144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1457 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0132  YD repeat-containing protein  50.17 
 
 		 1422 aa  831    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4267  YD repeat-containing protein  39.71 
 
 		 1562 aa  823    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4406  YD repeat-containing protein  39.71 
 
 		 1562 aa  823    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1457  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 1423 aa  2925    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2953  YD repeat-containing protein  24.7 
 
 		 1127 aa  196  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000628016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0129  Rhs family protein  25.64 
 
 		 1427 aa  153  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0205  hypothetical protein  61.7 
 
 		 130 aa  122  6e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4158  YD repeat-containing protein  26.13 
 
 		 1198 aa  110  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.529985 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04849  RhsD protein  25.48 
 
 		 917 aa  100  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0148662  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  26.37 
 
 		 1577 aa  99.4  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  24.07 
 
 		 1433 aa  98.6  8e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04723  RhsD protein  25.24 
 
 		 920 aa  97.1  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.370413  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  25.35 
 
 		 1381 aa  96.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2292  hypothetical protein  30.29 
 
 		 347 aa  93.2  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  24.24 
 
 		 927 aa  92.8  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  25.64 
 
 		 3073 aa  89.4  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  25.4 
 
 		 1271 aa  89  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  25.24 
 
 		 2277 aa  86.3  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2453  YD repeat-containing protein  25.45 
 
 		 1177 aa  84  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  25.38 
 
 		 1517 aa  82  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  27.47 
 
 		 2096 aa  81.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  24.57 
 
 		 1467 aa  80.9  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0197  Rhs family protein-like protein  24.24 
 
 		 2413 aa  79.3  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00576  RhsD protein  27.44 
 
 		 613 aa  79  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  25.04 
 
 		 1834 aa  77.4  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  24.94 
 
 		 690 aa  77.4  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  26.78 
 
 		 3273 aa  77  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  24.46 
 
 		 2017 aa  76.3  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  23.54 
 
 		 738 aa  75.5  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  25.25 
 
 		 1352 aa  75.1  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  24.18 
 
 		 889 aa  72.8  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  24.18 
 
 		 903 aa  72  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1945  YD repeat-containing protein  24.23 
 
 		 605 aa  71.6  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  24.38 
 
 		 1942 aa  71.2  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05537  putative RHS-related protein  25.1 
 
 		 764 aa  70.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.285743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  24.79 
 
 		 1917 aa  69.7  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  23.2 
 
 		 2117 aa  68.6  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  24.17 
 
 		 1669 aa  68.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  24.71 
 
 		 741 aa  67.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05526  putative RHS-related protein  25.9 
 
 		 705 aa  66.6  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  24.21 
 
 		 2035 aa  66.2  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  27.44 
 
 		 1609 aa  66.6  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  23.97 
 
 		 913 aa  65.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  25.1 
 
 		 788 aa  65.1  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  25.1 
 
 		 788 aa  65.1  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2152  YD repeat protein  23.9 
 
 		 1912 aa  63.9  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0482725 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0983  YD repeat protein  23.9 
 
 		 1929 aa  63.5  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.474988  normal  0.984855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  24.04 
 
 		 1489 aa  63.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00940  rhs-related protein  26.29 
 
 		 468 aa  61.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.70443 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2224  YD repeat-containing protein  26.69 
 
 		 2494 aa  60.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  23.34 
 
 		 1626 aa  60.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  22.85 
 
 		 1840 aa  60.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  24.08 
 
 		 3193 aa  57.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4284  YD repeat-containing protein  28.4 
 
 		 1687 aa  57.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  26.1 
 
 		 1600 aa  57.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  23.55 
 
 		 2149 aa  57.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0735  YD repeat protein  25.82 
 
 		 1938 aa  55.8  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.206584  normal  0.0550996 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4111  YD repeat-containing protein  28.02 
 
 		 1687 aa  55.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  22.95 
 
 		 2294 aa  55.5  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  23.92 
 
 		 1319 aa  55.5  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5146  YD repeat-containing protein  24.41 
 
 		 2374 aa  55.5  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  24.51 
 
 		 1317 aa  55.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  24.32 
 
 		 2350 aa  54.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0201  hypothetical protein  29.28 
 
 		 722 aa  53.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2951  RhsD protein  22.86 
 
 		 1539 aa  53.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  25.1 
 
 		 1508 aa  53.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  22.67 
 
 		 2497 aa  53.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  22.86 
 
 		 1539 aa  52.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1180  YD repeat-containing protein  24.9 
 
 		 2437 aa  52.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.265366 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  26.36 
 
 		 1485 aa  52.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  25.91 
 
 		 1710 aa  52.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1124  YD repeat-containing protein  24.9 
 
 		 2401 aa  52.4  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3898  YD repeat-containing protein  24.7 
 
 		 2283 aa  52.4  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1603  YD repeat protein  23.65 
 
 		 840 aa  52.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002889  Rhs family protein  28.51 
 
 		 2416 aa  52  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  25.8 
 
 		 2225 aa  51.2  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  22.29 
 
 		 3027 aa  51.2  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2031  YD repeat-containing protein  24.57 
 
 		 2402 aa  51.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.063176 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1615  Rhs1 protein  23.13 
 
 		 1150 aa  50.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0168  Rhs1 protein  23.13 
 
 		 1150 aa  50.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07080  hypothetical protein  27.59 
 
 		 2428 aa  50.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  24.59 
 
 		 2224 aa  50.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  24.42 
 
 		 1390 aa  50.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6418  YD repeat-containing protein  23.28 
 
 		 1368 aa  50.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0100911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  22.68 
 
 		 1384 aa  50.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2694  YD repeat protein  27.61 
 
 		 1428 aa  50.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00194911  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2048  YD repeat-containing protein  23.16 
 
 		 972 aa  50.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  20.56 
 
 		 1487 aa  50.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_003296  RS00354  putative RHS-related transmembrane protein  24.65 
 
 		 1368 aa  49.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0507  FG-GAP/YD repeat-containing protein  24.85 
 
 		 2032 aa  49.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584165  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0145  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  22.52 
 
 		 1150 aa  49.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  22.7 
 
 		 1464 aa  50.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  22.42 
 
 		 1518 aa  49.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  23.64 
 
 		 1390 aa  49.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1310  YD repeat protein  24.91 
 
 		 2387 aa  49.3  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  27.61 
 
 		 1447 aa  49.3  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1667  YD repeat-containing protein  23.41 
 
 		 1199 aa  49.3  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.620432 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  24.17 
 
 		 1259 aa  48.9  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3503  YD repeat protein  23.41 
 
 		 2145 aa  48.5  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  22.24 
 
 		 1959 aa  48.9  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>