61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1602 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3067  YD repeat protein  64.23 
 
 		 2003 aa  868    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1602  hypothetical protein  100 
 
 		 753 aa  1568    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2663  hypothetical protein  55.49 
 
 		 702 aa  563  1.0000000000000001e-159  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.638234  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1036  AmoP  55.06 
 
 		 1882 aa  548  1e-155  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.678372  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1600  hypothetical protein  68.98 
 
 		 607 aa  486  1e-136  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2107  YD repeat protein  24.34 
 
 		 1681 aa  85.5  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2045  YD repeat-containing protein  25.23 
 
 		 740 aa  72.4  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8866  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  25 
 
 		 1464 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2048  YD repeat-containing protein  27.38 
 
 		 972 aa  70.5  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2106  hypothetical protein  28 
 
 		 335 aa  69.3  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2050  YD repeat-containing protein  27.24 
 
 		 1935 aa  67.8  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  24.3 
 
 		 690 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2046  YD repeat-containing protein  26.83 
 
 		 909 aa  66.6  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  27.35 
 
 		 1600 aa  64.3  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  25.76 
 
 		 451 aa  61.2  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  23.15 
 
 		 1599 aa  60.5  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  23 
 
 		 927 aa  58.9  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  24.68 
 
 		 1409 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  29.74 
 
 		 1008 aa  57  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  29.74 
 
 		 1008 aa  57  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1143  YD repeat protein  27.45 
 
 		 1991 aa  56.6  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0172483 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  24.75 
 
 		 1485 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  24.64 
 
 		 867 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  24.58 
 
 		 1840 aa  55.1  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0983  YD repeat protein  27.62 
 
 		 1929 aa  54.7  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.474988  normal  0.984855 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  23.9 
 
 		 866 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  24.6 
 
 		 1942 aa  54.7  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  23.81 
 
 		 1669 aa  53.9  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  23.08 
 
 		 1917 aa  53.5  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  21.92 
 
 		 1352 aa  53.9  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2152  YD repeat protein  27.13 
 
 		 1912 aa  53.5  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0482725 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3067  hypothetical protein  25.78 
 
 		 2801 aa  53.5  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14527 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  22.76 
 
 		 869 aa  52.8  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  23.23 
 
 		 1710 aa  52  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2525  YD repeat-containing protein  24.61 
 
 		 561 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.949888 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  29.13 
 
 		 1345 aa  50.8  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  29.13 
 
 		 1345 aa  50.8  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0159  insecticidal toxin complex protein TcdB2  23.87 
 
 		 2417 aa  50.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.163635  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  22.08 
 
 		 1384 aa  50.4  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  24.2 
 
 		 913 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  28.47 
 
 		 2277 aa  49.3  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  23.24 
 
 		 1385 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0177  insecticidal toxin complex protein TcdB2  23.67 
 
 		 2458 aa  48.9  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  22.81 
 
 		 1400 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3469  hypothetical protein  28.28 
 
 		 364 aa  48.5  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1145  hypothetical protein  26.06 
 
 		 535 aa  48.1  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0989818  hitchhiker  0.0000170395 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4988  YD repeat-containing protein  23.24 
 
 		 480 aa  48.1  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  26.25 
 
 		 903 aa  48.1  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  23.39 
 
 		 1576 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0437  YD repeat-containing protein  23.71 
 
 		 598 aa  47.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161008 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0735  YD repeat protein  26.1 
 
 		 1938 aa  47.4  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.206584  normal  0.0550996 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6111  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  22.52 
 
 		 1558 aa  47.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.25246 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  23.04 
 
 		 1411 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  22.82 
 
 		 1547 aa  46.6  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0998  YD repeat-containing protein  24.83 
 
 		 2558 aa  46.6  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  24.4 
 
 		 2942 aa  45.4  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  21.79 
 
 		 1595 aa  45.4  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0036  YD repeat protein  24.64 
 
 		 1957 aa  45.1  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.13873 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  21.79 
 
 		 1586 aa  44.7  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  24.45 
 
 		 2658 aa  44.7  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  25 
 
 		 2221 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>