34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0477 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0477  hypothetical protein  100 
 
 
363 aa  743    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0415  hypothetical protein  39.74 
 
 
486 aa  237  2e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0526  copper amine oxidase domain-containing protein  36.96 
 
 
456 aa  196  7e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000165573  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0095  hypothetical protein  36.09 
 
 
453 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00145664 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1110  hypothetical protein  36.98 
 
 
445 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1806  hypothetical protein  35.55 
 
 
452 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1348  hypothetical protein  34.19 
 
 
390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1609  hypothetical protein  36 
 
 
369 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.393788  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1339  copper amine oxidase domain protein  37.65 
 
 
450 aa  97.8  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.589788  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0136  hypothetical protein  37.43 
 
 
352 aa  95.5  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0102155  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1004  copper amine oxidase-like  35.33 
 
 
421 aa  87.8  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0001699 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0361  copper amine oxidase domain protein  28.51 
 
 
549 aa  82.4  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.977127  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2479  hypothetical protein  47.56 
 
 
319 aa  79.3  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0130  copper amine oxidase domain protein  32.89 
 
 
414 aa  73.2  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1753  hypothetical protein  34.03 
 
 
340 aa  70.1  0.00000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1536  hypothetical protein  30.07 
 
 
578 aa  68.9  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0469049  hitchhiker  0.00325028 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2261  Zinc finger, AN1-type  41.12 
 
 
415 aa  65.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0282  hypothetical protein  25.65 
 
 
368 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0930  hypothetical protein  35.05 
 
 
357 aa  63.5  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2222  hypothetical protein  29.33 
 
 
367 aa  61.6  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0402  hypothetical protein  24.07 
 
 
349 aa  61.2  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.723399  normal  0.0419743 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1451  hypothetical protein  31.62 
 
 
372 aa  57  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01835  hypothetical protein  24.65 
 
 
344 aa  56.6  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0670958  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1666  hypothetical protein  34.04 
 
 
305 aa  55.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0180  hypothetical protein  26.35 
 
 
449 aa  55.5  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.875793  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4851  hypothetical protein  26.29 
 
 
580 aa  53.5  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0857727  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1754  hypothetical protein  24.42 
 
 
341 aa  53.5  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0323  hypothetical protein  28.99 
 
 
371 aa  50.8  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3827  hypothetical protein  29.27 
 
 
309 aa  47.8  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.344263  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1109  NHL repeat-containing protein  25 
 
 
521 aa  47  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.607782  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1347  periplasmic protein  36.23 
 
 
219 aa  45.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2917  hypothetical protein  35.94 
 
 
527 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178577 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4478  hypothetical protein  29.81 
 
 
355 aa  43.1  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  39.62 
 
 
1230 aa  42.7  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>