52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02460 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02460  hypothetical protein  100 
 
 		 633 aa  1306    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0727  transglutaminase domain protein  23.79 
 
 		 1225 aa  100  6e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0519  hypothetical protein  24.81 
 
 		 1433 aa  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0514  transglutaminase domain protein  24.16 
 
 		 1431 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.227327  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1597  hypothetical protein  21.51 
 
 		 1042 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.229285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3469  hypothetical protein  23.74 
 
 		 634 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0486  hypothetical protein  23.59 
 
 		 1433 aa  80.5  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175307  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  23.23 
 
 		 1096 aa  79  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2363  hypothetical protein  21.01 
 
 		 1028 aa  78.6  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.429657 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2424  hypothetical protein  22.91 
 
 		 753 aa  76.6  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.415243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2939  putative transmembrane protein  23.19 
 
 		 639 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.494843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5291  hypothetical protein  23.5 
 
 		 634 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3553  hypothetical protein  24.44 
 
 		 672 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3320  hypothetical protein  24.93 
 
 		 616 aa  74.3  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1228  transglutaminase domain protein  27.92 
 
 		 1257 aa  73.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.435864 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3557  hypothetical protein  22.87 
 
 		 638 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.406534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2967  hypothetical protein  30.92 
 
 		 673 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.386459 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0134  hypothetical protein  33.63 
 
 		 667 aa  72  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0021689  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3609  TPR repeat-containing protein  28.22 
 
 		 1338 aa  72  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0363  hypothetical protein  23.55 
 
 		 633 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3831  hypothetical protein  30.46 
 
 		 672 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2330  hypothetical protein  30.88 
 
 		 898 aa  71.2  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.630984  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2901  hypothetical protein  25.73 
 
 		 658 aa  71.2  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4359  hypothetical protein  23.17 
 
 		 633 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3963  hypothetical protein  22.63 
 
 		 638 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.333433  normal  0.0412099 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0539  hypothetical protein  23.43 
 
 		 664 aa  68.9  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.330242  normal  0.22108 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0838  hypothetical protein  32.14 
 
 		 704 aa  67.8  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.827538  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5703  transglutaminase domain protein  29.79 
 
 		 856 aa  66.6  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.411569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1801  putative transmembrane protein  21.88 
 
 		 632 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360897  normal  0.364515 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1568  hypothetical protein  30.09 
 
 		 673 aa  64.3  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1538  putative transmembrane protein  23.68 
 
 		 637 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2566  hypothetical protein  22.17 
 
 		 635 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.84597  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2485  hypothetical protein  29.84 
 
 		 647 aa  62  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1934  hypothetical protein  23.83 
 
 		 647 aa  61.6  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.279143  normal  0.581278 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5118  hypothetical protein  21.62 
 
 		 641 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303321  normal  0.0401569 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3645  transglutaminase-like enzyme; cysteine protease  23.6 
 
 		 659 aa  59.7  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0857  hypothetical protein  31.07 
 
 		 684 aa  60.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.121274 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38080  hypothetical protein  33.86 
 
 		 624 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435463 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01039  hypothetical protein  29.25 
 
 		 637 aa  58.9  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.503003  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06127  hypothetical protein  29.25 
 
 		 637 aa  58.9  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.343201  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3243  hypothetical protein  33.07 
 
 		 624 aa  57.4  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.379789  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4803  hypothetical protein  36.05 
 
 		 342 aa  56.2  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.984795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0794  hypothetical protein  25.56 
 
 		 636 aa  56.2  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110832  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0828  hypothetical protein  26.29 
 
 		 840 aa  55.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0705  hypothetical protein  24.81 
 
 		 636 aa  54.3  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.1 
 
 		 1256 aa  51.6  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690261  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0248  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.1 
 
 		 1256 aa  52  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0237  tetratricopeptide protein  38.1 
 
 		 1256 aa  52  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21980  hypothetical protein  23.12 
 
 		 667 aa  48.9  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4000  transglutaminase domain protein  21.59 
 
 		 642 aa  48.9  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000741085  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0259  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 1253 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0180  hypothetical protein  39.06 
 
 		 449 aa  43.9  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.875793  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>