27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1753 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1753  hypothetical protein  100 
 
 
340 aa  700    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1754  hypothetical protein  46.9 
 
 
341 aa  298  6e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0180  hypothetical protein  32.57 
 
 
449 aa  151  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.875793  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0282  hypothetical protein  28.49 
 
 
368 aa  138  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2222  hypothetical protein  31.85 
 
 
367 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0323  hypothetical protein  31.51 
 
 
371 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0402  hypothetical protein  35.5 
 
 
349 aa  120  3e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.723399  normal  0.0419743 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0930  hypothetical protein  30.83 
 
 
357 aa  72.8  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0526  copper amine oxidase domain-containing protein  30.82 
 
 
456 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000165573  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0477  hypothetical protein  34.03 
 
 
363 aa  69.7  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1666  hypothetical protein  36.61 
 
 
305 aa  68.9  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1806  hypothetical protein  33.07 
 
 
452 aa  62.8  0.000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1339  copper amine oxidase domain protein  37.61 
 
 
450 aa  61.6  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.589788  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1110  hypothetical protein  38.1 
 
 
445 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2261  Zinc finger, AN1-type  43.01 
 
 
415 aa  57.8  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0415  hypothetical protein  26.79 
 
 
486 aa  56.6  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0095  hypothetical protein  35.85 
 
 
453 aa  56.2  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00145664 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1609  hypothetical protein  32.63 
 
 
369 aa  55.8  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.393788  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1348  hypothetical protein  35.53 
 
 
390 aa  52.4  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0130  copper amine oxidase domain protein  35.21 
 
 
414 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4851  hypothetical protein  24.7 
 
 
580 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0857727  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0361  copper amine oxidase domain protein  29.84 
 
 
549 aa  48.5  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.977127  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0136  hypothetical protein  28.41 
 
 
352 aa  46.2  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0102155  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2479  hypothetical protein  32.56 
 
 
319 aa  45.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1451  hypothetical protein  28.57 
 
 
372 aa  43.9  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1109  NHL repeat-containing protein  23.83 
 
 
521 aa  43.1  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.607782  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03695  hypothetical protein  34.85 
 
 
316 aa  42.7  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>