98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1326 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0920  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  67.25 
 
 		 680 aa  845    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.800014 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1326  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 		 728 aa  1465    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.164047  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2884  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.01 
 
 		 1155 aa  231  3e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4352  hypothetical protein  34.02 
 
 		 486 aa  179  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4354  hypothetical protein  33.42 
 
 		 477 aa  177  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5030  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  41.83 
 
 		 479 aa  171  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  41.92 
 
 		 839 aa  170  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5336  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.29 
 
 		 495 aa  162  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053898  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  43.23 
 
 		 778 aa  160  6e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5464  caspase domain-containing protein  42.33 
 
 		 499 aa  157  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.689353 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7623  hypothetical protein  41.48 
 
 		 619 aa  157  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0861286  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1274  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.26 
 
 		 485 aa  157  7e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843083  normal  0.111493 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2462  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.23 
 
 		 649 aa  157  9e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10862  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0773  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.91 
 
 		 481 aa  154  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3501  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  40.24 
 
 		 445 aa  154  7e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.29 
 
 		 554 aa  154  7e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1810  hypothetical protein  39.59 
 
 		 449 aa  153  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7203  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.95 
 
 		 859 aa  152  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0476078 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2549  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.74 
 
 		 489 aa  150  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98894  normal  0.217885 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1080  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.36 
 
 		 502 aa  150  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6045  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.27 
 
 		 860 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1011  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.12 
 
 		 718 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.114785 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5561  caspase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 576 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4387  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.73 
 
 		 485 aa  146  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0766304  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0899  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.92 
 
 		 713 aa  145  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2846  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.33 
 
 		 708 aa  145  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.91 
 
 		 818 aa  144  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.05 
 
 		 629 aa  144  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1719  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.06 
 
 		 515 aa  143  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.91 
 
 		 784 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3754  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.12 
 
 		 478 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.629066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1556  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.71 
 
 		 486 aa  142  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388564  hitchhiker  0.00312965 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.33 
 
 		 1056 aa  140  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2162  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.18 
 
 		 472 aa  140  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0611523 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.33 
 
 		 988 aa  139  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.75 
 
 		 1022 aa  137  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.89 
 
 		 1056 aa  137  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0572  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.78 
 
 		 421 aa  136  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229301 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3482  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.87 
 
 		 490 aa  127  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.268767 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  28.97 
 
 		 971 aa  126  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3029  peptidase C14  33.47 
 
 		 527 aa  126  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.97 
 
 		 971 aa  126  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1009  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.4 
 
 		 528 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781757  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2399  ICE-like protease  33.47 
 
 		 276 aa  120  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00930458  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0307  hypothetical protein  37.44 
 
 		 472 aa  119  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3182  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.47 
 
 		 1026 aa  118  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5502  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.87 
 
 		 813 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3976  hypothetical protein  31.02 
 
 		 500 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0887  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.38 
 
 		 504 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.389457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0137  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.39 
 
 		 915 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.193132  normal  0.854443 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1656  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.6 
 
 		 499 aa  110  8.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0960  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.81 
 
 		 862 aa  110  9.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.355322  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0897  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.65 
 
 		 541 aa  109  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0290  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.16 
 
 		 776 aa  108  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106858  hitchhiker  0.00955586 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0752  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.64 
 
 		 479 aa  107  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.121113 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4521  caspase-like domain-containing protein  32.24 
 
 		 798 aa  106  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3269  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.39 
 
 		 828 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.336347  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  30.84 
 
 		 616 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2758  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.28 
 
 		 501 aa  104  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.224771  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4626  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.89 
 
 		 291 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3606  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.8 
 
 		 292 aa  102  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5158  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.02 
 
 		 474 aa  102  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.927175  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0784  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.89 
 
 		 291 aa  101  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  26.33 
 
 		 657 aa  100  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3731  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.29 
 
 		 652 aa  100  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.016109  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0554  caspase-like domain- and TPR repeat-containing peptidase  33.77 
 
 		 518 aa  99.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1332  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.45 
 
 		 824 aa  99.4  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3036  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.84 
 
 		 295 aa  97.8  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2982  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.47 
 
 		 502 aa  97.4  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0310724 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1335  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.06 
 
 		 522 aa  95.1  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4852  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.82 
 
 		 766 aa  94.7  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.771827 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4686  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.36 
 
 		 289 aa  93.2  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2466  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.25 
 
 		 497 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.246743  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0861  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.98 
 
 		 288 aa  92  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0031  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.78 
 
 		 442 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0940426  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  25 
 
 		 654 aa  89.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6467  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  40.46 
 
 		 511 aa  89  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0910  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.42 
 
 		 553 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  28.63 
 
 		 535 aa  84.3  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1734  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.67 
 
 		 570 aa  82.8  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.055042 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0548  putative peptidase  32.31 
 
 		 287 aa  82.8  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  31.82 
 
 		 523 aa  80.9  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0029  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.68 
 
 		 397 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4069  caspase-1, p20  29.26 
 
 		 482 aa  75.5  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  26.74 
 
 		 570 aa  71.2  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.82 
 
 		 798 aa  65.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  32.86 
 
 		 781 aa  57  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2005  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.71 
 
 		 477 aa  53.5  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000318218  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.05 
 
 		 324 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5335  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.3 
 
 		 2050 aa  52.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103248 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5450  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.47 
 
 		 652 aa  52.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530037  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  24.87 
 
 		 925 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  26.47 
 
 		 903 aa  47.8  0.0007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0722  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.66 
 
 		 324 aa  47.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03882  metacaspase, putative (JCVI)  29.66 
 
 		 540 aa  47.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.373127  normal  0.877993 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0031  TIR protein  34.21 
 
 		 544 aa  47  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  26.05 
 
 		 900 aa  45.8  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0028  hypothetical protein  26.29 
 
 		 331 aa  45.4  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.194493 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>