105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1347 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1347  periplasmic protein  100 
 
 
219 aa  450  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0472  hypothetical protein  50 
 
 
235 aa  210  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4322  hypothetical protein  50 
 
 
235 aa  207  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3596  hypothetical protein  50.82 
 
 
236 aa  206  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4144  hypothetical protein  49.53 
 
 
236 aa  205  4e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0112437  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0363  hypothetical protein  50 
 
 
235 aa  205  5e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.82719  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3647  hypothetical protein  49.77 
 
 
235 aa  204  8e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2827  periplasmic protein-like protein  53.18 
 
 
229 aa  204  8e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.789091  normal  0.0661968 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0379  hypothetical protein  49.77 
 
 
235 aa  204  9e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.481978  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0377  hypothetical protein  49.77 
 
 
235 aa  204  9e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.560354  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0161  hypothetical protein  49.75 
 
 
220 aa  203  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0379  hypothetical protein  49.04 
 
 
237 aa  203  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45920  hypothetical protein  55.56 
 
 
237 aa  202  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3263  hypothetical protein  49.53 
 
 
235 aa  202  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.310609  normal  0.453663 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0308  hypothetical protein  49.04 
 
 
235 aa  203  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0293189  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3895  hypothetical protein  55 
 
 
237 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.762236  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2112  Sulfate adenylyltransferase, small subunit  48.7 
 
 
241 aa  199  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.900528  normal  0.825144 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0209  hypothetical protein  50 
 
 
214 aa  198  5e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1218  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  56.02 
 
 
229 aa  197  7e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4009  hypothetical protein  51.93 
 
 
235 aa  197  9e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3987  hypothetical protein  51.93 
 
 
235 aa  197  9e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4103  hypothetical protein  51.93 
 
 
235 aa  197  9e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.898046  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3910  hypothetical protein  51.93 
 
 
235 aa  197  9e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1080  periplasmic protein  47.26 
 
 
215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3057  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  55.42 
 
 
229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1809  periplasmic protein-like protein  56.02 
 
 
226 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001010  hypothetical protein  47.14 
 
 
227 aa  193  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07088  hypothetical protein  45.97 
 
 
227 aa  193  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0183  hypothetical protein  50.88 
 
 
253 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.1074 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0164  hypothetical protein  50.88 
 
 
213 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000051589 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0182  hypothetical protein  50.88 
 
 
230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.234882  normal  0.614975 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02470  periplasmic protein  46.33 
 
 
242 aa  186  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.72664  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1448  hypothetical protein  47.54 
 
 
228 aa  186  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5065  hypothetical protein  49.12 
 
 
251 aa  184  9e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.333704  normal  0.503778 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0890  hypothetical protein  44.78 
 
 
244 aa  182  5.0000000000000004e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0859  hypothetical protein  44.78 
 
 
244 aa  182  5.0000000000000004e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0431  hypothetical protein  49.71 
 
 
216 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0130  hypothetical protein  44.81 
 
 
251 aa  179  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0309  hypothetical protein  47.87 
 
 
231 aa  172  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0161  periplasmic protein  47.46 
 
 
221 aa  171  5.999999999999999e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.494989  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1372  hypothetical protein  42.35 
 
 
200 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0791  periplasmic protein  42.57 
 
 
213 aa  168  5e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000013365  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0889  periplasmic protein  40.87 
 
 
219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0471962  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1308  transglutaminase domain protein  41.44 
 
 
243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.809484  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3763  hypothetical protein  44.75 
 
 
230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3353  hypothetical protein  45.45 
 
 
224 aa  161  6e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.526541 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2096  hypothetical protein  49.21 
 
 
245 aa  155  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2663  hypothetical protein  37.1 
 
 
253 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.918683  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1879  hypothetical protein  51.02 
 
 
238 aa  142  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0643403 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1153  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  46.22 
 
 
330 aa  104  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1558  hypothetical protein  40.14 
 
 
203 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111516  normal  0.164142 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1420  hypothetical protein  37.32 
 
 
394 aa  95.5  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.548403  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0003  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  39.71 
 
 
329 aa  91.3  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11115  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0168  hypothetical protein  33.52 
 
 
208 aa  87.4  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00332877  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1158  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  40 
 
 
430 aa  85.9  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0287549 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1975  hypothetical protein  36.81 
 
 
406 aa  82  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.495543  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2758  periplasmic protein-like protein  28.36 
 
 
346 aa  81.3  0.000000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202545  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2233  hypothetical protein  32.28 
 
 
228 aa  81.6  0.000000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0566  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  36.76 
 
 
241 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0895  OmpA/MotB  39.47 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000873981  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2244  hypothetical protein  32 
 
 
328 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.419307  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1230  periplasmic protein-like protein  29.19 
 
 
225 aa  62.8  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0301279 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1029  hypothetical protein  38.14 
 
 
184 aa  59.3  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.487081  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0970  hypothetical protein  38.14 
 
 
184 aa  59.3  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7156  hypothetical protein  38.46 
 
 
251 aa  58.9  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0872  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  38.83 
 
 
207 aa  58.5  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.663458  normal  0.0975549 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1351  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  36.44 
 
 
194 aa  56.6  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0957  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  34.23 
 
 
212 aa  54.3  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00236078 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4265  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  29.93 
 
 
199 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4530  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  29.93 
 
 
199 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0778  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  27.74 
 
 
206 aa  52  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0197  hypothetical protein  32.31 
 
 
171 aa  52  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0625026  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2257  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  35.71 
 
 
219 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0430695 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2532  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  35.71 
 
 
219 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1934  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  32.99 
 
 
202 aa  50.1  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1819  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  36.63 
 
 
224 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2049  hypothetical protein  30.37 
 
 
206 aa  49.3  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0218162  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1259  hypothetical protein  35.05 
 
 
201 aa  48.9  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.344293  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2133  hypothetical protein  30.37 
 
 
206 aa  48.9  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1168  hypothetical protein  24.46 
 
 
194 aa  48.9  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1220  hypothetical protein  35.05 
 
 
201 aa  48.5  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1928  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  35.64 
 
 
222 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.673609  normal  0.891038 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2407  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  35.19 
 
 
215 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2214  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  35.42 
 
 
217 aa  47  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.405768 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2204  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  35.64 
 
 
222 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0686  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  33.33 
 
 
204 aa  46.6  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.463723  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4260  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  33.67 
 
 
213 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2406  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  35.54 
 
 
230 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0656579 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3279  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  33.66 
 
 
207 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.824885  normal  0.012285 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0477  hypothetical protein  36.23 
 
 
363 aa  45.1  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2146  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  34.38 
 
 
206 aa  45.1  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2256  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  34.65 
 
 
234 aa  44.3  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.0631375 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3777  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  33.33 
 
 
235 aa  44.3  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2213  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  34.65 
 
 
233 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2531  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  34.65 
 
 
234 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4770  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  31.58 
 
 
213 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1964  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  34.65 
 
 
196 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491162  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2806  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  33.33 
 
 
215 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0454  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  33.03 
 
 
222 aa  43.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.418217  normal  0.164398 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2379  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  32.67 
 
 
191 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.906047  normal  0.296217 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>