233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1691a on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009727  CBUD_1691a  wall-associated protein precursor  100 
 
 		 1987 aa  4118    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2290  YD repeat protein  25.1 
 
 		 6272 aa  177  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3683  peptidoglycan-binding LysM  24.7 
 
 		 5236 aa  128  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1923  peptidoglycan-binding LysM  24.28 
 
 		 5189 aa  120  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  25.09 
 
 		 2096 aa  105  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  24.22 
 
 		 3027 aa  103  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  23.52 
 
 		 1271 aa  102  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  25.05 
 
 		 2144 aa  97.8  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  27.88 
 
 		 2149 aa  92  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  23.65 
 
 		 2035 aa  91.3  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  22.4 
 
 		 1352 aa  90.5  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  24.2 
 
 		 1485 aa  86.3  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  22.83 
 
 		 1197 aa  86.3  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  24.31 
 
 		 1595 aa  85.1  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  25.43 
 
 		 1614 aa  85.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  24.44 
 
 		 1586 aa  83.2  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  24.25 
 
 		 2277 aa  82.8  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  26.87 
 
 		 1530 aa  82  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  22.2 
 
 		 1543 aa  82  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  22.2 
 
 		 1552 aa  81.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  24.38 
 
 		 1576 aa  80.9  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  26 
 
 		 3689 aa  80.1  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  28.14 
 
 		 1586 aa  80.1  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  25.24 
 
 		 1428 aa  76.3  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  25.24 
 
 		 1579 aa  76.3  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  26.21 
 
 		 1600 aa  76.3  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  23.26 
 
 		 1572 aa  75.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  21.87 
 
 		 1593 aa  75.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6111  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  27.67 
 
 		 1558 aa  75.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.25246 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  24.85 
 
 		 1348 aa  74.7  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  26.86 
 
 		 1573 aa  73.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  25.04 
 
 		 1508 aa  73.6  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  24.11 
 
 		 1390 aa  73.2  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  24.85 
 
 		 1560 aa  72.8  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  25.29 
 
 		 1654 aa  72.4  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  29.41 
 
 		 1317 aa  72.4  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  26.88 
 
 		 1528 aa  72  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  21.87 
 
 		 1485 aa  72  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  26.13 
 
 		 1489 aa  71.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00283  RhsD protein  25.24 
 
 		 613 aa  71.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333499  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  24.24 
 
 		 1626 aa  70.5  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  25.05 
 
 		 1359 aa  70.1  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_003296  RS05538  putative RHS-related protein  24.37 
 
 		 818 aa  69.7  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.252151  normal  0.640714 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3113  YD repeat protein  25.45 
 
 		 1426 aa  69.3  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.637043  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  29.35 
 
 		 1547 aa  68.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  29.78 
 
 		 1509 aa  68.6  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  30.32 
 
 		 1319 aa  68.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  27.36 
 
 		 1599 aa  68.2  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  22.87 
 
 		 1422 aa  67.4  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2951  RhsD protein  24.5 
 
 		 1539 aa  67  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00448  rhsD element protein  25.45 
 
 		 1426 aa  67  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00453  hypothetical protein  25.45 
 
 		 1426 aa  67  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0412  YD repeat-containing protein  22.89 
 
 		 342 aa  66.2  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0858889  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  24.42 
 
 		 1447 aa  66.6  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  22.87 
 
 		 1434 aa  66.6  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1609  YD repeat-containing protein  22.89 
 
 		 348 aa  66.2  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1792  YD repeat-containing protein  22.89 
 
 		 348 aa  66.2  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.227953  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0462  YD repeat-containing protein  22.89 
 
 		 352 aa  66.2  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.756225  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  24.24 
 
 		 1609 aa  65.9  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  23.41 
 
 		 1539 aa  65.9  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01414  rhsE element core protein RshE  25.45 
 
 		 1200 aa  65.1  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0536  RhsD protein precursor  24.85 
 
 		 1429 aa  65.1  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  24.37 
 
 		 1620 aa  65.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  26.9 
 
 		 1541 aa  65.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01426  hypothetical protein  25.45 
 
 		 1216 aa  65.5  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2201  YD repeat-containing protein  25.15 
 
 		 1268 aa  65.5  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  25.68 
 
 		 1541 aa  65.1  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  25.68 
 
 		 1541 aa  65.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  25.68 
 
 		 1541 aa  65.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  24.36 
 
 		 3273 aa  65.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2107  YD repeat protein  26.75 
 
 		 1681 aa  64.7  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  23.57 
 
 		 1517 aa  64.7  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  24.7 
 
 		 1959 aa  64.3  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  24.16 
 
 		 1518 aa  64.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0601  RHS Repeat family protein  24.85 
 
 		 1398 aa  63.9  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  25.68 
 
 		 1541 aa  63.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  25.68 
 
 		 1381 aa  63.5  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  27.36 
 
 		 1362 aa  63.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  25.68 
 
 		 1541 aa  63.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00354  putative RHS-related transmembrane protein  27.4 
 
 		 1368 aa  63.2  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  21.58 
 
 		 1840 aa  62.8  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  25.64 
 
 		 2731 aa  62.8  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1639  protein rhsD, truncation  24.24 
 
 		 1405 aa  62.8  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  24.46 
 
 		 1494 aa  62.8  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  24.46 
 
 		 1494 aa  62.8  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0647  RHS Repeat family protein  22.61 
 
 		 1616 aa  62.4  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  27.24 
 
 		 913 aa  62  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  21.6 
 
 		 1446 aa  62  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2647  YD repeat-containing protein  28.36 
 
 		 934 aa  61.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217872  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  25.07 
 
 		 1527 aa  62  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3796  YD repeat-containing protein  25.46 
 
 		 422 aa  62  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.982597  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00947  putative RHS-related protein  22.89 
 
 		 499 aa  60.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.55464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4092  protein rhsB precursor  29.28 
 
 		 1411 aa  61.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.576153  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  23.98 
 
 		 1429 aa  61.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2065  protein rhsD  25.32 
 
 		 1400 aa  61.6  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.595023 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  24.93 
 
 		 1550 aa  61.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  28.36 
 
 		 1551 aa  61.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  23.37 
 
 		 1259 aa  61.6  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  25.78 
 
 		 1942 aa  61.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  25.12 
 
 		 924 aa  61.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>