58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1940 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4414  hypothetical protein  77.92 
 
 
653 aa  732    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.455569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1940  hypothetical protein  100 
 
 
660 aa  1337    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5986  hypothetical protein  34.14 
 
 
452 aa  230  7e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0465431  normal  0.123001 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0372  hypothetical protein  28.53 
 
 
412 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0923  hypothetical protein  27.86 
 
 
403 aa  117  6.9999999999999995e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2637  hypothetical protein  29 
 
 
385 aa  113  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.836054  normal  0.333709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2834  hypothetical protein  30.65 
 
 
385 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0170998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3650  hypothetical protein  28.35 
 
 
428 aa  110  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3599  hypothetical protein  27.38 
 
 
385 aa  105  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4371  hypothetical protein  27.34 
 
 
383 aa  101  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4647  hypothetical protein  28.77 
 
 
375 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4735  hypothetical protein  28.77 
 
 
375 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385545  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5030  hypothetical protein  28.77 
 
 
375 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1529  hypothetical protein  28.77 
 
 
375 aa  97.8  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5229  hypothetical protein  28.77 
 
 
387 aa  96.7  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340919  normal  0.127707 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13564  hypothetical protein  27.55 
 
 
375 aa  95.5  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000573619 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1532  hypothetical protein  27.16 
 
 
370 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429844  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0338  hypothetical protein  25.07 
 
 
395 aa  82.4  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106434  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2756  hypothetical protein  31.82 
 
 
392 aa  79.3  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00358504  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5494  hypothetical protein  26.77 
 
 
369 aa  77.8  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542935  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3292  hypothetical protein  24.09 
 
 
362 aa  77.4  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0353  hypothetical protein  24.78 
 
 
390 aa  76.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760546  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0308  hypothetical protein  34.06 
 
 
410 aa  74.7  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.533164  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4829  hypothetical protein  33.33 
 
 
397 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160841  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2496  hypothetical protein  26.14 
 
 
403 aa  70.9  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4073  hypothetical protein  27.33 
 
 
341 aa  67  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.232287  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1875  hypothetical protein  25.16 
 
 
402 aa  65.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2269  hypothetical protein  25.57 
 
 
355 aa  64.7  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  35.53 
 
 
2305 aa  63.9  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3773  hypothetical protein  24.45 
 
 
361 aa  63.9  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00454208  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4400  hypothetical protein  28.26 
 
 
414 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926858  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3641  hypothetical protein  24.24 
 
 
372 aa  62.4  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.817145  normal  0.492356 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1895  hypothetical protein  29.29 
 
 
402 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332737  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1941  hypothetical protein  29.29 
 
 
402 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  34.12 
 
 
2310 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4077  peptidase S15  31.94 
 
 
854 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122952  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1067  peptidase S15  33.58 
 
 
775 aa  57  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4994  hypothetical protein  32.65 
 
 
557 aa  57  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449903  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2699  hypothetical protein  36.9 
 
 
361 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.949827 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2669  hypothetical protein  36.9 
 
 
360 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2714  hypothetical protein  36.9 
 
 
360 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.361474  normal  0.0368583 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1994  hypothetical protein  33.33 
 
 
746 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3641  hypothetical protein  22.52 
 
 
410 aa  53.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421002  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3594  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.48 
 
 
1056 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207597  normal  0.593254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5180  hypothetical protein  45.45 
 
 
692 aa  52  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.357825 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1041  peptidase S15  30.5 
 
 
778 aa  51.2  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5057  hypothetical protein  29.07 
 
 
3378 aa  50.4  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2538  peptidase S15  30.59 
 
 
887 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3737  hypothetical protein  20.68 
 
 
357 aa  46.6  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1962  hypothetical protein  27.59 
 
 
370 aa  47  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.555214  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2913  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.97 
 
 
1067 aa  45.8  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511883  normal  0.352036 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4744  putative outer membrane adhesin like protein  70.97 
 
 
666 aa  45.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511214  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4383  hypothetical protein  32.22 
 
 
370 aa  44.7  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5061  hypothetical protein  54.55 
 
 
284 aa  44.7  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  52.63 
 
 
999 aa  44.7  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  52.63 
 
 
999 aa  44.7  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  52.63 
 
 
999 aa  44.7  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1722  glycoside hydrolase family protein  37.23 
 
 
934 aa  43.9  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.594892  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>