52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1539 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1539  NHL repeat containing protein  100 
 
 		 267 aa  513  1e-144  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  37.66 
 
 		 392 aa  67  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  22.62 
 
 		 588 aa  64.3  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  22.58 
 
 		 522 aa  61.6  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  26.63 
 
 		 579 aa  60.1  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  28.02 
 
 		 668 aa  58.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  27.32 
 
 		 387 aa  57  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  24.69 
 
 		 1293 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1109  NHL repeat-containing protein  35.37 
 
 		 521 aa  56.2  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.607782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  27.01 
 
 		 1140 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  25.68 
 
 		 676 aa  53.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  31.03 
 
 		 346 aa  53.1  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  25.26 
 
 		 709 aa  53.5  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.62 
 
 		 1292 aa  52.8  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  24.44 
 
 		 307 aa  51.6  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  24.39 
 
 		 752 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  22.91 
 
 		 930 aa  52  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  35.71 
 
 		 1146 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1192  NHL repeat containing protein  32.04 
 
 		 405 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  26.78 
 
 		 831 aa  50.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3058  NHL repeat protein  28.49 
 
 		 404 aa  50.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  27.59 
 
 		 639 aa  51.2  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  25 
 
 		 930 aa  50.4  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 1230 aa  50.4  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  25.29 
 
 		 1163 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6710  NHL repeat containing protein  30.3 
 
 		 692 aa  49.3  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  27.27 
 
 		 1026 aa  49.3  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  33.33 
 
 		 963 aa  48.9  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.01 
 
 		 693 aa  48.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  28.57 
 
 		 361 aa  47.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  24.74 
 
 		 1130 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  31.25 
 
 		 390 aa  47  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0728  serine/threonine protein kinase  28.4 
 
 		 683 aa  47.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  28.87 
 
 		 391 aa  47.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  21.23 
 
 		 491 aa  46.6  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  24.45 
 
 		 627 aa  45.8  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  22.08 
 
 		 892 aa  45.8  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  24.04 
 
 		 1750 aa  45.4  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  24.75 
 
 		 525 aa  45.4  0.0009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  25 
 
 		 1051 aa  45.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  28.42 
 
 		 646 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  30 
 
 		 2831 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  28.66 
 
 		 412 aa  44.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  25.32 
 
 		 343 aa  43.9  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  32.39 
 
 		 373 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  36.99 
 
 		 355 aa  43.1  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  28.99 
 
 		 372 aa  43.5  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  32.32 
 
 		 319 aa  43.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  27.5 
 
 		 326 aa  42.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  26.49 
 
 		 355 aa  42  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  32.22 
 
 		 2296 aa  42  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>