42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0923 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0923  hypothetical protein  100 
 
 
403 aa  823    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2756  hypothetical protein  57.54 
 
 
392 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00358504  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4647  hypothetical protein  56.44 
 
 
375 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4735  hypothetical protein  56.44 
 
 
375 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385545  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5229  hypothetical protein  55.67 
 
 
387 aa  437  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340919  normal  0.127707 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1529  hypothetical protein  55.81 
 
 
375 aa  433  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5030  hypothetical protein  56.19 
 
 
375 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13564  hypothetical protein  54.64 
 
 
375 aa  431  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000573619 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2637  hypothetical protein  57.99 
 
 
385 aa  422  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.836054  normal  0.333709 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3599  hypothetical protein  57.36 
 
 
385 aa  423  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4829  hypothetical protein  55.21 
 
 
397 aa  422  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160841  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2834  hypothetical protein  56.96 
 
 
385 aa  418  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0170998 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4371  hypothetical protein  47.97 
 
 
383 aa  355  7.999999999999999e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3292  hypothetical protein  27.98 
 
 
362 aa  140  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5986  hypothetical protein  30.66 
 
 
452 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0465431  normal  0.123001 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1532  hypothetical protein  30.65 
 
 
370 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429844  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0353  hypothetical protein  30.52 
 
 
390 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760546  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0372  hypothetical protein  31.51 
 
 
412 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4414  hypothetical protein  28.99 
 
 
653 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.455569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1940  hypothetical protein  27.86 
 
 
660 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3641  hypothetical protein  26.69 
 
 
372 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.817145  normal  0.492356 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5494  hypothetical protein  29.19 
 
 
369 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542935  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0308  hypothetical protein  33.59 
 
 
410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.533164  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3650  hypothetical protein  29.72 
 
 
428 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2699  hypothetical protein  27.51 
 
 
361 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.949827 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2669  hypothetical protein  27.79 
 
 
360 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2714  hypothetical protein  27.79 
 
 
360 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.361474  normal  0.0368583 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3773  hypothetical protein  23.71 
 
 
361 aa  102  9e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00454208  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0338  hypothetical protein  27.55 
 
 
395 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106434  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2496  hypothetical protein  27.09 
 
 
403 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4400  hypothetical protein  26.83 
 
 
414 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926858  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3737  hypothetical protein  23.15 
 
 
357 aa  91.3  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2269  hypothetical protein  26.77 
 
 
355 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4073  hypothetical protein  25.31 
 
 
341 aa  89  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.232287  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1875  hypothetical protein  25.08 
 
 
402 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1895  hypothetical protein  24.76 
 
 
402 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332737  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1941  hypothetical protein  24.76 
 
 
402 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2231  hypothetical protein  25.85 
 
 
384 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142964  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4114  hypothetical protein  26.98 
 
 
382 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.488486  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3641  hypothetical protein  21.87 
 
 
410 aa  68.2  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421002  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3302  hypothetical protein  26.85 
 
 
405 aa  59.7  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4383  hypothetical protein  23.65 
 
 
370 aa  44.3  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>