More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_0585 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_3079  YD repeat-containing protein  95.56 
 
 		 1505 aa  2834    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  37.67 
 
 		 1475 aa  721    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2694  YD repeat protein  37.44 
 
 		 1428 aa  713    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00194911  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0647  RHS Repeat family protein  92.59 
 
 		 1616 aa  2815    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0645  Rhs core protein  96.62 
 
 		 444 aa  889    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.746843 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  37.47 
 
 		 1423 aa  718    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  37.95 
 
 		 1422 aa  715    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  37.93 
 
 		 1447 aa  732    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  37.19 
 
 		 1437 aa  714    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  38.36 
 
 		 1457 aa  741    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0585  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 1600 aa  3307    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2568  YD repeat protein  38.63 
 
 		 931 aa  516  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  29.77 
 
 		 1494 aa  392  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  29.77 
 
 		 1494 aa  392  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  28.88 
 
 		 1495 aa  372  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  29.87 
 
 		 1485 aa  365  5.0000000000000005e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  29.72 
 
 		 1553 aa  358  5e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  28.6 
 
 		 1197 aa  355  5.9999999999999994e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  28.8 
 
 		 1487 aa  354  7e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  28.6 
 
 		 1541 aa  350  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  28.47 
 
 		 1541 aa  348  5e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  28.47 
 
 		 1541 aa  348  5e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  28.47 
 
 		 1381 aa  348  5e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  28.47 
 
 		 1541 aa  348  5e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  27.41 
 
 		 1527 aa  347  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  28.47 
 
 		 1541 aa  347  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  31.01 
 
 		 1488 aa  347  1e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  29.93 
 
 		 1673 aa  346  2e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  30.27 
 
 		 1518 aa  346  2e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  28.54 
 
 		 1541 aa  345  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  27.68 
 
 		 1517 aa  345  2.9999999999999997e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  30.2 
 
 		 1509 aa  345  2.9999999999999997e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  30.11 
 
 		 1679 aa  345  4e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  29.63 
 
 		 1259 aa  343  1e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  29.53 
 
 		 1528 aa  340  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  29.77 
 
 		 1639 aa  337  2e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2508  YD repeat-containing protein  27.3 
 
 		 1699 aa  332  3e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0105853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  26.9 
 
 		 1400 aa  332  4e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  27.08 
 
 		 1386 aa  329  3e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  29.73 
 
 		 1495 aa  326  3e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  27.3 
 
 		 1411 aa  325  6e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0410  YD repeat-containing protein  28 
 
 		 1189 aa  324  7e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  26.44 
 
 		 1409 aa  322  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  27.12 
 
 		 1385 aa  317  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  28.52 
 
 		 1508 aa  310  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  28.12 
 
 		 1528 aa  310  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  28.03 
 
 		 1489 aa  303  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  26.16 
 
 		 1359 aa  295  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  28.32 
 
 		 2144 aa  271  7e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  29.02 
 
 		 1614 aa  261  7e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  25.45 
 
 		 1531 aa  258  7e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  25.9 
 
 		 1419 aa  256  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  25.82 
 
 		 1379 aa  251  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  25.61 
 
 		 1410 aa  249  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  27.42 
 
 		 1576 aa  250  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  26.24 
 
 		 1547 aa  247  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  25.98 
 
 		 1527 aa  244  7e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  25.74 
 
 		 1421 aa  244  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  24.67 
 
 		 1229 aa  243  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  25.37 
 
 		 1446 aa  241  6.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  26.44 
 
 		 1550 aa  241  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  25.36 
 
 		 1140 aa  238  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  27.36 
 
 		 1362 aa  238  9e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24.23 
 
 		 1492 aa  235  6e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  26.33 
 
 		 1520 aa  234  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  25.86 
 
 		 1568 aa  234  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  25.55 
 
 		 1551 aa  234  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  26.49 
 
 		 1572 aa  229  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  25.36 
 
 		 1418 aa  228  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  24.43 
 
 		 1466 aa  228  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  26.84 
 
 		 1586 aa  226  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  25.26 
 
 		 1402 aa  226  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  25.22 
 
 		 1390 aa  224  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  26.84 
 
 		 1595 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  26.73 
 
 		 1560 aa  216  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  27.39 
 
 		 866 aa  214  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  26.57 
 
 		 1609 aa  214  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  25.93 
 
 		 1573 aa  213  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  25.25 
 
 		 1434 aa  212  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  25.09 
 
 		 1611 aa  213  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  24.67 
 
 		 1583 aa  206  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  28.61 
 
 		 924 aa  206  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  25.21 
 
 		 867 aa  202  5e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24.33 
 
 		 1552 aa  202  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  24.19 
 
 		 1530 aa  201  7e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  24.33 
 
 		 1543 aa  200  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  24.65 
 
 		 1593 aa  198  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  26.13 
 
 		 855 aa  196  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  25.32 
 
 		 1554 aa  192  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  24.87 
 
 		 1348 aa  190  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6418  YD repeat-containing protein  23.7 
 
 		 1368 aa  188  6e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0100911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0145  YD repeat protein  39.29 
 
 		 361 aa  186  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  24.57 
 
 		 1604 aa  181  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  24.78 
 
 		 1602 aa  175  5.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  25.51 
 
 		 1579 aa  170  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  25.51 
 
 		 1428 aa  170  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  27.16 
 
 		 2149 aa  169  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  22.72 
 
 		 2096 aa  169  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  24.83 
 
 		 1429 aa  166  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  22.23 
 
 		 2035 aa  166  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>