12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4478 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4478  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  735    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03695  hypothetical protein  31.8 
 
 		 316 aa  180  4e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3827  hypothetical protein  32.35 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.344263  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1339  copper amine oxidase domain protein  28.34 
 
 		 450 aa  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.589788  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0095  hypothetical protein  35.42 
 
 		 453 aa  49.3  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00145664 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0415  hypothetical protein  30.56 
 
 		 486 aa  48.1  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1806  hypothetical protein  40.54 
 
 		 452 aa  46.2  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1110  hypothetical protein  35 
 
 		 445 aa  46.2  0.0009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4851  hypothetical protein  30.95 
 
 		 580 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0857727  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1754  hypothetical protein  34.78 
 
 		 341 aa  45.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0477  hypothetical protein  29.81 
 
 		 363 aa  42.7  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0323  hypothetical protein  33.67 
 
 		 371 aa  42.7  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>