80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2321 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2321  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 500 aa  1033    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0122033  normal  0.914801 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2320  YD repeat-containing protein  56.4 
 
 		 508 aa  534  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0339952  normal  0.953507 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20510  hypothetical protein  43.16 
 
 		 324 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829879  normal  0.312494 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32840  hypothetical protein  44.3 
 
 		 317 aa  253  6e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00770451  hitchhiker  0.000240628 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32850  hypothetical protein  41.62 
 
 		 338 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.367921  hitchhiker  0.000249189 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  34.13 
 
 		 1381 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2445  YD repeat-containing protein  29.09 
 
 		 526 aa  156  8e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6263  YD repeat-containing protein  31.14 
 
 		 939 aa  154  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2444  Rhs family protein-like protein  30.08 
 
 		 661 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02144  putative RHS-related transmembrane protein  28.64 
 
 		 863 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05538  putative RHS-related protein  30.24 
 
 		 818 aa  134  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.252151  normal  0.640714 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2470  rhs-related protein  27.4 
 
 		 890 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2453  YD repeat-containing protein  26.03 
 
 		 1177 aa  124  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_003296  RS00947  putative RHS-related protein  33.21 
 
 		 499 aa  123  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.55464  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00945  rhs-related protein  28.42 
 
 		 587 aa  114  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.68449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6258  YD repeat-containing protein  27.43 
 
 		 509 aa  91.3  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207507  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00943  rhs-related protein  26.13 
 
 		 681 aa  90.9  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  26.6 
 
 		 1577 aa  90.9  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5044  YD repeat protein  24.65 
 
 		 820 aa  89.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.928216  normal  0.520262 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4158  YD repeat-containing protein  30.85 
 
 		 1198 aa  86.3  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.529985 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  24.63 
 
 		 1467 aa  85.9  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0016  YD repeat protein  25.62 
 
 		 1074 aa  73.2  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15112  hitchhiker  0.0000418837 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  24.45 
 
 		 2035 aa  70.5  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00577  RhsD protein  30.11 
 
 		 683 aa  67  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2598  YD repeat-containing protein  24.49 
 
 		 802 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000325868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1963  YD repeat-containing protein  23.26 
 
 		 781 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0257216  decreased coverage  0.00891251 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  26.23 
 
 		 1579 aa  62.8  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  26.32 
 
 		 1892 aa  62.4  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  26.3 
 
 		 1428 aa  62  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00941  rhs-related protein  23.43 
 
 		 881 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.882809 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  22.79 
 
 		 1259 aa  56.2  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  24.25 
 
 		 2149 aa  56.6  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  23.72 
 
 		 1953 aa  55.5  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  23.74 
 
 		 1352 aa  54.7  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  22.14 
 
 		 1495 aa  54.3  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  23.43 
 
 		 1433 aa  53.9  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  23.9 
 
 		 1197 aa  53.5  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  24.48 
 
 		 1576 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  23.26 
 
 		 1359 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  22.49 
 
 		 1485 aa  51.6  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  22.42 
 
 		 1959 aa  51.6  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  26.79 
 
 		 1614 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  21.89 
 
 		 1421 aa  50.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  23.02 
 
 		 1840 aa  50.4  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00354  putative RHS-related transmembrane protein  41.46 
 
 		 1368 aa  50.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  24.43 
 
 		 1531 aa  49.7  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  32.86 
 
 		 1710 aa  48.9  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  24.9 
 
 		 1434 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  26.64 
 
 		 913 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  25.44 
 
 		 1390 aa  48.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  25.44 
 
 		 1418 aa  48.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  23.6 
 
 		 1620 aa  47.8  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00283  RhsD protein  30.77 
 
 		 613 aa  47.4  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333499  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1691a  wall-associated protein precursor  25.42 
 
 		 1987 aa  47  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  27.21 
 
 		 2277 aa  47  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  22.74 
 
 		 1669 aa  47  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  22.11 
 
 		 1437 aa  47  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  22.32 
 
 		 1410 aa  47  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  25.18 
 
 		 889 aa  47  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  21.48 
 
 		 2096 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  20.26 
 
 		 1553 aa  46.6  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  23.83 
 
 		 3193 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1923  peptidoglycan-binding LysM  23.83 
 
 		 5189 aa  46.6  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3683  peptidoglycan-binding LysM  23.77 
 
 		 5236 aa  46.2  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  25.18 
 
 		 903 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  31.58 
 
 		 1609 aa  45.8  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  25.25 
 
 		 3689 aa  45.8  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  25.09 
 
 		 1402 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  31.91 
 
 		 1602 aa  45.1  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  33.78 
 
 		 1654 aa  45.1  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4580  YD repeat protein  24.37 
 
 		 1401 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  30.49 
 
 		 1466 aa  44.3  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  40.48 
 
 		 867 aa  44.3  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0468  YD repeat-containing protein  25 
 
 		 1090 aa  43.9  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  24.44 
 
 		 1362 aa  43.9  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  26.94 
 
 		 1599 aa  43.9  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2647  YD repeat-containing protein  20.98 
 
 		 934 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217872  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  20.32 
 
 		 1917 aa  43.5  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  20.98 
 
 		 1551 aa  43.5  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2290  YD repeat protein  23.26 
 
 		 6272 aa  43.5  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>