34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0136 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0136  hypothetical protein  100 
 
 
352 aa  723    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0102155  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1110  hypothetical protein  38.37 
 
 
445 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0095  hypothetical protein  40.12 
 
 
453 aa  107  4e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00145664 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1806  hypothetical protein  37.79 
 
 
452 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0477  hypothetical protein  37.43 
 
 
363 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0526  copper amine oxidase domain-containing protein  35.63 
 
 
456 aa  102  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000165573  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0415  hypothetical protein  40.58 
 
 
486 aa  95.9  9e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1348  hypothetical protein  31.05 
 
 
390 aa  91.3  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1609  hypothetical protein  36.62 
 
 
369 aa  87.4  4e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.393788  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1004  copper amine oxidase-like  37.96 
 
 
421 aa  84.3  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0001699 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0361  copper amine oxidase domain protein  36.22 
 
 
549 aa  77.8  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.977127  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1339  copper amine oxidase domain protein  38.97 
 
 
450 aa  77  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.589788  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0130  copper amine oxidase domain protein  36.51 
 
 
414 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2479  hypothetical protein  31.18 
 
 
319 aa  69.3  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0930  hypothetical protein  24.28 
 
 
357 aa  59.7  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2222  hypothetical protein  36.75 
 
 
367 aa  58.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1666  hypothetical protein  27.87 
 
 
305 aa  57.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1536  hypothetical protein  28.82 
 
 
578 aa  57.4  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0469049  hitchhiker  0.00325028 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0180  hypothetical protein  32.26 
 
 
449 aa  55.8  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.875793  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1753  hypothetical protein  32.74 
 
 
340 aa  54.7  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1168  hypothetical protein  50 
 
 
194 aa  52.8  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4851  hypothetical protein  26.32 
 
 
580 aa  48.9  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0857727  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0402  hypothetical protein  33.63 
 
 
349 aa  48.9  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.723399  normal  0.0419743 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2917  hypothetical protein  34.71 
 
 
527 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178577 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1754  hypothetical protein  27.34 
 
 
341 aa  47  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0282  hypothetical protein  26.64 
 
 
368 aa  46.6  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0010  hypothetical protein  44.12 
 
 
1503 aa  44.7  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.969118  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4478  hypothetical protein  32.08 
 
 
355 aa  43.5  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2112  Sulfate adenylyltransferase, small subunit  32.61 
 
 
241 aa  43.5  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.900528  normal  0.825144 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1948  tcaA protein  56.52 
 
 
462 aa  43.1  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0137  hypothetical protein  33.33 
 
 
189 aa  43.5  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0652241  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0323  hypothetical protein  27.27 
 
 
371 aa  43.1  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7156  hypothetical protein  35.29 
 
 
251 aa  42.7  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2261  Zinc finger, AN1-type  40.48 
 
 
415 aa  42.7  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>