 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1810  hypothetical protein  22.73 
 
 		 449 aa  44.3  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3501  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.76 
 
 		 445 aa  44.3  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5464  caspase domain-containing protein  25 
 
 		 499 aa  44.3  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.689353 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>