More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0131 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_3017  YD repeat-containing protein  59.73 
 
 		 1149 aa  1337    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0145  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  91.74 
 
 		 1150 aa  2193    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1615  Rhs1 protein  91.65 
 
 		 1150 aa  2190    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6684  YD repeat-containing protein  59.64 
 
 		 1149 aa  1333    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0131  Rhs1 protein  100 
 
 		 1150 aa  2352    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.462528  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0168  Rhs1 protein  91.91 
 
 		 1150 aa  2196    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  32.3 
 
 		 1410 aa  513  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  34.01 
 
 		 1359 aa  508  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  30.87 
 
 		 1402 aa  484  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  30.77 
 
 		 1390 aa  483  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  30.68 
 
 		 1418 aa  477  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  30.19 
 
 		 1411 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  29.64 
 
 		 1409 aa  445  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  29.68 
 
 		 1386 aa  435  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  30.05 
 
 		 1385 aa  432  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  29.94 
 
 		 1400 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  29.19 
 
 		 1229 aa  428  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  29.36 
 
 		 1379 aa  420  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  28.32 
 
 		 1419 aa  381  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  28.15 
 
 		 1421 aa  353  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  27.8 
 
 		 1446 aa  334  5e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  29.92 
 
 		 1568 aa  334  7.000000000000001e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  29.33 
 
 		 1531 aa  330  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  27.13 
 
 		 1140 aa  327  8.000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  29.15 
 
 		 867 aa  300  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  27.79 
 
 		 1530 aa  293  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  31.17 
 
 		 855 aa  289  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  29.13 
 
 		 866 aa  285  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  27.57 
 
 		 1485 aa  268  4e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  25.56 
 
 		 1348 aa  266  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  29.92 
 
 		 924 aa  266  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  26.81 
 
 		 1362 aa  263  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  26.83 
 
 		 1554 aa  261  7e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  25.32 
 
 		 1197 aa  260  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  26.53 
 
 		 1508 aa  258  6e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  26.21 
 
 		 1614 aa  258  6e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  25.46 
 
 		 1520 aa  257  7e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  25.74 
 
 		 1547 aa  255  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  25.57 
 
 		 1576 aa  255  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  24.98 
 
 		 1550 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  24.76 
 
 		 1527 aa  253  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  24.53 
 
 		 1572 aa  253  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  24.54 
 
 		 1551 aa  249  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  28.22 
 
 		 1488 aa  247  8e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  24.26 
 
 		 1654 aa  247  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  26.51 
 
 		 1586 aa  244  6e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  24.91 
 
 		 1611 aa  243  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  26.76 
 
 		 1595 aa  239  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  25.86 
 
 		 1560 aa  238  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  26.29 
 
 		 1528 aa  236  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  26.38 
 
 		 1583 aa  233  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  27.2 
 
 		 1495 aa  229  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  27.3 
 
 		 1487 aa  229  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  25.66 
 
 		 1518 aa  227  9e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  25.61 
 
 		 1602 aa  227  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  26.29 
 
 		 1604 aa  226  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  25.37 
 
 		 1489 aa  224  8e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  25.97 
 
 		 1528 aa  223  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  25.09 
 
 		 1259 aa  222  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  24.92 
 
 		 1586 aa  219  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  25.21 
 
 		 1317 aa  214  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  25.06 
 
 		 1981 aa  214  7.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  26.01 
 
 		 1494 aa  213  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  26.01 
 
 		 1494 aa  213  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  25.85 
 
 		 1429 aa  212  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  26.25 
 
 		 1509 aa  207  8e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  24.61 
 
 		 1319 aa  205  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  24.39 
 
 		 1573 aa  202  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4997  YD repeat-containing protein  28.15 
 
 		 555 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  25.61 
 
 		 1517 aa  198  5.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2525  YD repeat-containing protein  30.6 
 
 		 561 aa  197  7e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.949888 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  23.37 
 
 		 1384 aa  193  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  23.93 
 
 		 1609 aa  189  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  26.13 
 
 		 1495 aa  188  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  24.98 
 
 		 1579 aa  187  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  21.64 
 
 		 2035 aa  184  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  26.16 
 
 		 3027 aa  183  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  25.33 
 
 		 1428 aa  182  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  24.35 
 
 		 1434 aa  182  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2508  YD repeat-containing protein  22.03 
 
 		 1699 aa  179  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0105853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0410  YD repeat-containing protein  23.69 
 
 		 1189 aa  178  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  24.43 
 
 		 1539 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  22.78 
 
 		 1552 aa  174  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  25.12 
 
 		 1541 aa  173  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  25.44 
 
 		 1381 aa  173  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  25.12 
 
 		 1541 aa  173  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  25.12 
 
 		 1541 aa  173  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  22.71 
 
 		 1543 aa  172  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  23.51 
 
 		 1527 aa  172  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  24.39 
 
 		 2149 aa  170  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  22.32 
 
 		 1593 aa  170  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  24.47 
 
 		 1541 aa  169  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  24.71 
 
 		 1541 aa  169  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  24.63 
 
 		 1541 aa  168  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2951  RhsD protein  24.47 
 
 		 1539 aa  168  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4988  YD repeat-containing protein  31.05 
 
 		 480 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  23.47 
 
 		 1352 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  22.87 
 
 		 1466 aa  166  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  22.61 
 
 		 1492 aa  166  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4473  protein rhsA precursor  24.14 
 
 		 1365 aa  165  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>