24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0930 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0930  hypothetical protein  100 
 
 
357 aa  733    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1666  hypothetical protein  42.91 
 
 
305 aa  181  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2261  Zinc finger, AN1-type  42.05 
 
 
415 aa  145  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0402  hypothetical protein  33.51 
 
 
349 aa  95.9  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.723399  normal  0.0419743 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0282  hypothetical protein  31.75 
 
 
368 aa  94.4  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2222  hypothetical protein  34.52 
 
 
367 aa  86.7  6e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0180  hypothetical protein  29.3 
 
 
449 aa  79  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.875793  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0526  copper amine oxidase domain-containing protein  31.25 
 
 
456 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000165573  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1753  hypothetical protein  30.83 
 
 
340 aa  72.8  0.000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1110  hypothetical protein  31.61 
 
 
445 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0415  hypothetical protein  33.58 
 
 
486 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0095  hypothetical protein  30.56 
 
 
453 aa  66.6  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00145664 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0323  hypothetical protein  31.55 
 
 
371 aa  63.9  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0477  hypothetical protein  35.05 
 
 
363 aa  63.9  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1806  hypothetical protein  34.95 
 
 
452 aa  62.8  0.000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1754  hypothetical protein  25.11 
 
 
341 aa  62.8  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1339  copper amine oxidase domain protein  39.25 
 
 
450 aa  62  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.589788  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1348  hypothetical protein  29.93 
 
 
390 aa  54.3  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0130  copper amine oxidase domain protein  35.66 
 
 
414 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1609  hypothetical protein  41.46 
 
 
369 aa  52.8  0.000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.393788  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2479  hypothetical protein  27.42 
 
 
319 aa  51.6  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1109  NHL repeat-containing protein  28.47 
 
 
521 aa  50.8  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.607782  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0136  hypothetical protein  24.28 
 
 
352 aa  47  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0102155  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3827  hypothetical protein  27.86 
 
 
309 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.344263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>