28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2479 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2479  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  642    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1110  hypothetical protein  32.66 
 
 
445 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1806  hypothetical protein  31.28 
 
 
452 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0095  hypothetical protein  30.77 
 
 
453 aa  99  9e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00145664 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1348  hypothetical protein  34.36 
 
 
390 aa  91.3  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1609  hypothetical protein  32.32 
 
 
369 aa  87.8  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.393788  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0477  hypothetical protein  38.46 
 
 
363 aa  79.7  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0415  hypothetical protein  34.78 
 
 
486 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1339  copper amine oxidase domain protein  38.04 
 
 
450 aa  64.3  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.589788  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0526  copper amine oxidase domain-containing protein  30.58 
 
 
456 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000165573  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0136  hypothetical protein  28.76 
 
 
352 aa  58.9  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0102155  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0361  copper amine oxidase domain protein  31.65 
 
 
549 aa  56.2  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.977127  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2222  hypothetical protein  33.33 
 
 
367 aa  55.8  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0130  copper amine oxidase domain protein  34.48 
 
 
414 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0402  hypothetical protein  30.09 
 
 
349 aa  52  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.723399  normal  0.0419743 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0282  hypothetical protein  33.33 
 
 
368 aa  51.2  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0930  hypothetical protein  27.42 
 
 
357 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0180  hypothetical protein  25.26 
 
 
449 aa  50.1  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.875793  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1109  NHL repeat-containing protein  30.77 
 
 
521 aa  49.7  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.607782  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1004  copper amine oxidase-like  36.26 
 
 
421 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0001699 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1536  hypothetical protein  28.7 
 
 
578 aa  48.9  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0469049  hitchhiker  0.00325028 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1666  hypothetical protein  26.59 
 
 
305 aa  47  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1754  hypothetical protein  29.73 
 
 
341 aa  46.6  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4851  hypothetical protein  30.21 
 
 
580 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0857727  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1753  hypothetical protein  32.56 
 
 
340 aa  45.4  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3609  TPR repeat-containing protein  31.75 
 
 
1338 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2261  Zinc finger, AN1-type  46.81 
 
 
415 aa  43.9  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01835  hypothetical protein  24.66 
 
 
344 aa  43.9  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0670958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>