28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2222 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2222  hypothetical protein  100 
 
 
367 aa  741    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0282  hypothetical protein  37.54 
 
 
368 aa  247  2e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0323  hypothetical protein  40 
 
 
371 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0402  hypothetical protein  33.73 
 
 
349 aa  167  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.723399  normal  0.0419743 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0180  hypothetical protein  34.84 
 
 
449 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.875793  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1753  hypothetical protein  31.85 
 
 
340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1754  hypothetical protein  30.77 
 
 
341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1666  hypothetical protein  36.61 
 
 
305 aa  95.1  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0930  hypothetical protein  34.52 
 
 
357 aa  86.7  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0526  copper amine oxidase domain-containing protein  36.36 
 
 
456 aa  80.1  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000165573  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1806  hypothetical protein  39.66 
 
 
452 aa  77  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1110  hypothetical protein  39.67 
 
 
445 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1109  NHL repeat-containing protein  30.32 
 
 
521 aa  74.3  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.607782  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1339  copper amine oxidase domain protein  39.86 
 
 
450 aa  73.9  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.589788  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0415  hypothetical protein  35.71 
 
 
486 aa  73.6  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0095  hypothetical protein  40.78 
 
 
453 aa  72  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00145664 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2261  Zinc finger, AN1-type  37.14 
 
 
415 aa  65.1  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1348  hypothetical protein  32 
 
 
390 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1609  hypothetical protein  35.79 
 
 
369 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.393788  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0130  copper amine oxidase domain protein  43.96 
 
 
414 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0477  hypothetical protein  29.93 
 
 
363 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0361  copper amine oxidase domain protein  35.34 
 
 
549 aa  57  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.977127  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2479  hypothetical protein  34.74 
 
 
319 aa  56.2  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4851  hypothetical protein  25.53 
 
 
580 aa  51.2  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0857727  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1536  hypothetical protein  34.62 
 
 
578 aa  48.1  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0469049  hitchhiker  0.00325028 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0136  hypothetical protein  36.75 
 
 
352 aa  47.4  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0102155  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1004  copper amine oxidase-like  42.65 
 
 
421 aa  43.5  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0001699 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01835  hypothetical protein  22.29 
 
 
344 aa  42.7  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0670958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>