70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5450 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5450  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 		 652 aa  1331    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530037  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2758  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.57 
 
 		 501 aa  76.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.224771  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2466  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 		 497 aa  73.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.246743  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1656  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.87 
 
 		 499 aa  72.8  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2982  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.27 
 
 		 502 aa  71.6  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0310724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3976  hypothetical protein  26.12 
 
 		 500 aa  70.9  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.23 
 
 		 798 aa  68.6  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6467  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.89 
 
 		 511 aa  67.8  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4852  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.82 
 
 		 766 aa  64.7  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.771827 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4069  caspase-1, p20  29.32 
 
 		 482 aa  63.9  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0031  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.93 
 
 		 442 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0940426  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0899  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.14 
 
 		 713 aa  61.6  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1734  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.47 
 
 		 570 aa  60.1  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.055042 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0029  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.2 
 
 		 397 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1011  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.75 
 
 		 718 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.114785 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2399  ICE-like protease  24.18 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00930458  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2462  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.9 
 
 		 649 aa  57  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10862  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3754  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.7 
 
 		 478 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.629066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0572  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.1 
 
 		 421 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229301 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6045  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.47 
 
 		 860 aa  55.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7203  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.74 
 
 		 859 aa  55.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0476078 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5030  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.9 
 
 		 479 aa  54.7  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4387  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.88 
 
 		 485 aa  54.7  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0766304  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  26.67 
 
 		 971 aa  54.3  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.47 
 
 		 1056 aa  54.3  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4352  hypothetical protein  25.28 
 
 		 486 aa  54.3  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1719  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.82 
 
 		 515 aa  53.9  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.33 
 
 		 971 aa  54.3  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  27.15 
 
 		 523 aa  53.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2846  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.28 
 
 		 708 aa  53.9  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.55 
 
 		 839 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4354  hypothetical protein  25.78 
 
 		 477 aa  52.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  27.08 
 
 		 636 aa  52.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7623  hypothetical protein  24.06 
 
 		 619 aa  52  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0861286  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1326  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.47 
 
 		 728 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.164047  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1274  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.84 
 
 		 485 aa  51.6  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843083  normal  0.111493 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1810  hypothetical protein  25.65 
 
 		 449 aa  52  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.21 
 
 		 818 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0920  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.47 
 
 		 680 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.800014 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.21 
 
 		 988 aa  51.2  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.17 
 
 		 554 aa  51.2  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.37 
 
 		 784 aa  50.8  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3029  peptidase C14  23.33 
 
 		 527 aa  50.8  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.47 
 
 		 1022 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0897  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.21 
 
 		 541 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0887  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.22 
 
 		 504 aa  50.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.389457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1009  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.91 
 
 		 528 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781757  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5158  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.91 
 
 		 474 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.927175  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5561  caspase-like domain-containing protein  22.79 
 
 		 576 aa  49.3  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1080  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.56 
 
 		 502 aa  49.7  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3269  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.38 
 
 		 828 aa  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.336347  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1053  GUN4 domain protein  23.14 
 
 		 670 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0234472 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5464  caspase domain-containing protein  24.82 
 
 		 499 aa  48.5  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.689353 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2884  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.28 
 
 		 1155 aa  47.4  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158927 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.97 
 
 		 1056 aa  47.4  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5336  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.14 
 
 		 495 aa  47.4  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053898  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3501  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.64 
 
 		 445 aa  47.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  28.38 
 
 		 781 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1332  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.12 
 
 		 824 aa  45.8  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1335  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.03 
 
 		 522 aa  46.6  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2549  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.91 
 
 		 489 aa  45.4  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98894  normal  0.217885 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3606  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.01 
 
 		 292 aa  45.4  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0773  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.81 
 
 		 481 aa  45.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0910  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.89 
 
 		 553 aa  45.4  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3209  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 1687 aa  44.7  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000587168 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.49 
 
 		 778 aa  44.7  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.11 
 
 		 1711 aa  44.3  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1556  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.05 
 
 		 486 aa  43.9  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388564  hitchhiker  0.00312965 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0784  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.53 
 
 		 291 aa  43.9  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2162  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28 
 
 		 472 aa  43.9  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0611523 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>