161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_4267 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1457  YD repeat-containing protein  38.45 
 
 		 1423 aa  830    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0132  YD repeat-containing protein  34.8 
 
 		 1422 aa  682    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4267  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 1562 aa  3225    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4406  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 1562 aa  3225    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2953  YD repeat-containing protein  27.44 
 
 		 1127 aa  214  9e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000628016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0129  Rhs family protein  22.62 
 
 		 1427 aa  194  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0205  hypothetical protein  80.61 
 
 		 130 aa  159  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04849  RhsD protein  25.88 
 
 		 917 aa  121  9e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0148662  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04723  RhsD protein  26.03 
 
 		 920 aa  117  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.370413  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  25.04 
 
 		 1577 aa  107  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  25.08 
 
 		 1840 aa  105  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  24.96 
 
 		 1942 aa  103  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  25.28 
 
 		 1669 aa  103  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  25.36 
 
 		 1917 aa  101  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  27.25 
 
 		 1381 aa  99.4  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00576  RhsD protein  28.78 
 
 		 613 aa  96.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  24.05 
 
 		 1433 aa  96.3  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2453  YD repeat-containing protein  24.3 
 
 		 1177 aa  92  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  26.64 
 
 		 788 aa  91.3  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  26.64 
 
 		 788 aa  91.3  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2292  hypothetical protein  30.63 
 
 		 347 aa  89  7e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4158  YD repeat-containing protein  23.58 
 
 		 1198 aa  88.6  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.529985 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  23.84 
 
 		 3073 aa  87  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  22.72 
 
 		 1626 aa  84.7  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  25.05 
 
 		 2117 aa  83.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05537  putative RHS-related protein  24.51 
 
 		 764 aa  82  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.285743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  22.78 
 
 		 1271 aa  82  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  26.1 
 
 		 1467 aa  81.6  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  25.86 
 
 		 889 aa  80.5  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  25.43 
 
 		 903 aa  78.6  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  26.4 
 
 		 2096 aa  77.8  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  23.64 
 
 		 3027 aa  77  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  23.51 
 
 		 1834 aa  75.9  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  24.75 
 
 		 741 aa  75.1  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0197  Rhs family protein-like protein  24.85 
 
 		 2413 aa  72.4  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05526  putative RHS-related protein  23.79 
 
 		 705 aa  72  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  22.36 
 
 		 1517 aa  72  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1945  YD repeat-containing protein  24.7 
 
 		 605 aa  72  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  24.04 
 
 		 927 aa  70.9  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  22.63 
 
 		 2035 aa  70.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  23.54 
 
 		 1620 aa  70.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_003296  RS00940  rhs-related protein  26 
 
 		 468 aa  69.3  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.70443 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  25.17 
 
 		 690 aa  66.6  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  25.21 
 
 		 1352 aa  66.6  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  22.78 
 
 		 2017 aa  66.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  25.42 
 
 		 678 aa  66.2  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  23.8 
 
 		 1528 aa  66.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  23.04 
 
 		 2277 aa  65.9  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  23.74 
 
 		 1517 aa  65.5  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1124  YD repeat-containing protein  25.58 
 
 		 2401 aa  65.5  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1180  YD repeat-containing protein  25.58 
 
 		 2437 aa  65.5  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.265366 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  26.33 
 
 		 738 aa  65.1  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1143  YD repeat protein  24.52 
 
 		 1991 aa  64.7  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0172483 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  24.21 
 
 		 1600 aa  63.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  25.25 
 
 		 3273 aa  63.9  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  23.45 
 
 		 1485 aa  62.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2152  YD repeat protein  24.19 
 
 		 1912 aa  62  0.00000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0482725 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  21.42 
 
 		 1595 aa  62  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  24.1 
 
 		 913 aa  61.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0983  YD repeat protein  24.19 
 
 		 1929 aa  61.6  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.474988  normal  0.984855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  26.1 
 
 		 1508 aa  60.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  21.42 
 
 		 1586 aa  61.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  23.1 
 
 		 1599 aa  61.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  21.04 
 
 		 1614 aa  61.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  22.16 
 
 		 1732 aa  60.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3898  YD repeat-containing protein  24.6 
 
 		 2283 aa  60.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00354  putative RHS-related transmembrane protein  27.66 
 
 		 1368 aa  59.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  22.39 
 
 		 2149 aa  59.7  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  23.83 
 
 		 1576 aa  59.3  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  26.52 
 
 		 628 aa  59.3  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  23.29 
 
 		 3689 aa  58.9  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6418  YD repeat-containing protein  21.71 
 
 		 1368 aa  56.6  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0100911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  22.28 
 
 		 1384 aa  56.2  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4284  YD repeat-containing protein  29.76 
 
 		 1687 aa  56.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  26.27 
 
 		 2942 aa  56.6  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4111  YD repeat-containing protein  29.76 
 
 		 1687 aa  56.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2031  YD repeat-containing protein  23.69 
 
 		 2402 aa  56.6  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.063176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  22.38 
 
 		 1489 aa  56.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02144  putative RHS-related transmembrane protein  25.24 
 
 		 863 aa  55.8  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  19.12 
 
 		 1362 aa  55.5  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  21.09 
 
 		 1485 aa  55.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  22.83 
 
 		 1530 aa  53.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  26.29 
 
 		 2294 aa  54.7  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  23.77 
 
 		 1259 aa  53.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  21.92 
 
 		 1464 aa  53.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  22.04 
 
 		 1379 aa  53.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  25.24 
 
 		 1547 aa  53.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  24.13 
 
 		 2510 aa  53.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  26.02 
 
 		 1609 aa  52.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6268  YD repeat-containing protein  26.28 
 
 		 1623 aa  52.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2065  protein rhsD  24.72 
 
 		 1400 aa  52.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.595023 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2224  YD repeat-containing protein  23.24 
 
 		 2494 aa  52.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2470  rhs-related protein  23.37 
 
 		 890 aa  52.8  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2165  YD repeat-containing protein  23.44 
 
 		 2448 aa  52.8  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  25.69 
 
 		 2731 aa  52.8  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0601  RHS Repeat family protein  25.39 
 
 		 1398 aa  52.4  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  28.02 
 
 		 2224 aa  52  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  28.02 
 
 		 2224 aa  52  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  23.8 
 
 		 1572 aa  52  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  23.62 
 
 		 1611 aa  51.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>