26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0180 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0180  hypothetical protein  100 
 
 
449 aa  904    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.875793  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2222  hypothetical protein  32.13 
 
 
367 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0282  hypothetical protein  32.39 
 
 
368 aa  170  5e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1754  hypothetical protein  36.1 
 
 
341 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1753  hypothetical protein  32.01 
 
 
340 aa  155  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0323  hypothetical protein  31.95 
 
 
371 aa  134  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0402  hypothetical protein  33.74 
 
 
349 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.723399  normal  0.0419743 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0930  hypothetical protein  29.3 
 
 
357 aa  79  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1666  hypothetical protein  29.95 
 
 
305 aa  75.1  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1806  hypothetical protein  29.87 
 
 
452 aa  67.4  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1339  copper amine oxidase domain protein  45.68 
 
 
450 aa  64.3  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.589788  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1110  hypothetical protein  28.89 
 
 
445 aa  61.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0095  hypothetical protein  27.89 
 
 
453 aa  61.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00145664 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1109  NHL repeat-containing protein  30.82 
 
 
521 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.607782  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1348  hypothetical protein  41.56 
 
 
390 aa  57  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0477  hypothetical protein  26.35 
 
 
363 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0526  copper amine oxidase domain-containing protein  30.63 
 
 
456 aa  55.5  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000165573  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1609  hypothetical protein  38.37 
 
 
369 aa  55.1  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.393788  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2261  Zinc finger, AN1-type  28.92 
 
 
415 aa  54.7  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0130  copper amine oxidase domain protein  40.54 
 
 
414 aa  54.3  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2479  hypothetical protein  26.04 
 
 
319 aa  50.1  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0415  hypothetical protein  31.06 
 
 
486 aa  50.1  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0136  hypothetical protein  32.26 
 
 
352 aa  47  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0102155  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0361  copper amine oxidase domain protein  35.71 
 
 
549 aa  46.6  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.977127  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02460  hypothetical protein  39.06 
 
 
633 aa  43.5  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1004  copper amine oxidase-like  44.26 
 
 
421 aa  43.5  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0001699 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>